FuNGI

A0A401GYE9

Protein Details

Accession

A0A401GYE9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1308-1328	ILTKSLPKPRHEKLTKKLGMP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSTSADNTSNSNAYRIPLLKEDNWLPWKRRVEAILNDKGLQEYVTGKTPKPQPSNDLANRAAREAEISAWGEKDLKAQNVIVLSLGDSQMVHIAGAETARAMWEQLRTVKEQRGQHGILALCRCFYRMQAKEEDNISSHITQLRQIQEQLHLMGKVVSDEDFQLILATSLPESWDSFLSSYFGAVGGNVGAEGADNGPLMKRQKTERAYEAREVESKDDEAKIAYDNDSDTVSLGSDGEIASFYEWFADSGTTSHITNHREVFATYQALEDHAITGIGPQPTQALGRGTVDVESEVGDRKVKFRLHGVLYAPTAPNSLLSITHLDDVGGRVLMGKKNGRLYSLKLHPIVPQPARTYTAKEYGPHTWEEWHKIYGHIGKPALTRLYREGLVDGLEISPSPDEINCEACIQAKATQKPFPKETDECSKVPGELTHTDVWGPAQTAALQGWKYFITFTDDYSRRSTVLFMRHKDEVTEKVKNYITYIERKFGNKPLRLRLDNGREYMNTELINWCQMKGIEMGPTVPYSPSQNGVSERLNHTLLGLARAMIYARDLPRYLWAEAIAHAVYIKNRSPTQALNGATPEEKWNGTKPNISYLQEFGSPVWVLTEDATLSKLAPRANKYIFVGYMDGPKAIKYYDAHTRQIKISRNFQFSSNFPDHLPGNAPHVPQEQIGSDVPILTAQREGEQNIFPGTLPSNASDVPHAERRPEVPNLTTTADVRREGELGTSAPQSPAKNPRKHRQDHDPDQREESGTDAPSQPRRTRRKTVWHDYHLMHDPEADEDLDNDPDKSNAELVYIAMSAHGNADADEPKTLSDAKRSLEWPKWEQAVQMELNQLQGMETWELVEPPEDRKPVGNKWVLVKKTNKEGEIIKYKARLVAKGYSQIPGMDYTETFAPVVRLETIRAILGLAAILDWEIGQMDVKGAYLNGTLKEEVYMRQPEGYSDGTYRVCKLKKTLYGLKQSGREWNIMLNRKLLDAGFKRLFSDPCAYIRIKGDKIEIVTVWVDDLLIFTNDCALMDQLKRELRNMFEVTDLGEPRKIVGIEIERDRSKRTIKISQTKYIESILHKNGLTNANTVGMPLDPNTVLEKEEPETDDECDRDNGYASLVGSLMYAAIATRPDIAHAVQRLSSFTANPGMAHWTAAKRVLRYLSGTRELGIIYGPIADVKPEDQSIFVGYSDADYANDIRDRKSISGYLFKLGNGMITWSSKKQTTVASSTTEAEYMASAEAAKEAVWLQTLFREIGFEQQDPTILLEDNTAAISIARDPQFHAKSKHFDVKHHYVREKLRDKYIDIHYCPTEDMIADILTKSLPKPRHEKLTKKLGMPIGLRGSVGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.28
4	0.3
5	0.36
6	0.35
7	0.41
8	0.43
9	0.45
10	0.51
11	0.54
12	0.53
13	0.56
14	0.61
15	0.58
16	0.6
17	0.56
18	0.56
19	0.59
20	0.63
21	0.63
22	0.59
23	0.57
24	0.52
25	0.47
26	0.39
27	0.29
28	0.21
29	0.16
30	0.16
31	0.23
32	0.25
33	0.25
34	0.33
35	0.41
36	0.49
37	0.53
38	0.55
39	0.54
40	0.59
41	0.7
42	0.68
43	0.67
44	0.61
45	0.6
46	0.57
47	0.51
48	0.44
49	0.33
50	0.29
51	0.23
52	0.2
53	0.17
54	0.18
55	0.18
56	0.17
57	0.18
58	0.18
59	0.17
60	0.22
61	0.24
62	0.24
63	0.26
64	0.26
65	0.27
66	0.27
67	0.26
68	0.2
69	0.15
70	0.13
71	0.13
72	0.13
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.11
77	0.11
78	0.09
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.06
85	0.06
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.09
90	0.11
91	0.16
92	0.21
93	0.25
94	0.29
95	0.35
96	0.41
97	0.46
98	0.49
99	0.51
100	0.53
101	0.51
102	0.47
103	0.48
104	0.42
105	0.41
106	0.39
107	0.34
108	0.27
109	0.26
110	0.26
111	0.21
112	0.24
113	0.29
114	0.31
115	0.36
116	0.43
117	0.46
118	0.49
119	0.51
120	0.48
121	0.4
122	0.36
123	0.34
124	0.26
125	0.25
126	0.24
127	0.22
128	0.23
129	0.28
130	0.3
131	0.3
132	0.32
133	0.32
134	0.33
135	0.35
136	0.33
137	0.3
138	0.25
139	0.22
140	0.21
141	0.19
142	0.15
143	0.13
144	0.12
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.13
166	0.12
167	0.11
168	0.1
169	0.09
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.03
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.11
186	0.15
187	0.18
188	0.22
189	0.28
190	0.38
191	0.43
192	0.49
193	0.54
194	0.59
195	0.61
196	0.64
197	0.61
198	0.55
199	0.54
200	0.49
201	0.42
202	0.36
203	0.31
204	0.27
205	0.24
206	0.2
207	0.17
208	0.16
209	0.16
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.11
218	0.09
219	0.08
220	0.08
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.14
242	0.19
243	0.22
244	0.25
245	0.27
246	0.26
247	0.26
248	0.26
249	0.25
250	0.24
251	0.22
252	0.19
253	0.17
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.13
258	0.1
259	0.08
260	0.08
261	0.06
262	0.07
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.11
269	0.12
270	0.13
271	0.11
272	0.11
273	0.13
274	0.14
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.11
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.13
285	0.13
286	0.15
287	0.21
288	0.23
289	0.24
290	0.28
291	0.35
292	0.35
293	0.39
294	0.39
295	0.36
296	0.35
297	0.36
298	0.31
299	0.24
300	0.21
301	0.16
302	0.14
303	0.11
304	0.1
305	0.08
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.12
314	0.11
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.12
319	0.14
320	0.18
321	0.21
322	0.24
323	0.31
324	0.32
325	0.33
326	0.33
327	0.35
328	0.39
329	0.43
330	0.44
331	0.39
332	0.39
333	0.4
334	0.43
335	0.47
336	0.41
337	0.39
338	0.36
339	0.37
340	0.4
341	0.37
342	0.36
343	0.32
344	0.35
345	0.32
346	0.31
347	0.33
348	0.34
349	0.35
350	0.31
351	0.28
352	0.28
353	0.29
354	0.34
355	0.32
356	0.29
357	0.27
358	0.26
359	0.3
360	0.32
361	0.31
362	0.29
363	0.27
364	0.28
365	0.28
366	0.31
367	0.31
368	0.24
369	0.24
370	0.23
371	0.25
372	0.24
373	0.23
374	0.21
375	0.16
376	0.16
377	0.14
378	0.11
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.05
387	0.08
388	0.09
389	0.12
390	0.12
391	0.13
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.13
396	0.18
397	0.23
398	0.27
399	0.31
400	0.37
401	0.42
402	0.46
403	0.48
404	0.46
405	0.46
406	0.43
407	0.45
408	0.48
409	0.47
410	0.42
411	0.41
412	0.38
413	0.31
414	0.3
415	0.25
416	0.2
417	0.17
418	0.21
419	0.19
420	0.18
421	0.18
422	0.17
423	0.16
424	0.12
425	0.12
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.14
440	0.14
441	0.16
442	0.24
443	0.26
444	0.28
445	0.32
446	0.32
447	0.25
448	0.25
449	0.25
450	0.21
451	0.29
452	0.33
453	0.33
454	0.36
455	0.38
456	0.37
457	0.36
458	0.34
459	0.32
460	0.31
461	0.35
462	0.31
463	0.34
464	0.36
465	0.34
466	0.33
467	0.31
468	0.28
469	0.31
470	0.32
471	0.31
472	0.32
473	0.34
474	0.36
475	0.38
476	0.43
477	0.41
478	0.44
479	0.49
480	0.55
481	0.54
482	0.55
483	0.55
484	0.55
485	0.53
486	0.49
487	0.42
488	0.34
489	0.35
490	0.32
491	0.26
492	0.17
493	0.14
494	0.14
495	0.12
496	0.16
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.13
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.09
511	0.09
512	0.1
513	0.11
514	0.13
515	0.13
516	0.15
517	0.16
518	0.19
519	0.21
520	0.21
521	0.23
522	0.23
523	0.22
524	0.2
525	0.18
526	0.18
527	0.16
528	0.14
529	0.12
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.05
535	0.06
536	0.08
537	0.09
538	0.11
539	0.11
540	0.12
541	0.17
542	0.2
543	0.19
544	0.16
545	0.16
546	0.14
547	0.14
548	0.16
549	0.11
550	0.08
551	0.07
552	0.08
553	0.08
554	0.1
555	0.12
556	0.13
557	0.14
558	0.16
559	0.18
560	0.18
561	0.21
562	0.24
563	0.23
564	0.21
565	0.21
566	0.21
567	0.19
568	0.18
569	0.16
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.14
574	0.18
575	0.19
576	0.23
577	0.21
578	0.27
579	0.3
580	0.3
581	0.28
582	0.25
583	0.24
584	0.21
585	0.21
586	0.14
587	0.13
588	0.11
589	0.09
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.09
602	0.11
603	0.15
604	0.18
605	0.22
606	0.23
607	0.26
608	0.25
609	0.24
610	0.23
611	0.2
612	0.18
613	0.13
614	0.16
615	0.13
616	0.13
617	0.11
618	0.11
619	0.1
620	0.09
621	0.1
622	0.08
623	0.11
624	0.19
625	0.23
626	0.28
627	0.3
628	0.32
629	0.33
630	0.38
631	0.43
632	0.37
633	0.43
634	0.45
635	0.47
636	0.46
637	0.45
638	0.41
639	0.34
640	0.38
641	0.31
642	0.26
643	0.21
644	0.22
645	0.2
646	0.18
647	0.2
648	0.13
649	0.16
650	0.18
651	0.18
652	0.17
653	0.18
654	0.18
655	0.16
656	0.16
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.1
661	0.09
662	0.08
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.05
667	0.06
668	0.05
669	0.07
670	0.08
671	0.09
672	0.1
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.09
687	0.1
688	0.12
689	0.16
690	0.16
691	0.15
692	0.16
693	0.19
694	0.22
695	0.23
696	0.22
697	0.18
698	0.19
699	0.21
700	0.21
701	0.19
702	0.16
703	0.16
704	0.17
705	0.16
706	0.16
707	0.14
708	0.13
709	0.13
710	0.12
711	0.1
712	0.09
713	0.1
714	0.09
715	0.09
716	0.09
717	0.12
718	0.12
719	0.15
720	0.26
721	0.33
722	0.41
723	0.47
724	0.56
725	0.64
726	0.69
727	0.71
728	0.71
729	0.73
730	0.75
731	0.79
732	0.77
733	0.69
734	0.65
735	0.6
736	0.5
737	0.39
738	0.31
739	0.22
740	0.15
741	0.15
742	0.14
743	0.17
744	0.21
745	0.26
746	0.29
747	0.37
748	0.45
749	0.51
750	0.58
751	0.63
752	0.69
753	0.74
754	0.79
755	0.79
756	0.75
757	0.72
758	0.64
759	0.61
760	0.56
761	0.46
762	0.35
763	0.26
764	0.22
765	0.17
766	0.17
767	0.13
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.08
775	0.08
776	0.09
777	0.08
778	0.08
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.07
784	0.07
785	0.06
786	0.05
787	0.05
788	0.05
789	0.05
790	0.05
791	0.04
792	0.04
793	0.06
794	0.07
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.08
799	0.09
800	0.1
801	0.09
802	0.13
803	0.15
804	0.16
805	0.19
806	0.22
807	0.26
808	0.3
809	0.35
810	0.33
811	0.35
812	0.36
813	0.33
814	0.32
815	0.28
816	0.27
817	0.22
818	0.2
819	0.18
820	0.15
821	0.15
822	0.14
823	0.13
824	0.08
825	0.08
826	0.08
827	0.06
828	0.06
829	0.06
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.08
834	0.07
835	0.11
836	0.15
837	0.15
838	0.15
839	0.19
840	0.24
841	0.26
842	0.34
843	0.34
844	0.32
845	0.38
846	0.45
847	0.43
848	0.45
849	0.48
850	0.43
851	0.49
852	0.51
853	0.45
854	0.4
855	0.41
856	0.42
857	0.44
858	0.43
859	0.35
860	0.34
861	0.34
862	0.36
863	0.34
864	0.29
865	0.24
866	0.27
867	0.27
868	0.31
869	0.31
870	0.27
871	0.27
872	0.24
873	0.21
874	0.17
875	0.16
876	0.11
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.09
882	0.08
883	0.08
884	0.07
885	0.08
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.1
890	0.1
891	0.1
892	0.09
893	0.08
894	0.07
895	0.06
896	0.05
897	0.04
898	0.03
899	0.03
900	0.03
901	0.03
902	0.02
903	0.02
904	0.03
905	0.03
906	0.03
907	0.03
908	0.04
909	0.04
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.05
914	0.06
915	0.08
916	0.09
917	0.11
918	0.11
919	0.11
920	0.12
921	0.12
922	0.12
923	0.16
924	0.17
925	0.16
926	0.18
927	0.18
928	0.17
929	0.2
930	0.2
931	0.17
932	0.15
933	0.18
934	0.18
935	0.19
936	0.21
937	0.24
938	0.24
939	0.25
940	0.29
941	0.34
942	0.38
943	0.46
944	0.53
945	0.53
946	0.61
947	0.64
948	0.63
949	0.6
950	0.55
951	0.55
952	0.48
953	0.41
954	0.32
955	0.33
956	0.36
957	0.38
958	0.38
959	0.33
960	0.32
961	0.31
962	0.31
963	0.25
964	0.26
965	0.22
966	0.28
967	0.28
968	0.28
969	0.3
970	0.32
971	0.33
972	0.28
973	0.3
974	0.24
975	0.24
976	0.28
977	0.27
978	0.26
979	0.31
980	0.34
981	0.3
982	0.3
983	0.3
984	0.28
985	0.29
986	0.28
987	0.22
988	0.18
989	0.17
990	0.15
991	0.12
992	0.1
993	0.08
994	0.06
995	0.06
996	0.05
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.13
1008	0.17
1009	0.22
1010	0.22
1011	0.24
1012	0.27
1013	0.25
1014	0.31
1015	0.31
1016	0.26
1017	0.23
1018	0.23
1019	0.22
1020	0.23
1021	0.22
1022	0.17
1023	0.16
1024	0.15
1025	0.15
1026	0.18
1027	0.16
1028	0.12
1029	0.16
1030	0.19
1031	0.23
1032	0.27
1033	0.32
1034	0.32
1035	0.33
1036	0.36
1037	0.36
1038	0.36
1039	0.37
1040	0.4
1041	0.44
1042	0.51
1043	0.61
1044	0.64
1045	0.68
1046	0.67
1047	0.63
1048	0.58
1049	0.51
1050	0.45
1051	0.39
1052	0.4
1053	0.34
1054	0.34
1055	0.32
1056	0.32
1057	0.34
1058	0.35
1059	0.33
1060	0.27
1061	0.24
1062	0.21
1063	0.21
1064	0.2
1065	0.16
1066	0.11
1067	0.1
1068	0.09
1069	0.11
1070	0.09
1071	0.1
1072	0.13
1073	0.13
1074	0.14
1075	0.14
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.17
1079	0.18
1080	0.18
1081	0.19
1082	0.2
1083	0.21
1084	0.2
1085	0.2
1086	0.19
1087	0.19
1088	0.16
1089	0.16
1090	0.14
1091	0.13
1092	0.14
1093	0.12
1094	0.11
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.06
1100	0.04
1101	0.04
1102	0.03
1103	0.04
1104	0.05
1105	0.05
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.09
1109	0.11
1110	0.12
1111	0.16
1112	0.18
1113	0.2
1114	0.2
1115	0.2
1116	0.21
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.18
1120	0.17
1121	0.2
1122	0.19
1123	0.18
1124	0.17
1125	0.19
1126	0.18
1127	0.19
1128	0.2
1129	0.17
1130	0.19
1131	0.25
1132	0.27
1133	0.24
1134	0.29
1135	0.31
1136	0.3
1137	0.33
1138	0.37
1139	0.37
1140	0.4
1141	0.39
1142	0.35
1143	0.32
1144	0.3
1145	0.25
1146	0.19
1147	0.12
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.07
1154	0.07
1155	0.08
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.12
1159	0.12
1160	0.13
1161	0.14
1162	0.14
1163	0.13
1164	0.11
1165	0.1
1166	0.1
1167	0.11
1168	0.1
1169	0.08
1170	0.09
1171	0.09
1172	0.12
1173	0.17
1174	0.17
1175	0.18
1176	0.21
1177	0.25
1178	0.25
1179	0.29
1180	0.3
1181	0.3
1182	0.38
1183	0.38
1184	0.38
1185	0.36
1186	0.34
1187	0.31
1188	0.26
1189	0.23
1190	0.14
1191	0.15
1192	0.13
1193	0.15
1194	0.19
1195	0.21
1196	0.24
1197	0.25
1198	0.26
1199	0.27
1200	0.32
1201	0.35
1202	0.37
1203	0.37
1204	0.37
1205	0.37
1206	0.38
1207	0.35
1208	0.29
1209	0.22
1210	0.17
1211	0.15
1212	0.11
1213	0.09
1214	0.07
1215	0.06
1216	0.06
1217	0.07
1218	0.07
1219	0.06
1220	0.06
1221	0.07
1222	0.07
1223	0.09
1224	0.09
1225	0.1
1226	0.13
1227	0.15
1228	0.14
1229	0.14
1230	0.16
1231	0.14
1232	0.22
1233	0.25
1234	0.22
1235	0.22
1236	0.22
1237	0.23
1238	0.21
1239	0.22
1240	0.16
1241	0.13
1242	0.13
1243	0.12
1244	0.12
1245	0.11
1246	0.1
1247	0.09
1248	0.07
1249	0.07
1250	0.08
1251	0.09
1252	0.15
1253	0.16
1254	0.17
1255	0.21
1256	0.3
1257	0.36
1258	0.42
1259	0.46
1260	0.47
1261	0.53
1262	0.6
1263	0.66
1264	0.59
1265	0.6
1266	0.63
1267	0.68
1268	0.7
1269	0.72
1270	0.68
1271	0.66
1272	0.72
1273	0.76
1274	0.76
1275	0.71
1276	0.71
1277	0.66
1278	0.65
1279	0.66
1280	0.67
1281	0.66
1282	0.6
1283	0.6
1284	0.52
1285	0.49
1286	0.46
1287	0.39
1288	0.3
1289	0.2
1290	0.18
1291	0.13
1292	0.12
1293	0.12
1294	0.11
1295	0.1
1296	0.1
1297	0.11
1298	0.12
1299	0.19
1300	0.25
1301	0.31
1302	0.4
1303	0.47
1304	0.58
1305	0.66
1306	0.74
1307	0.76
1308	0.81
1309	0.8
1310	0.74
1311	0.74
1312	0.68
1313	0.66
1314	0.58
1315	0.56
1316	0.5
1317	0.44

A0A401GYE9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer