FuNGI

A0A401GHS0

Protein Details

Accession

A0A401GHS0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
387-408	QGNGKGKPRKANSPFRRIKPET	Hydrophilic
440-467	IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITSH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
391-403	KGKPRKANSPFRR
446-457	GFRKEKNKKKRG

Subcellular Location(s)

cyto 15, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 8.833, nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAVESSKKTGSVTVDGSLASIYGLVYSFLAKHSHTKAAEAVKKAARDVVVLKADVAPAGPFLEDIVKQWKILSKKQTKKLTLDSASDSSDNSSSDSDSDSSADASGSSSSEDEGKKISKTITAKEPTAAAKVTSRPATSPPRSSKTILSQDGDIEDDDSDDDTDSQSPDATLKAKKVENSAGPQANKKLESSDEDSSNEESGEDSSSDDDETEKEVVKKSAKKISKGSDESSSSDEEGEKVAKHSAQKAVAVKQALKKTKGNRSDSSEEESSSDGTSSSDSDSSDSDSSSAATTKKPLSKLVKTPKTLAKVAAAPTAEPVVADVDVDVKAIKKRRISESGAAFSSATASTARQEDEAVSKASDRTKTGARVPVNGNAQNANANGNGQGNGKGKPRKANSPFRRIKPETVHFHDQRLANNGFDARGAGAGDYGERAARDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITSHSIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.23
4	0.19
5	0.14
6	0.09
7	0.07
8	0.05
9	0.05
10	0.05
11	0.05
12	0.06
13	0.07
14	0.07
15	0.09
16	0.12
17	0.13
18	0.2
19	0.24
20	0.31
21	0.31
22	0.33
23	0.37
24	0.45
25	0.49
26	0.46
27	0.49
28	0.45
29	0.46
30	0.45
31	0.42
32	0.33
33	0.29
34	0.28
35	0.28
36	0.27
37	0.26
38	0.26
39	0.24
40	0.23
41	0.2
42	0.18
43	0.11
44	0.08
45	0.09
46	0.08
47	0.06
48	0.07
49	0.1
50	0.1
51	0.12
52	0.18
53	0.18
54	0.18
55	0.2
56	0.25
57	0.28
58	0.36
59	0.44
60	0.49
61	0.58
62	0.67
63	0.76
64	0.76
65	0.77
66	0.78
67	0.77
68	0.71
69	0.64
70	0.6
71	0.52
72	0.48
73	0.41
74	0.33
75	0.25
76	0.22
77	0.19
78	0.15
79	0.13
80	0.12
81	0.12
82	0.14
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.15
101	0.17
102	0.17
103	0.19
104	0.19
105	0.21
106	0.24
107	0.28
108	0.35
109	0.37
110	0.37
111	0.36
112	0.38
113	0.33
114	0.32
115	0.27
116	0.19
117	0.18
118	0.2
119	0.24
120	0.24
121	0.23
122	0.22
123	0.28
124	0.36
125	0.38
126	0.44
127	0.47
128	0.5
129	0.53
130	0.54
131	0.52
132	0.51
133	0.54
134	0.49
135	0.43
136	0.39
137	0.36
138	0.34
139	0.3
140	0.21
141	0.13
142	0.09
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.11
158	0.12
159	0.14
160	0.19
161	0.21
162	0.23
163	0.26
164	0.29
165	0.3
166	0.32
167	0.37
168	0.37
169	0.36
170	0.37
171	0.37
172	0.35
173	0.32
174	0.28
175	0.23
176	0.19
177	0.23
178	0.25
179	0.24
180	0.23
181	0.23
182	0.25
183	0.24
184	0.22
185	0.18
186	0.12
187	0.1
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.1
202	0.11
203	0.14
204	0.19
205	0.24
206	0.27
207	0.35
208	0.37
209	0.41
210	0.46
211	0.49
212	0.53
213	0.51
214	0.49
215	0.45
216	0.43
217	0.4
218	0.35
219	0.29
220	0.21
221	0.18
222	0.15
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.11
231	0.14
232	0.17
233	0.17
234	0.2
235	0.22
236	0.24
237	0.25
238	0.25
239	0.25
240	0.26
241	0.32
242	0.33
243	0.34
244	0.36
245	0.41
246	0.49
247	0.55
248	0.56
249	0.53
250	0.56
251	0.57
252	0.54
253	0.52
254	0.44
255	0.36
256	0.3
257	0.27
258	0.2
259	0.15
260	0.13
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.12
281	0.16
282	0.21
283	0.22
284	0.29
285	0.35
286	0.4
287	0.49
288	0.57
289	0.61
290	0.59
291	0.63
292	0.61
293	0.59
294	0.54
295	0.46
296	0.38
297	0.33
298	0.32
299	0.3
300	0.24
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.14
305	0.1
306	0.09
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.12
317	0.18
318	0.23
319	0.27
320	0.32
321	0.4
322	0.46
323	0.5
324	0.53
325	0.54
326	0.54
327	0.49
328	0.44
329	0.37
330	0.3
331	0.25
332	0.18
333	0.11
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.11
338	0.12
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.14
343	0.16
344	0.15
345	0.14
346	0.14
347	0.17
348	0.21
349	0.22
350	0.21
351	0.22
352	0.26
353	0.3
354	0.35
355	0.41
356	0.38
357	0.41
358	0.42
359	0.46
360	0.47
361	0.45
362	0.4
363	0.34
364	0.33
365	0.29
366	0.26
367	0.21
368	0.15
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.12
374	0.18
375	0.18
376	0.22
377	0.3
378	0.35
379	0.38
380	0.47
381	0.51
382	0.56
383	0.63
384	0.71
385	0.73
386	0.77
387	0.82
388	0.8
389	0.85
390	0.79
391	0.78
392	0.77
393	0.76
394	0.74
395	0.73
396	0.76
397	0.67
398	0.66
399	0.63
400	0.56
401	0.5
402	0.48
403	0.42
404	0.32
405	0.33
406	0.3
407	0.24
408	0.22
409	0.19
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.11
425	0.12
426	0.14
427	0.16
428	0.16
429	0.16
430	0.21
431	0.22
432	0.27
433	0.29
434	0.36
435	0.44
436	0.54
437	0.63
438	0.69
439	0.78
440	0.82
441	0.89
442	0.91
443	0.91
444	0.91
445	0.88
446	0.88
447	0.87
448	0.8
449	0.71
450	0.63
451	0.61
452	0.55
453	0.48

A0A401GHS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer