FuNGI

A0A401GKR6

Protein Details

Accession

A0A401GKR6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
122-151	AKHADTKSKSKGKDKDKKKKGKCTFCGYTG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-143	DTKSKSKGKDKDKKKKGK
748-749	RR

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 6, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MYSMTAQDAWEKLNRCYEGRGKQTLAYLISDLFRSTLSDESPLEPQLNTMRQKAHILETLGLTLDDTLIAIAMAISLPPSYSTLRTILMASDSKLTVEKVVNEVLSKEKRRGETTAASALIAKHADTKSKSKGKDKDKKKKGKCTFCGYTGHTKDECQKFKASQVEGATAKGDKKAEKAADAKESAKIASVGEADSETLRLFVAEELARGDDLHRWIVDSGASSHMTSHREWFVNYRALATSKRVYLGDERFILAIGISQVTLRAAVDHGSTNTGIVQEVLHVPDLNGNLLSVSQFDRNSYDVRFADGTCRISNAQGRLSAIGYMQRNLYVLDVTTQLPERTYILQAEDLPPSYDDSMDDPPLHAFVAKETTSSASAQVWHRCLGHISVDSVLKMVRKGMVKGMSIVGEKVSNVTCKPCLHGKQTRQPIPKESDVENPCVLHRTYSDVCGPMQTQTRSGHRYFITFIDGHTHHLVANLMKMKDEALSHFKAFVERAEVETGQRANILRTDGGGEYESKEFEAYLKEKGIHHEKTNAYTPQENGVSERMNRTIEEMARSMLNDAGLPNTYWGDAVLHAVHILNSVPTCTLPDNLTPHEAHTGNKPSMAHLRVFGCKAYVHVPKEKRQKLDSKMFECTHLGFAANRKAYRLVHRATGCIVKSRDVYFDEGTEVAPSHITIDVTPMQEAPDVRPQLPPSPRPPRPTVEDVPDEDEDAPALLDVNDSDDEDDDDSADENSNDDVPLPEIRRRRHAARAAQPPPPPPPAPELCRSGRMRTAPVAADDDRYFMSSYTRKPKGQDDVEGLDFNETFAPVAKFASVRTLLALAAKLDLEIHQMDVKSAFLNGDLDEEIYMKVPSGFRRSNSLVWKLNKALYGLKQAGREWYKKIRAEFEALGFTRCHSDHSVFYKNDDGILLIIAIYVDDMLILSDNLTAVTTLKEDLKSRFEMTDLGEARWLLGMEIARDRPRRVLELSQHQYVEKCLAQHGMADCCPVSTPMAQNQKLVKLSEAEIDPKPYQSVLGSLMYAMIGTRPDLAFTMGALSQHAATPGKEHWIALMRVYRYLRGTADKKLVYCGTTKEKEPLLGYVDADWAVNINDCRLVTGFVFLISEGAVSWSSKRQHSTAQSSTEAEYMAGAHGTKEAVWLRAFLSEIGQVQKGPTPLLIDNQSTIALSKNAAFHEHTKHIAVRYHFICEKYDSGEIKPEYVPTGNQVADVLTKGLPREKHEKFSAGMGLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.35
3	0.41
4	0.47
5	0.51
6	0.56
7	0.59
8	0.53
9	0.53
10	0.55
11	0.52
12	0.45
13	0.37
14	0.3
15	0.25
16	0.24
17	0.22
18	0.18
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.13
23	0.14
24	0.14
25	0.17
26	0.19
27	0.21
28	0.23
29	0.24
30	0.23
31	0.2
32	0.22
33	0.26
34	0.31
35	0.33
36	0.35
37	0.37
38	0.38
39	0.43
40	0.44
41	0.41
42	0.39
43	0.38
44	0.35
45	0.33
46	0.31
47	0.26
48	0.23
49	0.17
50	0.12
51	0.09
52	0.07
53	0.06
54	0.05
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.03
59	0.03
60	0.03
61	0.03
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.06
66	0.08
67	0.11
68	0.13
69	0.16
70	0.18
71	0.19
72	0.2
73	0.19
74	0.18
75	0.2
76	0.2
77	0.18
78	0.2
79	0.18
80	0.18
81	0.19
82	0.19
83	0.18
84	0.19
85	0.2
86	0.2
87	0.23
88	0.23
89	0.22
90	0.23
91	0.27
92	0.33
93	0.35
94	0.38
95	0.42
96	0.46
97	0.5
98	0.53
99	0.51
100	0.49
101	0.51
102	0.5
103	0.44
104	0.39
105	0.37
106	0.32
107	0.28
108	0.22
109	0.17
110	0.18
111	0.19
112	0.25
113	0.28
114	0.35
115	0.42
116	0.5
117	0.57
118	0.6
119	0.68
120	0.72
121	0.79
122	0.83
123	0.84
124	0.87
125	0.91
126	0.92
127	0.94
128	0.93
129	0.94
130	0.91
131	0.89
132	0.85
133	0.79
134	0.75
135	0.69
136	0.69
137	0.62
138	0.6
139	0.5
140	0.47
141	0.52
142	0.55
143	0.54
144	0.47
145	0.49
146	0.45
147	0.51
148	0.56
149	0.49
150	0.45
151	0.42
152	0.45
153	0.39
154	0.38
155	0.33
156	0.27
157	0.26
158	0.24
159	0.25
160	0.21
161	0.23
162	0.3
163	0.31
164	0.34
165	0.39
166	0.39
167	0.43
168	0.44
169	0.42
170	0.37
171	0.36
172	0.3
173	0.26
174	0.22
175	0.16
176	0.15
177	0.15
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.07
189	0.06
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.11
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.12
198	0.12
199	0.14
200	0.16
201	0.15
202	0.15
203	0.16
204	0.16
205	0.16
206	0.13
207	0.13
208	0.14
209	0.15
210	0.14
211	0.15
212	0.19
213	0.2
214	0.2
215	0.23
216	0.25
217	0.25
218	0.26
219	0.29
220	0.31
221	0.34
222	0.34
223	0.31
224	0.27
225	0.28
226	0.29
227	0.3
228	0.28
229	0.23
230	0.25
231	0.24
232	0.25
233	0.3
234	0.32
235	0.32
236	0.3
237	0.29
238	0.26
239	0.26
240	0.23
241	0.16
242	0.12
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.07
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.09
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.1
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.07
280	0.08
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.14
285	0.16
286	0.18
287	0.18
288	0.22
289	0.19
290	0.22
291	0.22
292	0.2
293	0.23
294	0.25
295	0.27
296	0.21
297	0.23
298	0.21
299	0.23
300	0.27
301	0.25
302	0.24
303	0.23
304	0.23
305	0.22
306	0.22
307	0.19
308	0.15
309	0.18
310	0.16
311	0.16
312	0.15
313	0.14
314	0.14
315	0.14
316	0.14
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.11
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.14
330	0.14
331	0.14
332	0.15
333	0.16
334	0.17
335	0.17
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.14
340	0.13
341	0.12
342	0.11
343	0.12
344	0.15
345	0.15
346	0.15
347	0.14
348	0.14
349	0.14
350	0.13
351	0.1
352	0.08
353	0.08
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.14
359	0.14
360	0.15
361	0.15
362	0.1
363	0.14
364	0.19
365	0.23
366	0.23
367	0.23
368	0.23
369	0.23
370	0.23
371	0.21
372	0.2
373	0.16
374	0.15
375	0.16
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.14
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.14
385	0.15
386	0.2
387	0.23
388	0.23
389	0.24
390	0.24
391	0.22
392	0.2
393	0.19
394	0.14
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.11
401	0.13
402	0.16
403	0.16
404	0.19
405	0.25
406	0.29
407	0.36
408	0.44
409	0.5
410	0.56
411	0.65
412	0.71
413	0.7
414	0.68
415	0.66
416	0.64
417	0.6
418	0.54
419	0.47
420	0.47
421	0.43
422	0.43
423	0.38
424	0.32
425	0.27
426	0.26
427	0.24
428	0.16
429	0.14
430	0.17
431	0.17
432	0.19
433	0.21
434	0.19
435	0.19
436	0.19
437	0.19
438	0.16
439	0.2
440	0.18
441	0.21
442	0.23
443	0.28
444	0.32
445	0.32
446	0.34
447	0.29
448	0.3
449	0.27
450	0.25
451	0.23
452	0.19
453	0.18
454	0.19
455	0.19
456	0.2
457	0.19
458	0.18
459	0.15
460	0.16
461	0.16
462	0.11
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.14
467	0.14
468	0.14
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.15
473	0.18
474	0.18
475	0.19
476	0.18
477	0.18
478	0.18
479	0.15
480	0.14
481	0.12
482	0.14
483	0.15
484	0.15
485	0.14
486	0.16
487	0.16
488	0.12
489	0.13
490	0.11
491	0.1
492	0.11
493	0.12
494	0.09
495	0.09
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.09
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.08
508	0.11
509	0.1
510	0.12
511	0.13
512	0.15
513	0.16
514	0.21
515	0.27
516	0.26
517	0.27
518	0.32
519	0.32
520	0.33
521	0.38
522	0.35
523	0.3
524	0.29
525	0.28
526	0.24
527	0.24
528	0.21
529	0.17
530	0.17
531	0.16
532	0.16
533	0.17
534	0.15
535	0.14
536	0.14
537	0.15
538	0.16
539	0.16
540	0.17
541	0.15
542	0.14
543	0.14
544	0.14
545	0.12
546	0.09
547	0.08
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.08
577	0.11
578	0.13
579	0.14
580	0.17
581	0.16
582	0.16
583	0.19
584	0.18
585	0.16
586	0.19
587	0.23
588	0.2
589	0.22
590	0.21
591	0.19
592	0.24
593	0.25
594	0.2
595	0.17
596	0.2
597	0.2
598	0.2
599	0.18
600	0.14
601	0.12
602	0.13
603	0.16
604	0.19
605	0.2
606	0.27
607	0.31
608	0.38
609	0.48
610	0.52
611	0.51
612	0.5
613	0.56
614	0.56
615	0.62
616	0.61
617	0.54
618	0.55
619	0.51
620	0.48
621	0.41
622	0.34
623	0.25
624	0.18
625	0.16
626	0.1
627	0.13
628	0.17
629	0.19
630	0.18
631	0.18
632	0.2
633	0.21
634	0.27
635	0.3
636	0.26
637	0.3
638	0.3
639	0.3
640	0.29
641	0.31
642	0.25
643	0.25
644	0.24
645	0.2
646	0.21
647	0.21
648	0.22
649	0.19
650	0.22
651	0.17
652	0.16
653	0.15
654	0.13
655	0.13
656	0.11
657	0.09
658	0.06
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.08
666	0.1
667	0.11
668	0.11
669	0.1
670	0.1
671	0.11
672	0.12
673	0.12
674	0.16
675	0.17
676	0.18
677	0.2
678	0.21
679	0.27
680	0.31
681	0.32
682	0.34
683	0.43
684	0.47
685	0.51
686	0.53
687	0.5
688	0.52
689	0.55
690	0.49
691	0.45
692	0.42
693	0.38
694	0.38
695	0.34
696	0.29
697	0.22
698	0.18
699	0.13
700	0.1
701	0.08
702	0.04
703	0.04
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.05
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.1
729	0.12
730	0.16
731	0.22
732	0.25
733	0.32
734	0.37
735	0.4
736	0.45
737	0.51
738	0.56
739	0.59
740	0.67
741	0.63
742	0.64
743	0.62
744	0.57
745	0.53
746	0.48
747	0.4
748	0.31
749	0.33
750	0.32
751	0.34
752	0.35
753	0.36
754	0.33
755	0.4
756	0.4
757	0.37
758	0.37
759	0.35
760	0.34
761	0.3
762	0.31
763	0.24
764	0.24
765	0.25
766	0.21
767	0.21
768	0.19
769	0.18
770	0.15
771	0.15
772	0.14
773	0.1
774	0.14
775	0.15
776	0.21
777	0.3
778	0.35
779	0.36
780	0.38
781	0.44
782	0.49
783	0.48
784	0.47
785	0.42
786	0.4
787	0.4
788	0.38
789	0.32
790	0.23
791	0.19
792	0.15
793	0.11
794	0.07
795	0.05
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.13
804	0.12
805	0.11
806	0.12
807	0.12
808	0.11
809	0.12
810	0.12
811	0.08
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.07
818	0.07
819	0.08
820	0.09
821	0.09
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.08
826	0.08
827	0.07
828	0.06
829	0.07
830	0.07
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.07
837	0.07
838	0.07
839	0.06
840	0.08
841	0.09
842	0.13
843	0.2
844	0.22
845	0.23
846	0.3
847	0.33
848	0.38
849	0.42
850	0.46
851	0.46
852	0.46
853	0.49
854	0.45
855	0.44
856	0.39
857	0.35
858	0.32
859	0.27
860	0.31
861	0.31
862	0.31
863	0.31
864	0.3
865	0.37
866	0.38
867	0.37
868	0.36
869	0.41
870	0.46
871	0.48
872	0.5
873	0.48
874	0.45
875	0.48
876	0.44
877	0.37
878	0.35
879	0.31
880	0.3
881	0.24
882	0.22
883	0.2
884	0.19
885	0.2
886	0.17
887	0.19
888	0.23
889	0.29
890	0.37
891	0.34
892	0.35
893	0.36
894	0.33
895	0.31
896	0.26
897	0.2
898	0.12
899	0.11
900	0.09
901	0.05
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.03
906	0.03
907	0.02
908	0.02
909	0.02
910	0.02
911	0.03
912	0.03
913	0.03
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.05
919	0.05
920	0.06
921	0.06
922	0.07
923	0.1
924	0.12
925	0.15
926	0.18
927	0.22
928	0.24
929	0.25
930	0.24
931	0.23
932	0.22
933	0.22
934	0.27
935	0.25
936	0.22
937	0.22
938	0.21
939	0.2
940	0.19
941	0.17
942	0.08
943	0.09
944	0.09
945	0.1
946	0.13
947	0.17
948	0.22
949	0.25
950	0.27
951	0.3
952	0.32
953	0.34
954	0.35
955	0.39
956	0.41
957	0.49
958	0.53
959	0.51
960	0.49
961	0.46
962	0.43
963	0.36
964	0.32
965	0.23
966	0.18
967	0.16
968	0.17
969	0.16
970	0.19
971	0.21
972	0.2
973	0.19
974	0.19
975	0.18
976	0.16
977	0.17
978	0.14
979	0.13
980	0.12
981	0.16
982	0.22
983	0.32
984	0.33
985	0.37
986	0.39
987	0.43
988	0.43
989	0.41
990	0.34
991	0.27
992	0.27
993	0.27
994	0.26
995	0.24
996	0.23
997	0.27
998	0.27
999	0.25
1000	0.24
1001	0.2
1002	0.19
1003	0.15
1004	0.16
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.08
1013	0.06
1014	0.05
1015	0.06
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.09
1019	0.1
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.12
1024	0.1
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.12
1031	0.11
1032	0.1
1033	0.13
1034	0.14
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.18
1038	0.19
1039	0.24
1040	0.25
1041	0.26
1042	0.31
1043	0.26
1044	0.32
1045	0.33
1046	0.33
1047	0.29
1048	0.31
1049	0.3
1050	0.32
1051	0.35
1052	0.35
1053	0.42
1054	0.41
1055	0.4
1056	0.43
1057	0.41
1058	0.34
1059	0.34
1060	0.33
1061	0.35
1062	0.36
1063	0.37
1064	0.37
1065	0.38
1066	0.4
1067	0.38
1068	0.35
1069	0.3
1070	0.28
1071	0.26
1072	0.22
1073	0.21
1074	0.18
1075	0.16
1076	0.13
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.14
1085	0.14
1086	0.15
1087	0.13
1088	0.15
1089	0.14
1090	0.12
1091	0.12
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.08
1095	0.07
1096	0.05
1097	0.06
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.09
1101	0.16
1102	0.2
1103	0.25
1104	0.29
1105	0.3
1106	0.38
1107	0.47
1108	0.54
1109	0.53
1110	0.54
1111	0.53
1112	0.51
1113	0.49
1114	0.41
1115	0.33
1116	0.24
1117	0.17
1118	0.13
1119	0.1
1120	0.09
1121	0.08
1122	0.07
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.08
1126	0.13
1127	0.14
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.18
1131	0.18
1132	0.19
1133	0.2
1134	0.15
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.17
1138	0.19
1139	0.19
1140	0.17
1141	0.18
1142	0.21
1143	0.2
1144	0.18
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.19
1148	0.24
1149	0.27
1150	0.25
1151	0.25
1152	0.25
1153	0.24
1154	0.2
1155	0.19
1156	0.16
1157	0.13
1158	0.12
1159	0.14
1160	0.16
1161	0.17
1162	0.2
1163	0.23
1164	0.26
1165	0.33
1166	0.36
1167	0.36
1168	0.36
1169	0.39
1170	0.41
1171	0.44
1172	0.42
1173	0.42
1174	0.4
1175	0.45
1176	0.45
1177	0.42
1178	0.41
1179	0.39
1180	0.38
1181	0.34
1182	0.38
1183	0.33
1184	0.32
1185	0.39
1186	0.37
1187	0.35
1188	0.34
1189	0.31
1190	0.28
1191	0.28
1192	0.27
1193	0.22
1194	0.27
1195	0.24
1196	0.23
1197	0.22
1198	0.19
1199	0.19
1200	0.19
1201	0.17
1202	0.13
1203	0.14
1204	0.16
1205	0.22
1206	0.25
1207	0.3
1208	0.39
1209	0.43
1210	0.5
1211	0.53
1212	0.55
1213	0.5
1214	0.51

A0A401GKR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer