Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GDT1

Protein Details
Accession A0A401GDT1    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-40QKENSGVRKRVKLERLRQKRAAKLTGIHydrophilic
109-132TEVDVKPKAEKKEKSRTLPRDVDGHydrophilic
410-432VREDRKKGTKKKLQGLHKKYNDNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-36RKRVKLERLRQKRAAK
118-120EKK
414-422RKKGTKKKL
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR003395  RecF/RecN/SMC_N  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF02463  SMC_N  
Amino Acid Sequences MARRVMSAASDDSQKENSGVRKRVKLERLRQKRAAKLTGIAARQRAVSVEDDEDAEGEDELDDLDDTQGQDEDAAGEEAREQEEEDEEGASPRGRKRVRTNAEGDSRPTEVDVKPKAEKKEKSRTLPRDVDGFTPGAIVRVQLKNFVTYDYVEFCPGPYLNMIFGPNGTGKSTIACAICLGLNFPPSVLGRASELNSFVKIGTESGHIEIELKGLMGKSNLVVRRMLSAKSKSSTFTLNGQSASGKEINARMAELNVQVSNLCTFLPQDKVSEFASMSPQQLLRETQRAAGNAHLTSWHDSLISSGKELKQMQDVLDADRDQLKTMQERNANLERDVRRYEERRRIEREIDLLELILPFKQYMEAKDLYHLTKAAQRRLHDKVKALQAKNAPMLKLKADLTREMQEKDEVREDRKKGTKKKLQGLHKKYNDNEKLETDAEDLKTKLETLKESEKQRKRNIERAEKAIAHMQKQLDNPPEMGDLDDLNNQLRNLSTQNNAIRNEQSDLQEKQRLNVQEESRQKTTIQQQQQRLKELDDVSHRKLEDLARWDRDCADVVRWLRNNKQRFRMELFEPPMLCCTVPDKKYVHAVEACFNQTQMKTFVAQCEEDYQLLNRLVVDTPEALGRKVRINTWYRAKTQLVGPPMSEQEMHVLGFDGYALQYLVYPEGLKWFLQNSLQLHRTAISLDAGRVDPNRAMEMVSRYGPGGSGGGASYVCGDVFNTVQRSRYGKRLPQNMTREVRPARNLVHSAIDPEIKQRIDTILREANQKLTLCQEEAKTLTDDDARIREEHRQHKRQHDDIISRRNAVVDLQKKFESFRYNIEKEQTKVNDLRSMPSVEDERIRLRSQLVVLTKKRADIVKDFSKIIRSVITTQQEATRIGLEYLQVAANKTALEAMCQDQEEEYQKAVAEFNDAHRRYEVAKEDSKLKLRVSMAKLDEVDDEIRAKFKDMEDSGEANARSAEDVQADLDAKKAQLDMNLHTNAGVVEQFRKREQEIKVLTETIEDKEKKMERVDRTIKTARDHWQPALDELVASIGTRFSAAFDRLGCAGEVRISEHEDYDKWAIEIFVKFRDSEKLQLLTGERQSGGERSLTTILYLMSLTEEARAPFSLVDEINQGMDQRAERAVHNSLVEVTCKAESGQYFLITPKLLPDLNYAERMKVLCVNNGEWLPEESGIGNMMNMIEGYVKLHSGRAVSSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.26
4 0.33
5 0.38
6 0.45
7 0.5
8 0.57
9 0.62
10 0.7
11 0.75
12 0.77
13 0.78
14 0.81
15 0.84
16 0.86
17 0.89
18 0.87
19 0.87
20 0.85
21 0.81
22 0.74
23 0.67
24 0.65
25 0.63
26 0.6
27 0.55
28 0.48
29 0.43
30 0.4
31 0.36
32 0.29
33 0.24
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.14
43 0.1
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.18
79 0.21
80 0.3
81 0.33
82 0.41
83 0.5
84 0.6
85 0.66
86 0.7
87 0.71
88 0.71
89 0.76
90 0.7
91 0.64
92 0.56
93 0.5
94 0.41
95 0.37
96 0.32
97 0.25
98 0.31
99 0.32
100 0.34
101 0.4
102 0.47
103 0.54
104 0.6
105 0.67
106 0.68
107 0.74
108 0.77
109 0.8
110 0.85
111 0.84
112 0.84
113 0.82
114 0.75
115 0.71
116 0.64
117 0.56
118 0.48
119 0.4
120 0.3
121 0.24
122 0.21
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.16
127 0.2
128 0.21
129 0.25
130 0.26
131 0.28
132 0.29
133 0.29
134 0.25
135 0.21
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.2
141 0.18
142 0.2
143 0.18
144 0.17
145 0.15
146 0.15
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.13
173 0.13
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.18
180 0.16
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.16
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.25
212 0.27
213 0.29
214 0.29
215 0.32
216 0.35
217 0.37
218 0.38
219 0.34
220 0.34
221 0.35
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.31
226 0.3
227 0.29
228 0.28
229 0.24
230 0.26
231 0.2
232 0.15
233 0.15
234 0.17
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.15
239 0.14
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.14
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.21
269 0.24
270 0.22
271 0.26
272 0.26
273 0.28
274 0.3
275 0.31
276 0.29
277 0.29
278 0.28
279 0.22
280 0.22
281 0.18
282 0.17
283 0.2
284 0.19
285 0.16
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.17
290 0.16
291 0.13
292 0.17
293 0.17
294 0.23
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.25
300 0.27
301 0.26
302 0.23
303 0.25
304 0.23
305 0.19
306 0.22
307 0.22
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.21
312 0.25
313 0.31
314 0.31
315 0.32
316 0.38
317 0.42
318 0.42
319 0.37
320 0.41
321 0.37
322 0.38
323 0.39
324 0.36
325 0.36
326 0.41
327 0.49
328 0.51
329 0.58
330 0.61
331 0.65
332 0.67
333 0.64
334 0.6
335 0.55
336 0.47
337 0.39
338 0.31
339 0.24
340 0.19
341 0.16
342 0.13
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.16
351 0.18
352 0.18
353 0.21
354 0.24
355 0.22
356 0.22
357 0.2
358 0.16
359 0.2
360 0.24
361 0.28
362 0.3
363 0.31
364 0.36
365 0.44
366 0.5
367 0.48
368 0.48
369 0.47
370 0.53
371 0.6
372 0.54
373 0.52
374 0.49
375 0.49
376 0.51
377 0.46
378 0.37
379 0.32
380 0.32
381 0.27
382 0.26
383 0.24
384 0.23
385 0.22
386 0.24
387 0.25
388 0.29
389 0.31
390 0.28
391 0.28
392 0.28
393 0.27
394 0.28
395 0.32
396 0.28
397 0.31
398 0.37
399 0.38
400 0.42
401 0.49
402 0.54
403 0.57
404 0.65
405 0.69
406 0.7
407 0.77
408 0.77
409 0.8
410 0.82
411 0.82
412 0.82
413 0.8
414 0.78
415 0.72
416 0.75
417 0.7
418 0.63
419 0.56
420 0.47
421 0.43
422 0.37
423 0.35
424 0.26
425 0.22
426 0.19
427 0.18
428 0.17
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.13
435 0.16
436 0.24
437 0.3
438 0.38
439 0.48
440 0.53
441 0.6
442 0.66
443 0.72
444 0.7
445 0.73
446 0.75
447 0.75
448 0.72
449 0.69
450 0.66
451 0.56
452 0.5
453 0.48
454 0.4
455 0.31
456 0.3
457 0.27
458 0.25
459 0.26
460 0.3
461 0.28
462 0.27
463 0.25
464 0.22
465 0.22
466 0.18
467 0.17
468 0.12
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.12
481 0.13
482 0.18
483 0.23
484 0.27
485 0.29
486 0.29
487 0.28
488 0.27
489 0.27
490 0.24
491 0.22
492 0.22
493 0.23
494 0.25
495 0.3
496 0.28
497 0.27
498 0.29
499 0.29
500 0.28
501 0.32
502 0.31
503 0.33
504 0.4
505 0.45
506 0.41
507 0.4
508 0.36
509 0.35
510 0.41
511 0.42
512 0.44
513 0.46
514 0.53
515 0.6
516 0.63
517 0.62
518 0.55
519 0.47
520 0.43
521 0.36
522 0.31
523 0.31
524 0.33
525 0.31
526 0.32
527 0.31
528 0.27
529 0.28
530 0.27
531 0.23
532 0.25
533 0.27
534 0.29
535 0.29
536 0.29
537 0.27
538 0.26
539 0.23
540 0.18
541 0.15
542 0.15
543 0.17
544 0.22
545 0.24
546 0.26
547 0.33
548 0.39
549 0.46
550 0.46
551 0.54
552 0.52
553 0.54
554 0.56
555 0.53
556 0.48
557 0.47
558 0.44
559 0.37
560 0.34
561 0.3
562 0.26
563 0.22
564 0.19
565 0.12
566 0.13
567 0.16
568 0.17
569 0.21
570 0.21
571 0.22
572 0.29
573 0.29
574 0.28
575 0.24
576 0.24
577 0.23
578 0.24
579 0.25
580 0.18
581 0.17
582 0.16
583 0.13
584 0.14
585 0.13
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.14
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.12
596 0.12
597 0.11
598 0.12
599 0.12
600 0.11
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.08
605 0.09
606 0.06
607 0.06
608 0.08
609 0.09
610 0.08
611 0.09
612 0.1
613 0.13
614 0.14
615 0.15
616 0.2
617 0.24
618 0.29
619 0.38
620 0.4
621 0.38
622 0.42
623 0.41
624 0.36
625 0.35
626 0.34
627 0.28
628 0.25
629 0.23
630 0.2
631 0.2
632 0.19
633 0.15
634 0.11
635 0.1
636 0.1
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.04
644 0.03
645 0.04
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.07
655 0.08
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.14
662 0.14
663 0.18
664 0.2
665 0.19
666 0.19
667 0.18
668 0.17
669 0.14
670 0.13
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.1
681 0.11
682 0.09
683 0.1
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.13
689 0.12
690 0.12
691 0.11
692 0.1
693 0.07
694 0.05
695 0.05
696 0.04
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.08
708 0.11
709 0.11
710 0.13
711 0.16
712 0.21
713 0.22
714 0.3
715 0.34
716 0.38
717 0.45
718 0.53
719 0.56
720 0.6
721 0.64
722 0.64
723 0.61
724 0.56
725 0.55
726 0.49
727 0.47
728 0.41
729 0.37
730 0.32
731 0.32
732 0.33
733 0.27
734 0.26
735 0.22
736 0.21
737 0.2
738 0.19
739 0.14
740 0.15
741 0.18
742 0.15
743 0.15
744 0.14
745 0.16
746 0.18
747 0.18
748 0.21
749 0.23
750 0.24
751 0.28
752 0.28
753 0.27
754 0.27
755 0.27
756 0.22
757 0.2
758 0.21
759 0.18
760 0.2
761 0.18
762 0.16
763 0.17
764 0.18
765 0.16
766 0.14
767 0.15
768 0.14
769 0.14
770 0.13
771 0.15
772 0.14
773 0.14
774 0.16
775 0.22
776 0.28
777 0.38
778 0.46
779 0.52
780 0.58
781 0.67
782 0.74
783 0.71
784 0.71
785 0.68
786 0.67
787 0.66
788 0.69
789 0.61
790 0.54
791 0.49
792 0.42
793 0.35
794 0.28
795 0.29
796 0.26
797 0.27
798 0.29
799 0.3
800 0.3
801 0.31
802 0.33
803 0.31
804 0.25
805 0.31
806 0.37
807 0.39
808 0.41
809 0.45
810 0.46
811 0.4
812 0.47
813 0.4
814 0.36
815 0.37
816 0.36
817 0.37
818 0.33
819 0.34
820 0.29
821 0.29
822 0.24
823 0.23
824 0.23
825 0.18
826 0.19
827 0.19
828 0.2
829 0.22
830 0.22
831 0.21
832 0.2
833 0.21
834 0.2
835 0.24
836 0.26
837 0.31
838 0.32
839 0.37
840 0.37
841 0.36
842 0.38
843 0.35
844 0.33
845 0.31
846 0.37
847 0.38
848 0.4
849 0.4
850 0.38
851 0.39
852 0.36
853 0.31
854 0.25
855 0.2
856 0.21
857 0.27
858 0.29
859 0.26
860 0.27
861 0.28
862 0.28
863 0.26
864 0.23
865 0.17
866 0.14
867 0.14
868 0.13
869 0.11
870 0.1
871 0.1
872 0.11
873 0.1
874 0.1
875 0.1
876 0.1
877 0.1
878 0.09
879 0.11
880 0.09
881 0.09
882 0.1
883 0.12
884 0.13
885 0.14
886 0.14
887 0.12
888 0.14
889 0.17
890 0.17
891 0.15
892 0.14
893 0.14
894 0.14
895 0.15
896 0.12
897 0.12
898 0.12
899 0.18
900 0.27
901 0.28
902 0.29
903 0.28
904 0.3
905 0.28
906 0.34
907 0.34
908 0.3
909 0.34
910 0.35
911 0.4
912 0.44
913 0.48
914 0.44
915 0.38
916 0.38
917 0.36
918 0.43
919 0.41
920 0.43
921 0.39
922 0.4
923 0.4
924 0.35
925 0.32
926 0.26
927 0.23
928 0.17
929 0.16
930 0.13
931 0.15
932 0.14
933 0.15
934 0.15
935 0.16
936 0.23
937 0.22
938 0.27
939 0.28
940 0.3
941 0.29
942 0.31
943 0.3
944 0.22
945 0.21
946 0.16
947 0.13
948 0.12
949 0.13
950 0.08
951 0.09
952 0.09
953 0.1
954 0.11
955 0.1
956 0.11
957 0.11
958 0.1
959 0.11
960 0.11
961 0.11
962 0.14
963 0.17
964 0.19
965 0.25
966 0.26
967 0.25
968 0.24
969 0.23
970 0.18
971 0.16
972 0.14
973 0.09
974 0.14
975 0.18
976 0.22
977 0.24
978 0.27
979 0.29
980 0.35
981 0.37
982 0.41
983 0.42
984 0.44
985 0.44
986 0.41
987 0.39
988 0.34
989 0.32
990 0.25
991 0.29
992 0.25
993 0.23
994 0.3
995 0.34
996 0.35
997 0.41
998 0.47
999 0.45
1000 0.55
1001 0.62
1002 0.58
1003 0.62
1004 0.65
1005 0.61
1006 0.58
1007 0.58
1008 0.55
1009 0.55
1010 0.56
1011 0.51
1012 0.5
1013 0.48
1014 0.44
1015 0.41
1016 0.34
1017 0.24
1018 0.2
1019 0.18
1020 0.11
1021 0.1
1022 0.08
1023 0.05
1024 0.05
1025 0.06
1026 0.06
1027 0.07
1028 0.11
1029 0.12
1030 0.14
1031 0.15
1032 0.17
1033 0.17
1034 0.18
1035 0.17
1036 0.13
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.12
1040 0.13
1041 0.14
1042 0.17
1043 0.18
1044 0.18
1045 0.2
1046 0.18
1047 0.23
1048 0.22
1049 0.21
1050 0.18
1051 0.18
1052 0.17
1053 0.18
1054 0.21
1055 0.19
1056 0.21
1057 0.21
1058 0.22
1059 0.23
1060 0.3
1061 0.29
1062 0.32
1063 0.36
1064 0.33
1065 0.32
1066 0.36
1067 0.37
1068 0.36
1069 0.36
1070 0.33
1071 0.27
1072 0.26
1073 0.27
1074 0.25
1075 0.24
1076 0.2
1077 0.17
1078 0.18
1079 0.2
1080 0.19
1081 0.17
1082 0.16
1083 0.15
1084 0.13
1085 0.12
1086 0.09
1087 0.08
1088 0.08
1089 0.08
1090 0.09
1091 0.11
1092 0.11
1093 0.13
1094 0.13
1095 0.13
1096 0.12
1097 0.14
1098 0.16
1099 0.14
1100 0.15
1101 0.15
1102 0.15
1103 0.15
1104 0.15
1105 0.14
1106 0.11
1107 0.14
1108 0.13
1109 0.13
1110 0.17
1111 0.17
1112 0.18
1113 0.22
1114 0.25
1115 0.26
1116 0.25
1117 0.24
1118 0.24
1119 0.24
1120 0.24
1121 0.2
1122 0.19
1123 0.16
1124 0.16
1125 0.16
1126 0.16
1127 0.15
1128 0.2
1129 0.21
1130 0.2
1131 0.21
1132 0.21
1133 0.24
1134 0.2
1135 0.2
1136 0.17
1137 0.19
1138 0.18
1139 0.19
1140 0.23
1141 0.28
1142 0.3
1143 0.38
1144 0.36
1145 0.33
1146 0.35
1147 0.34
1148 0.31
1149 0.31
1150 0.3
1151 0.29
1152 0.32
1153 0.32
1154 0.35
1155 0.35
1156 0.34
1157 0.28
1158 0.29
1159 0.25
1160 0.21
1161 0.2
1162 0.15
1163 0.15
1164 0.15
1165 0.13
1166 0.1
1167 0.08
1168 0.08
1169 0.07
1170 0.07
1171 0.06
1172 0.06
1173 0.06
1174 0.08
1175 0.09
1176 0.1
1177 0.1
1178 0.12
1179 0.14
1180 0.14