Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401H155

Protein Details
Accession A0A401H155    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-244KHADTKSKSKGKDKDKKKKGKCAFCGYTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-236TKSKSKGKDKDKKKKGK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 5.666, cyto 5.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSLYPPISQASSKAESKRLYDVPFLESNGGNFQTWKYRTTTILRLRGLYSLIDGTEADPRTVDTMKKAEWDVRNNEALAQITLTLKDEPLNGVMYSMTAQDAWEKLNRRYEGRGKQTLAYLISDLFRSTLSDESPLEPQLNTMQQKAHILETLRLMLDDTLIAIAMAISLPPSYSTLRTILMASDSKLTVEKVVNEVLSEEKRRGETTAASALIAKHADTKSKSKGKDKDKKKKGKCAFCGYTGHTKDECRKFKASQVEGATAKGDKKAEKAADAKESAKIASVQCR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.44
4 0.48
5 0.47
6 0.45
7 0.45
8 0.42
9 0.41
10 0.4
11 0.38
12 0.33
13 0.28
14 0.26
15 0.25
16 0.24
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.32
26 0.38
27 0.46
28 0.46
29 0.53
30 0.52
31 0.5
32 0.48
33 0.45
34 0.4
35 0.3
36 0.23
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.19
52 0.19
53 0.22
54 0.23
55 0.28
56 0.32
57 0.38
58 0.39
59 0.4
60 0.41
61 0.38
62 0.37
63 0.31
64 0.26
65 0.19
66 0.14
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.12
91 0.15
92 0.19
93 0.26
94 0.28
95 0.29
96 0.35
97 0.43
98 0.47
99 0.52
100 0.54
101 0.48
102 0.48
103 0.46
104 0.42
105 0.34
106 0.25
107 0.18
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.16
133 0.17
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.03
159 0.05
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.19
195 0.23
196 0.21
197 0.19
198 0.2
199 0.18
200 0.18
201 0.16
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.2
206 0.23
207 0.29
208 0.37
209 0.44
210 0.5
211 0.53
212 0.62
213 0.68
214 0.74
215 0.79
216 0.81
217 0.85
218 0.9
219 0.9
220 0.92
221 0.91
222 0.92
223 0.89
224 0.88
225 0.82
226 0.76
227 0.71
228 0.65
229 0.65
230 0.57
231 0.53
232 0.45
233 0.45
234 0.5
235 0.55
236 0.57
237 0.52
238 0.55
239 0.53
240 0.58
241 0.63
242 0.57
243 0.55
244 0.53
245 0.53
246 0.48
247 0.47
248 0.41
249 0.33
250 0.31
251 0.27
252 0.26
253 0.22
254 0.25
255 0.32
256 0.33
257 0.37
258 0.42
259 0.43
260 0.46
261 0.48
262 0.45
263 0.41
264 0.39
265 0.33
266 0.3
267 0.28