Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GPC6

Protein Details
Accession A0A401GPC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
516-538SEALKRKDKEKRERAANRRRVRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-538KRKDKEKRERAANRRRVRG
Subcellular Location(s) cysk 9, nucl 8, cyto 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPFHKNILEQIHDPSSSDLLLLARGLGLRRIICKLLQIYDSPNNLVILVNATPEEEAAIGEELGTMGCRKPGLRVVGFETNKKERQDLYKKGGLFSVTSQIFSVDMLSSDIPTHLITGILILHAEKVAPEGSEAFIVRLYRERNQNGFIKAFSDQPEHITSGIWPLRTIVKQLQLRSIHIYPRFHVDVKESLDLKRPDLVELHQSMTESMQEIHVAIMMCMTTTLSELKRANTSLDLDDLNIDNAYFRSFDLIVRRILDTVWHKVGPRTKQLVGDLAVLRRLLNYLLTYDALAFHAYLETIVASNTTTESGAARQNQSPWLMTDAAHTIFQYAKRRCYTQSVVKEKPTEARAPATVDVDEDEEAWAVLDEFEQGSSAAKQPINVPDTPQRPSWLPEGMTPVLEELPKWNLLADVLQEIEEEMMRLDSRLTSLSPGTNTVLVMTSSLRTCTILTEFLSTMDPTASRGSKGRKMMEDKLRSYLWWKGKLSEQKQDPKAQFTLKKDQQGSDIGLSEALKRKDKEKRERAANRRRVRGGAHTASSSRENTAAQVDAEVELIGEVSMKEEANTIANFLATQGVQAPEGHLAEDITLIDFDSDFDVNYGLVEPQQTVLVRAYSDDSDDQVLSEIKPRFIVMFEPNLEFIRRIEIYRNSNPGLGVRVYFMMYRLSCEEAKYLTGLRREKESFERLIKERATMLMPILEERRGTAAAESIIRTISTRLAGGRKDVTAEPPRVIVDMREFRSSLPSLLHAAELVVIPVTLTVGDYILTPDICVERKSIPDLVSSFNSGRLYTQCELMSVHYKQPILLIEFEEYKSFSLEAIAEVKSYAKAPNKYASKSGPKTKGGAISENETVASSTIQSKIVLLTLTFPRVRIIWSSSPYATAEVFKDLKANNPEPDPAKAIVIGAEEDGDAGTGVNTAAEELLRTFPGITAKNLKHVMNSVSSVRELCELDLPAVQEILGVEPGKACWDFMHRGERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.33
4 0.33
5 0.31
6 0.27
7 0.22
8 0.19
9 0.15
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.15
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.3
25 0.32
26 0.32
27 0.32
28 0.31
29 0.35
30 0.4
31 0.41
32 0.37
33 0.34
34 0.3
35 0.28
36 0.26
37 0.19
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.16
62 0.23
63 0.3
64 0.32
65 0.34
66 0.39
67 0.48
68 0.5
69 0.5
70 0.51
71 0.51
72 0.54
73 0.53
74 0.5
75 0.45
76 0.54
77 0.59
78 0.6
79 0.61
80 0.61
81 0.6
82 0.57
83 0.54
84 0.45
85 0.36
86 0.29
87 0.3
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.16
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.18
130 0.21
131 0.25
132 0.34
133 0.4
134 0.42
135 0.47
136 0.52
137 0.51
138 0.49
139 0.43
140 0.36
141 0.31
142 0.31
143 0.28
144 0.26
145 0.23
146 0.25
147 0.27
148 0.26
149 0.24
150 0.21
151 0.18
152 0.23
153 0.24
154 0.21
155 0.18
156 0.19
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.25
161 0.31
162 0.36
163 0.38
164 0.45
165 0.41
166 0.43
167 0.45
168 0.44
169 0.42
170 0.43
171 0.43
172 0.36
173 0.41
174 0.42
175 0.37
176 0.35
177 0.32
178 0.32
179 0.34
180 0.38
181 0.32
182 0.3
183 0.37
184 0.37
185 0.35
186 0.34
187 0.3
188 0.25
189 0.26
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.22
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.18
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.04
214 0.05
215 0.09
216 0.09
217 0.16
218 0.17
219 0.19
220 0.22
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.25
225 0.2
226 0.2
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.1
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.09
240 0.09
241 0.12
242 0.17
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.23
247 0.2
248 0.19
249 0.23
250 0.21
251 0.25
252 0.26
253 0.26
254 0.26
255 0.31
256 0.38
257 0.37
258 0.41
259 0.41
260 0.4
261 0.42
262 0.43
263 0.42
264 0.37
265 0.36
266 0.3
267 0.25
268 0.24
269 0.21
270 0.19
271 0.15
272 0.14
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.12
303 0.15
304 0.18
305 0.19
306 0.2
307 0.23
308 0.24
309 0.22
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.11
320 0.12
321 0.17
322 0.24
323 0.25
324 0.31
325 0.33
326 0.36
327 0.37
328 0.43
329 0.45
330 0.45
331 0.52
332 0.54
333 0.56
334 0.58
335 0.58
336 0.52
337 0.5
338 0.44
339 0.38
340 0.31
341 0.29
342 0.26
343 0.26
344 0.26
345 0.22
346 0.19
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.11
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.08
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.15
372 0.21
373 0.23
374 0.22
375 0.24
376 0.27
377 0.3
378 0.32
379 0.3
380 0.27
381 0.25
382 0.27
383 0.26
384 0.22
385 0.2
386 0.19
387 0.24
388 0.22
389 0.21
390 0.18
391 0.16
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.13
457 0.18
458 0.23
459 0.28
460 0.29
461 0.32
462 0.37
463 0.44
464 0.5
465 0.52
466 0.47
467 0.46
468 0.43
469 0.38
470 0.35
471 0.34
472 0.31
473 0.31
474 0.3
475 0.28
476 0.34
477 0.43
478 0.44
479 0.45
480 0.45
481 0.48
482 0.51
483 0.56
484 0.51
485 0.46
486 0.44
487 0.43
488 0.41
489 0.38
490 0.45
491 0.42
492 0.47
493 0.45
494 0.43
495 0.4
496 0.36
497 0.32
498 0.23
499 0.2
500 0.13
501 0.13
502 0.12
503 0.12
504 0.15
505 0.15
506 0.19
507 0.19
508 0.26
509 0.33
510 0.43
511 0.52
512 0.57
513 0.63
514 0.7
515 0.79
516 0.83
517 0.86
518 0.86
519 0.82
520 0.79
521 0.73
522 0.65
523 0.57
524 0.53
525 0.5
526 0.43
527 0.37
528 0.31
529 0.3
530 0.29
531 0.29
532 0.23
533 0.15
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.11
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.07
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.04
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.09
603 0.09
604 0.08
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.1
616 0.08
617 0.15
618 0.15
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.17
625 0.14
626 0.17
627 0.18
628 0.19
629 0.2
630 0.2
631 0.2
632 0.17
633 0.14
634 0.15
635 0.14
636 0.14
637 0.18
638 0.24
639 0.31
640 0.35
641 0.39
642 0.35
643 0.35
644 0.34
645 0.3
646 0.26
647 0.2
648 0.15
649 0.12
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.14
658 0.16
659 0.16
660 0.17
661 0.18
662 0.14
663 0.15
664 0.14
665 0.15
666 0.16
667 0.22
668 0.25
669 0.25
670 0.31
671 0.31
672 0.34
673 0.38
674 0.39
675 0.38
676 0.39
677 0.44
678 0.4
679 0.45
680 0.41
681 0.36
682 0.32
683 0.28
684 0.25
685 0.19
686 0.18
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.13
695 0.11
696 0.12
697 0.1
698 0.1
699 0.11
700 0.12
701 0.12
702 0.11
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.1
710 0.12
711 0.16
712 0.17
713 0.2
714 0.21
715 0.2
716 0.22
717 0.22
718 0.26
719 0.29
720 0.31
721 0.28
722 0.27
723 0.27
724 0.25
725 0.24
726 0.18
727 0.2
728 0.25
729 0.27
730 0.28
731 0.28
732 0.28
733 0.33
734 0.32
735 0.25
736 0.19
737 0.18
738 0.18
739 0.18
740 0.17
741 0.12
742 0.11
743 0.11
744 0.09
745 0.08
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.06
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.07
762 0.1
763 0.11
764 0.12
765 0.13
766 0.14
767 0.17
768 0.2
769 0.23
770 0.21
771 0.24
772 0.25
773 0.27
774 0.26
775 0.27
776 0.24
777 0.24
778 0.25
779 0.21
780 0.21
781 0.19
782 0.24
783 0.21
784 0.24
785 0.2
786 0.2
787 0.21
788 0.23
789 0.28
790 0.24
791 0.27
792 0.27
793 0.27
794 0.26
795 0.28
796 0.28
797 0.23
798 0.22
799 0.2
800 0.19
801 0.21
802 0.21
803 0.19
804 0.17
805 0.15
806 0.14
807 0.13
808 0.1
809 0.1
810 0.09
811 0.1
812 0.12
813 0.12
814 0.11
815 0.11
816 0.12
817 0.11
818 0.12
819 0.17
820 0.22
821 0.26
822 0.3
823 0.39
824 0.44
825 0.46
826 0.51
827 0.53
828 0.56
829 0.6
830 0.66
831 0.65
832 0.62
833 0.62
834 0.61
835 0.6
836 0.53
837 0.51
838 0.44
839 0.4
840 0.38
841 0.35
842 0.31
843 0.23
844 0.2
845 0.15
846 0.12
847 0.09
848 0.11
849 0.12
850 0.13
851 0.13
852 0.13
853 0.13
854 0.14
855 0.13
856 0.11
857 0.14
858 0.16
859 0.21
860 0.21
861 0.21
862 0.21
863 0.21
864 0.23
865 0.22
866 0.26
867 0.27
868 0.3
869 0.34
870 0.33
871 0.35
872 0.34
873 0.32
874 0.26
875 0.22
876 0.19
877 0.21
878 0.21
879 0.2
880 0.23
881 0.22
882 0.29
883 0.35
884 0.38
885 0.37
886 0.38
887 0.44
888 0.42
889 0.45
890 0.41
891 0.33
892 0.3
893 0.26
894 0.23
895 0.19
896 0.18
897 0.15
898 0.11
899 0.1
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.06
904 0.05
905 0.05
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.06
915 0.07
916 0.09
917 0.1
918 0.1
919 0.1
920 0.12
921 0.19
922 0.2
923 0.24
924 0.32
925 0.33
926 0.4
927 0.44
928 0.43
929 0.4
930 0.42
931 0.4
932 0.35
933 0.37
934 0.32
935 0.3
936 0.31
937 0.28
938 0.25
939 0.25
940 0.21
941 0.2
942 0.21
943 0.2
944 0.2
945 0.22
946 0.22
947 0.18
948 0.17
949 0.15
950 0.11
951 0.11
952 0.11
953 0.12
954 0.11
955 0.11
956 0.12
957 0.12
958 0.15
959 0.15
960 0.14
961 0.13
962 0.19
963 0.24
964 0.29
965 0.4