FuNGI

A0A401GB83

Protein Details

Accession

A0A401GB83

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-30	KGVACLFHPKKKKPGAPAPAPSKPE	Hydrophilic
56-82	GSTSAPSKARTPRPRRPKDDDDDERPP	Basic
183-211	DGKDKGKDKAPPPKKRFQKKTRQVFPVPE	Basic
630-651	GASGQGAPPRPKKRKAEVAAPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-24	KKKKPGAPAP
67-71	PRPRR
184-203	GKDKGKDKAPPPKKRFQKKT
370-372	KRK
636-644	APPRPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKNKGVACLFHPKKKKPGAPAPAPSKPETPAAGSSTDSSTSTSTPTPTPTSTPGSTSAPSKARTPRPRRPKDDDDDERPPPPQGPFVEYKLMSSARNGWKYDVMKFDSRKAVDITTWAPPVKLNRKDPHRSDGEATGAAVPQAVGPMLGPDGKPVIGADGKLVMVDAEGRPIRPGEVRADDGKDKGKDKAPPPKKRFQKKTRQVFPVPEEIRQLRKEERYPWVMEDSEQLEIWTGRMEEVAKAQTHGMFMPAQTAIFKFVPAHRWYKFQKKPNFYVMGLEEAELKQKEILKNGEPMRWLSRKRGGQPSESTMATFKSESAGSLAASGSLVYTAGQSFGPGGRRLKTVDSGTADLFGDDDDDEEGPSRKRKTKRELGAEGDVDELDFEEDFADDEEKIEPEADDEEAKEMEERLKRQYKNANKQREGYIDESDDDEEEESKLTGAGKTLQKTLRKLEKDGGYDDSDDERNPYASSEEEEEEEEPPVTQVGPAIIPPEPKVRPSSSQPAAVAPPLTNGTKTPSASQPLPQTKAELQSPSRATSPVPSHGGHSVVAMRATSPKVPKPKPSPSPRIGGPTSPTASRATSPIMGAGTGSRAGSPVAQSPTMTTGIPPKHSKRKATEEPTSPTGASGQGAPPRPKKRKAEVAAPDGVAADGVLEDRMVIEWLKNTPNATTRDCIHHFRSYLTDEGKKTRFTALVKEVAQLSKGVLVLRPAYRGGGAPSPPPVASPVAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.71
3	0.76
4	0.78
5	0.77
6	0.81
7	0.82
8	0.82
9	0.85
10	0.84
11	0.81
12	0.78
13	0.71
14	0.64
15	0.56
16	0.5
17	0.43
18	0.38
19	0.34
20	0.32
21	0.3
22	0.28
23	0.28
24	0.25
25	0.24
26	0.21
27	0.19
28	0.18
29	0.17
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.2
34	0.24
35	0.26
36	0.27
37	0.3
38	0.32
39	0.37
40	0.35
41	0.36
42	0.35
43	0.34
44	0.34
45	0.33
46	0.35
47	0.34
48	0.34
49	0.39
50	0.45
51	0.52
52	0.61
53	0.68
54	0.72
55	0.78
56	0.87
57	0.89
58	0.89
59	0.88
60	0.87
61	0.88
62	0.86
63	0.83
64	0.79
65	0.74
66	0.66
67	0.58
68	0.5
69	0.42
70	0.36
71	0.34
72	0.28
73	0.31
74	0.34
75	0.36
76	0.41
77	0.38
78	0.37
79	0.35
80	0.34
81	0.29
82	0.26
83	0.32
84	0.34
85	0.39
86	0.4
87	0.38
88	0.43
89	0.45
90	0.47
91	0.45
92	0.41
93	0.44
94	0.45
95	0.49
96	0.5
97	0.48
98	0.46
99	0.41
100	0.38
101	0.3
102	0.32
103	0.28
104	0.25
105	0.27
106	0.25
107	0.23
108	0.23
109	0.32
110	0.39
111	0.44
112	0.49
113	0.55
114	0.64
115	0.73
116	0.76
117	0.75
118	0.7
119	0.65
120	0.6
121	0.54
122	0.47
123	0.38
124	0.34
125	0.26
126	0.21
127	0.17
128	0.13
129	0.09
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.05
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.11
150	0.1
151	0.1
152	0.07
153	0.06
154	0.08
155	0.07
156	0.11
157	0.12
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.16
162	0.16
163	0.19
164	0.19
165	0.22
166	0.25
167	0.27
168	0.31
169	0.31
170	0.31
171	0.35
172	0.33
173	0.31
174	0.33
175	0.35
176	0.39
177	0.45
178	0.53
179	0.58
180	0.65
181	0.71
182	0.76
183	0.81
184	0.85
185	0.88
186	0.87
187	0.88
188	0.88
189	0.91
190	0.91
191	0.89
192	0.83
193	0.8
194	0.73
195	0.72
196	0.63
197	0.54
198	0.5
199	0.44
200	0.44
201	0.39
202	0.39
203	0.34
204	0.39
205	0.42
206	0.42
207	0.46
208	0.45
209	0.45
210	0.43
211	0.4
212	0.35
213	0.3
214	0.28
215	0.23
216	0.19
217	0.17
218	0.14
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.09
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.1
229	0.13
230	0.12
231	0.13
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.13
249	0.2
250	0.22
251	0.28
252	0.26
253	0.33
254	0.38
255	0.47
256	0.53
257	0.56
258	0.62
259	0.64
260	0.68
261	0.69
262	0.68
263	0.57
264	0.53
265	0.45
266	0.38
267	0.31
268	0.26
269	0.19
270	0.14
271	0.17
272	0.14
273	0.13
274	0.11
275	0.15
276	0.17
277	0.2
278	0.23
279	0.22
280	0.29
281	0.31
282	0.31
283	0.28
284	0.29
285	0.31
286	0.34
287	0.34
288	0.33
289	0.38
290	0.41
291	0.47
292	0.54
293	0.5
294	0.5
295	0.51
296	0.5
297	0.45
298	0.4
299	0.34
300	0.24
301	0.22
302	0.18
303	0.15
304	0.1
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.07
327	0.09
328	0.11
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.17
333	0.18
334	0.2
335	0.19
336	0.2
337	0.2
338	0.2
339	0.19
340	0.18
341	0.17
342	0.13
343	0.11
344	0.08
345	0.06
346	0.04
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.07
353	0.08
354	0.12
355	0.16
356	0.23
357	0.3
358	0.39
359	0.48
360	0.56
361	0.63
362	0.68
363	0.69
364	0.66
365	0.63
366	0.54
367	0.45
368	0.36
369	0.27
370	0.18
371	0.12
372	0.08
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.05
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.1
399	0.13
400	0.15
401	0.22
402	0.3
403	0.31
404	0.36
405	0.46
406	0.52
407	0.6
408	0.67
409	0.7
410	0.65
411	0.68
412	0.66
413	0.6
414	0.53
415	0.45
416	0.38
417	0.28
418	0.25
419	0.23
420	0.19
421	0.15
422	0.12
423	0.09
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.12
434	0.15
435	0.17
436	0.22
437	0.27
438	0.31
439	0.34
440	0.41
441	0.44
442	0.43
443	0.44
444	0.46
445	0.47
446	0.45
447	0.44
448	0.39
449	0.32
450	0.3
451	0.28
452	0.23
453	0.19
454	0.16
455	0.16
456	0.13
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.09
461	0.09
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.12
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.13
470	0.11
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.11
484	0.17
485	0.17
486	0.19
487	0.23
488	0.25
489	0.28
490	0.34
491	0.41
492	0.37
493	0.4
494	0.39
495	0.37
496	0.35
497	0.32
498	0.26
499	0.17
500	0.16
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.12
505	0.16
506	0.19
507	0.2
508	0.21
509	0.23
510	0.27
511	0.28
512	0.32
513	0.37
514	0.4
515	0.42
516	0.4
517	0.39
518	0.37
519	0.4
520	0.39
521	0.34
522	0.29
523	0.33
524	0.35
525	0.33
526	0.32
527	0.28
528	0.25
529	0.27
530	0.29
531	0.27
532	0.29
533	0.27
534	0.28
535	0.29
536	0.3
537	0.23
538	0.2
539	0.17
540	0.14
541	0.14
542	0.12
543	0.11
544	0.13
545	0.14
546	0.18
547	0.21
548	0.27
549	0.36
550	0.41
551	0.5
552	0.56
553	0.64
554	0.7
555	0.75
556	0.78
557	0.72
558	0.74
559	0.67
560	0.66
561	0.58
562	0.5
563	0.44
564	0.4
565	0.38
566	0.33
567	0.31
568	0.26
569	0.26
570	0.24
571	0.22
572	0.19
573	0.18
574	0.18
575	0.18
576	0.16
577	0.14
578	0.13
579	0.11
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.07
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.14
589	0.17
590	0.17
591	0.17
592	0.18
593	0.21
594	0.21
595	0.19
596	0.15
597	0.2
598	0.23
599	0.29
600	0.35
601	0.41
602	0.5
603	0.58
604	0.65
605	0.66
606	0.72
607	0.77
608	0.78
609	0.79
610	0.75
611	0.75
612	0.7
613	0.64
614	0.54
615	0.43
616	0.36
617	0.28
618	0.21
619	0.16
620	0.17
621	0.2
622	0.27
623	0.34
624	0.42
625	0.52
626	0.6
627	0.68
628	0.72
629	0.76
630	0.8
631	0.8
632	0.81
633	0.79
634	0.77
635	0.73
636	0.63
637	0.54
638	0.43
639	0.36
640	0.25
641	0.16
642	0.09
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.05
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.1
654	0.14
655	0.17
656	0.19
657	0.2
658	0.22
659	0.28
660	0.32
661	0.34
662	0.34
663	0.34
664	0.41
665	0.45
666	0.48
667	0.47
668	0.49
669	0.45
670	0.44
671	0.46
672	0.41
673	0.43
674	0.43
675	0.44
676	0.41
677	0.48
678	0.49
679	0.46
680	0.44
681	0.43
682	0.43
683	0.39
684	0.44
685	0.43
686	0.46
687	0.45
688	0.46
689	0.44
690	0.4
691	0.38
692	0.29
693	0.23
694	0.18
695	0.18
696	0.17
697	0.15
698	0.17
699	0.21
700	0.23
701	0.24
702	0.22
703	0.22
704	0.22
705	0.23
706	0.23
707	0.25
708	0.25
709	0.25
710	0.28
711	0.3
712	0.29
713	0.28
714	0.27

A0A401GB83

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer