Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401H500

Protein Details
Accession A0A401H500    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-126SDSPAGPPHKRRRLPRGVHGVHBasic
172-203VSAEKGRKPQKERTQKKRVKNPPTRARRRTIDBasic
497-520ELTSGWKRRHREAVKSRRRRGGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-119GPPHKRRRLP
174-200AEKGRKPQKERTQKKRVKNPPTRARRR
502-518WKRRHREAVKSRRRRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MDEPIVKRLHVSGLTPAITPADLTQRLSSFGAVKAVDGFGVLDAVGLPRKFGYVTLETTKPKLARCMNTLSGVTWKGTKLRIGEAKLDFRERILKENETLKRAASDSPAGPPHKRRRLPRGVHGVHAQDMSLVTPGNAASRPGWRVTSLGRLIRPIRMRPEHPLPDQLPKIVSAEKGRKPQKERTQKKRVKNPPTRARRRTIDPTKWGSLHLKGVFLDTGATLDVGQRPPALRETERGLEESSNDEESDDDDDETDSGDEVMGAEEYPPSLLQEATLSPPFSPKPAAQKTRANVGDENDLVQETKKSLGLLQVLFGGRGDDEWGDQESVDSDGDLDDHARPADMQAEDIEENHMHVDKAVSFRVERVQPHEELPTPVSAQSAKLKDLFAPREEDAGFSLLGHLDLDLELDDEVDLQLTAEPQARPVPQPVATVSPAAGAQSVFDTRRPLFFPFPLDERDRARGRTGDAFDATNWRTWFYRTDSAEEIHKRWEETRGELTSGWKRRHREAVKSRRRRGGGAEDGDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.28
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.16
8 0.19
9 0.19
10 0.22
11 0.25
12 0.24
13 0.27
14 0.28
15 0.27
16 0.22
17 0.21
18 0.23
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.11
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.05
30 0.05
31 0.07
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.18
40 0.18
41 0.23
42 0.28
43 0.33
44 0.35
45 0.37
46 0.42
47 0.38
48 0.37
49 0.4
50 0.43
51 0.44
52 0.47
53 0.52
54 0.49
55 0.5
56 0.49
57 0.41
58 0.38
59 0.33
60 0.29
61 0.24
62 0.22
63 0.22
64 0.24
65 0.26
66 0.24
67 0.31
68 0.36
69 0.37
70 0.43
71 0.44
72 0.49
73 0.48
74 0.5
75 0.42
76 0.37
77 0.42
78 0.36
79 0.38
80 0.36
81 0.35
82 0.36
83 0.45
84 0.48
85 0.43
86 0.43
87 0.36
88 0.33
89 0.32
90 0.3
91 0.24
92 0.24
93 0.21
94 0.26
95 0.31
96 0.33
97 0.36
98 0.44
99 0.51
100 0.58
101 0.64
102 0.67
103 0.72
104 0.79
105 0.82
106 0.82
107 0.82
108 0.74
109 0.71
110 0.67
111 0.58
112 0.49
113 0.42
114 0.31
115 0.21
116 0.18
117 0.14
118 0.1
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.26
135 0.27
136 0.29
137 0.28
138 0.32
139 0.33
140 0.37
141 0.4
142 0.36
143 0.4
144 0.42
145 0.44
146 0.46
147 0.54
148 0.54
149 0.52
150 0.54
151 0.48
152 0.5
153 0.48
154 0.42
155 0.33
156 0.28
157 0.27
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.29
162 0.33
163 0.42
164 0.49
165 0.54
166 0.59
167 0.66
168 0.7
169 0.73
170 0.78
171 0.79
172 0.84
173 0.84
174 0.88
175 0.89
176 0.89
177 0.89
178 0.89
179 0.89
180 0.88
181 0.9
182 0.91
183 0.87
184 0.84
185 0.78
186 0.75
187 0.75
188 0.75
189 0.71
190 0.68
191 0.67
192 0.63
193 0.58
194 0.53
195 0.45
196 0.38
197 0.36
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.21
202 0.19
203 0.16
204 0.14
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.13
218 0.16
219 0.14
220 0.16
221 0.2
222 0.22
223 0.23
224 0.22
225 0.2
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.22
272 0.3
273 0.35
274 0.38
275 0.44
276 0.44
277 0.51
278 0.51
279 0.44
280 0.37
281 0.33
282 0.32
283 0.25
284 0.25
285 0.16
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.11
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.1
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.14
350 0.19
351 0.22
352 0.22
353 0.26
354 0.29
355 0.29
356 0.3
357 0.32
358 0.28
359 0.27
360 0.26
361 0.22
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.14
366 0.15
367 0.2
368 0.2
369 0.2
370 0.21
371 0.22
372 0.24
373 0.32
374 0.32
375 0.27
376 0.3
377 0.29
378 0.31
379 0.3
380 0.27
381 0.2
382 0.18
383 0.16
384 0.11
385 0.11
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.07
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.17
410 0.18
411 0.2
412 0.23
413 0.26
414 0.24
415 0.26
416 0.27
417 0.27
418 0.26
419 0.25
420 0.21
421 0.18
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.08
426 0.07
427 0.09
428 0.12
429 0.12
430 0.14
431 0.18
432 0.19
433 0.23
434 0.25
435 0.27
436 0.29
437 0.3
438 0.34
439 0.33
440 0.36
441 0.38
442 0.39
443 0.39
444 0.39
445 0.44
446 0.44
447 0.42
448 0.43
449 0.41
450 0.41
451 0.45
452 0.43
453 0.4
454 0.37
455 0.36
456 0.32
457 0.37
458 0.34
459 0.31
460 0.28
461 0.25
462 0.25
463 0.26
464 0.3
465 0.3
466 0.37
467 0.35
468 0.39
469 0.4
470 0.41
471 0.48
472 0.48
473 0.43
474 0.41
475 0.4
476 0.38
477 0.37
478 0.43
479 0.38
480 0.38
481 0.44
482 0.4
483 0.4
484 0.39
485 0.44
486 0.45
487 0.5
488 0.52
489 0.52
490 0.54
491 0.6
492 0.7
493 0.7
494 0.72
495 0.75
496 0.78
497 0.83
498 0.89
499 0.9
500 0.89
501 0.85
502 0.77
503 0.74
504 0.73
505 0.72