FuNGI

A0A401GGW3

Protein Details

Accession

A0A401GGW3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1135-1159	MQTLHRRNEFKRKEEKRATQFFPRW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 8, plas 6, cyto_nucl 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MAAVGGDRAPRLTEGERKLLFDNEECLKCRNFFAGHKAAECTIGFPIKLTYHTLTQAMADAARRCIAKPVATVTVIDGHSTGPSVHPVTAVMGMSSFPITNMPLNVSNVLDDDNDSDAENSVSTTSPIPSSVAVSPVQISPLPDTTGDLAPLRIVHMTWRCSASGPEGSFPLMFDALIDHGSHTVLIREDYASKLALHRHRLPVTERVKLAMQSNGEHVVVELFEWVKLSLYDPSNFWSAKSVRAIIVPSLCCPVILGLPFLAHNRIVVDVESCTAVNKDSLYDLCNPARISELPTPPRTTLHESFTQVCSARSQVLNELKAICVQHTTCTAEHESTSDEHRIIATVREHLETLAASQRLRDLAKDITNEFLDVFAPIPHIDALPTNVYCSIVLKDAHQKLRTRYYSTPRKYKEAWSTLIQQHLDAGRIRPSNSAHASPTFLIPKADPIALPHWVNDYRALNANTVLDSHPLPRVEDILANCAKGKIWSKMDMMNSFFQTRVHPDDVHLTAVTTPLGLYEWLAMPMDTVQQHEQHIRLILGALHASSLYCNPKKCEFFVLHIDFLGHHISANGIEAQSSKVDKILQWPVPKSAMDVHAFLGIVRYISAFLPHLADYTSVLTPLTMKESNQAFLQWTGDHQAAFDAIKALVVSRECLTVIDHDNPGNNRIFITCDVSDWRTGATLSWGTTWESARPIAFDFMQLNSAKKNYPIHEKELLTVICALKKWRADLIGMPMQVYTDHQFMAQYDLTIVYIKGEDNTVADALSCLPPCTFPDEMPVEPLPPHMLWNTPTTSAVNAVLSIMTDSSVLEFIRREYLTDEFCKKVISNAPSTLGVMNANGLWYIGDCLLIPHIDDLHKCYTTLRDAYYWPNMRRDLEQSYIPSCAECQRNKSRTTKPAGLLHPLPVPDTQGNSIALDSIGPLPLNDGFDCILSITDCLHSDVRIIPTTTHITAEQLAVLFFDHWFCENGLPSDIVSDRDKLFISCFWKALHTLTGVCLKLSTAYHPETDGISEHSNKTINQAIRYHIRRNQKGWVRALPRIHFDIINSVNSSTSFSNFQICFGRAPRLIPPIVPNSSRSSPGAELDAKNLIDRITLDINKAKDNLFQAKVQQAEYANHSRGKDDVFTVGDHVMMQTLHRRNEFKRKEEKRATQFFPRWDGPYNVIDTHPEMSTYTLDLPNLPNVFPMFHASELKRHVPNDPTLFPSQELDQPGPIVTPDGLEEYFIDSIIDSRCRGKGNTSFGGQVTDRNMIAGSRDLPLKTAPHWTSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.42
3	0.42
4	0.44
5	0.45
6	0.45
7	0.43
8	0.36
9	0.36
10	0.35
11	0.38
12	0.37
13	0.38
14	0.37
15	0.36
16	0.36
17	0.36
18	0.33
19	0.34
20	0.41
21	0.46
22	0.46
23	0.46
24	0.47
25	0.42
26	0.4
27	0.35
28	0.28
29	0.23
30	0.23
31	0.2
32	0.19
33	0.22
34	0.2
35	0.22
36	0.25
37	0.24
38	0.25
39	0.28
40	0.28
41	0.25
42	0.24
43	0.24
44	0.19
45	0.18
46	0.19
47	0.18
48	0.19
49	0.22
50	0.22
51	0.21
52	0.27
53	0.3
54	0.29
55	0.3
56	0.34
57	0.35
58	0.35
59	0.34
60	0.29
61	0.31
62	0.27
63	0.24
64	0.19
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.14
69	0.09
70	0.13
71	0.15
72	0.15
73	0.14
74	0.15
75	0.16
76	0.18
77	0.16
78	0.12
79	0.1
80	0.1
81	0.11
82	0.11
83	0.09
84	0.07
85	0.08
86	0.1
87	0.12
88	0.13
89	0.16
90	0.18
91	0.21
92	0.22
93	0.21
94	0.2
95	0.18
96	0.18
97	0.15
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.11
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.12
115	0.13
116	0.12
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.15
121	0.16
122	0.16
123	0.16
124	0.17
125	0.15
126	0.15
127	0.16
128	0.18
129	0.18
130	0.17
131	0.18
132	0.19
133	0.19
134	0.2
135	0.17
136	0.15
137	0.14
138	0.14
139	0.14
140	0.11
141	0.1
142	0.16
143	0.21
144	0.24
145	0.27
146	0.29
147	0.28
148	0.29
149	0.3
150	0.28
151	0.3
152	0.28
153	0.26
154	0.25
155	0.26
156	0.25
157	0.23
158	0.2
159	0.13
160	0.11
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.09
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.13
177	0.14
178	0.15
179	0.14
180	0.14
181	0.17
182	0.24
183	0.29
184	0.35
185	0.4
186	0.47
187	0.49
188	0.53
189	0.53
190	0.55
191	0.54
192	0.52
193	0.46
194	0.4
195	0.4
196	0.38
197	0.37
198	0.32
199	0.28
200	0.23
201	0.25
202	0.25
203	0.23
204	0.2
205	0.18
206	0.13
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.09
217	0.13
218	0.16
219	0.18
220	0.18
221	0.2
222	0.24
223	0.24
224	0.23
225	0.24
226	0.22
227	0.26
228	0.29
229	0.28
230	0.25
231	0.27
232	0.28
233	0.23
234	0.28
235	0.23
236	0.21
237	0.22
238	0.21
239	0.18
240	0.17
241	0.15
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.11
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.11
269	0.13
270	0.16
271	0.2
272	0.2
273	0.24
274	0.23
275	0.21
276	0.24
277	0.22
278	0.24
279	0.27
280	0.34
281	0.37
282	0.4
283	0.43
284	0.41
285	0.42
286	0.42
287	0.42
288	0.38
289	0.37
290	0.38
291	0.38
292	0.4
293	0.39
294	0.37
295	0.3
296	0.27
297	0.23
298	0.2
299	0.21
300	0.19
301	0.19
302	0.23
303	0.29
304	0.29
305	0.29
306	0.28
307	0.24
308	0.26
309	0.25
310	0.18
311	0.15
312	0.14
313	0.15
314	0.17
315	0.2
316	0.18
317	0.21
318	0.23
319	0.2
320	0.2
321	0.19
322	0.18
323	0.16
324	0.19
325	0.17
326	0.15
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.13
331	0.16
332	0.14
333	0.16
334	0.17
335	0.18
336	0.18
337	0.17
338	0.17
339	0.13
340	0.13
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.15
346	0.17
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.18
351	0.21
352	0.23
353	0.23
354	0.23
355	0.23
356	0.22
357	0.19
358	0.15
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.14
382	0.22
383	0.28
384	0.34
385	0.38
386	0.41
387	0.43
388	0.53
389	0.54
390	0.51
391	0.52
392	0.56
393	0.62
394	0.66
395	0.71
396	0.64
397	0.67
398	0.63
399	0.64
400	0.64
401	0.59
402	0.55
403	0.48
404	0.52
405	0.48
406	0.5
407	0.42
408	0.32
409	0.29
410	0.26
411	0.25
412	0.19
413	0.17
414	0.18
415	0.2
416	0.21
417	0.21
418	0.23
419	0.27
420	0.29
421	0.3
422	0.26
423	0.25
424	0.26
425	0.24
426	0.25
427	0.2
428	0.17
429	0.16
430	0.14
431	0.16
432	0.16
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.15
437	0.17
438	0.18
439	0.15
440	0.17
441	0.18
442	0.19
443	0.2
444	0.19
445	0.17
446	0.23
447	0.23
448	0.2
449	0.2
450	0.19
451	0.15
452	0.15
453	0.14
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.15
464	0.14
465	0.17
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.15
470	0.14
471	0.15
472	0.18
473	0.18
474	0.21
475	0.24
476	0.26
477	0.3
478	0.33
479	0.32
480	0.32
481	0.28
482	0.27
483	0.24
484	0.23
485	0.19
486	0.17
487	0.18
488	0.2
489	0.2
490	0.19
491	0.19
492	0.24
493	0.24
494	0.24
495	0.2
496	0.15
497	0.12
498	0.13
499	0.11
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.08
514	0.07
515	0.09
516	0.1
517	0.11
518	0.13
519	0.15
520	0.15
521	0.14
522	0.14
523	0.12
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.07
535	0.13
536	0.16
537	0.17
538	0.2
539	0.27
540	0.29
541	0.3
542	0.32
543	0.27
544	0.29
545	0.36
546	0.36
547	0.3
548	0.28
549	0.27
550	0.21
551	0.21
552	0.18
553	0.09
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.07
559	0.06
560	0.04
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.07
565	0.08
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.09
570	0.13
571	0.2
572	0.23
573	0.26
574	0.27
575	0.28
576	0.29
577	0.28
578	0.24
579	0.2
580	0.19
581	0.17
582	0.17
583	0.15
584	0.14
585	0.14
586	0.13
587	0.11
588	0.07
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.06
595	0.05
596	0.06
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.1
611	0.08
612	0.09
613	0.14
614	0.15
615	0.16
616	0.15
617	0.16
618	0.12
619	0.12
620	0.13
621	0.08
622	0.08
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.06
631	0.05
632	0.04
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.07
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.08
644	0.09
645	0.12
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.15
650	0.16
651	0.18
652	0.16
653	0.13
654	0.11
655	0.11
656	0.12
657	0.11
658	0.15
659	0.12
660	0.12
661	0.14
662	0.15
663	0.15
664	0.13
665	0.12
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.09
675	0.11
676	0.11
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.1
684	0.09
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.13
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.13
693	0.12
694	0.15
695	0.19
696	0.18
697	0.28
698	0.3
699	0.35
700	0.4
701	0.4
702	0.37
703	0.38
704	0.35
705	0.25
706	0.24
707	0.19
708	0.14
709	0.14
710	0.15
711	0.14
712	0.15
713	0.15
714	0.15
715	0.16
716	0.15
717	0.17
718	0.22
719	0.22
720	0.21
721	0.2
722	0.18
723	0.17
724	0.16
725	0.15
726	0.11
727	0.08
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.09
732	0.12
733	0.11
734	0.09
735	0.08
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.08
740	0.05
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.08
754	0.08
755	0.07
756	0.08
757	0.08
758	0.09
759	0.14
760	0.13
761	0.11
762	0.17
763	0.2
764	0.2
765	0.22
766	0.22
767	0.18
768	0.17
769	0.18
770	0.15
771	0.11
772	0.13
773	0.1
774	0.11
775	0.12
776	0.15
777	0.16
778	0.15
779	0.15
780	0.15
781	0.14
782	0.14
783	0.13
784	0.1
785	0.08
786	0.08
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.04
795	0.05
796	0.05
797	0.06
798	0.06
799	0.07
800	0.12
801	0.12
802	0.12
803	0.13
804	0.16
805	0.19
806	0.23
807	0.26
808	0.22
809	0.22
810	0.23
811	0.2
812	0.22
813	0.25
814	0.25
815	0.25
816	0.26
817	0.27
818	0.27
819	0.28
820	0.23
821	0.17
822	0.13
823	0.09
824	0.08
825	0.06
826	0.06
827	0.05
828	0.05
829	0.04
830	0.04
831	0.05
832	0.04
833	0.05
834	0.05
835	0.05
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.07
841	0.08
842	0.09
843	0.12
844	0.16
845	0.16
846	0.16
847	0.17
848	0.18
849	0.21
850	0.23
851	0.21
852	0.19
853	0.21
854	0.25
855	0.32
856	0.37
857	0.35
858	0.38
859	0.38
860	0.38
861	0.39
862	0.39
863	0.35
864	0.3
865	0.31
866	0.28
867	0.27
868	0.26
869	0.24
870	0.19
871	0.16
872	0.2
873	0.24
874	0.24
875	0.31
876	0.4
877	0.45
878	0.51
879	0.57
880	0.6
881	0.62
882	0.67
883	0.66
884	0.61
885	0.64
886	0.61
887	0.59
888	0.51
889	0.45
890	0.4
891	0.32
892	0.29
893	0.21
894	0.22
895	0.17
896	0.18
897	0.16
898	0.16
899	0.16
900	0.15
901	0.15
902	0.12
903	0.1
904	0.08
905	0.08
906	0.07
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.07
911	0.08
912	0.1
913	0.09
914	0.1
915	0.09
916	0.1
917	0.1
918	0.09
919	0.08
920	0.06
921	0.07
922	0.06
923	0.07
924	0.08
925	0.1
926	0.11
927	0.1
928	0.12
929	0.15
930	0.17
931	0.18
932	0.18
933	0.16
934	0.19
935	0.23
936	0.22
937	0.2
938	0.17
939	0.17
940	0.17
941	0.17
942	0.14
943	0.1
944	0.09
945	0.08
946	0.08
947	0.07
948	0.06
949	0.06
950	0.06
951	0.07
952	0.09
953	0.09
954	0.11
955	0.12
956	0.14
957	0.14
958	0.14
959	0.13
960	0.14
961	0.14
962	0.15
963	0.15
964	0.16
965	0.15
966	0.17
967	0.17
968	0.16
969	0.17
970	0.18
971	0.22
972	0.22
973	0.23
974	0.22
975	0.23
976	0.24
977	0.24
978	0.22
979	0.18
980	0.16
981	0.17
982	0.22
983	0.21
984	0.19
985	0.17
986	0.15
987	0.16
988	0.16
989	0.17
990	0.17
991	0.19
992	0.19
993	0.2
994	0.21
995	0.19
996	0.19
997	0.16
998	0.15
999	0.16
1000	0.18
1001	0.18
1002	0.2
1003	0.21
1004	0.2
1005	0.23
1006	0.27
1007	0.27
1008	0.29
1009	0.3
1010	0.33
1011	0.4
1012	0.46
1013	0.49
1014	0.48
1015	0.56
1016	0.58
1017	0.59
1018	0.65
1019	0.64
1020	0.67
1021	0.66
1022	0.68
1023	0.63
1024	0.63
1025	0.66
1026	0.6
1027	0.55
1028	0.51
1029	0.47
1030	0.38
1031	0.33
1032	0.35
1033	0.3
1034	0.29
1035	0.26
1036	0.22
1037	0.2
1038	0.2
1039	0.22
1040	0.15
1041	0.15
1042	0.15
1043	0.15
1044	0.22
1045	0.21
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.25
1049	0.27
1050	0.26
1051	0.32
1052	0.27
1053	0.29
1054	0.31
1055	0.33
1056	0.32
1057	0.3
1058	0.33
1059	0.33
1060	0.37
1061	0.36
1062	0.34
1063	0.35
1064	0.37
1065	0.38
1066	0.34
1067	0.32
1068	0.29
1069	0.29
1070	0.31
1071	0.29
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.29
1075	0.25
1076	0.24
1077	0.23
1078	0.18
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.16
1082	0.19
1083	0.2
1084	0.23
1085	0.27
1086	0.29
1087	0.31
1088	0.31
1089	0.28
1090	0.26
1091	0.31
1092	0.35
1093	0.33
1094	0.33
1095	0.35
1096	0.38
1097	0.4
1098	0.36
1099	0.34
1100	0.29
1101	0.29
1102	0.34
1103	0.36
1104	0.34
1105	0.36
1106	0.36
1107	0.33
1108	0.32
1109	0.33
1110	0.28
1111	0.23
1112	0.23
1113	0.2
1114	0.2
1115	0.22
1116	0.2
1117	0.17
1118	0.15
1119	0.13
1120	0.1
1121	0.09
1122	0.1
1123	0.17
1124	0.22
1125	0.27
1126	0.32
1127	0.37
1128	0.43
1129	0.55
1130	0.62
1131	0.62
1132	0.67
1133	0.71
1134	0.77
1135	0.83
1136	0.86
1137	0.85
1138	0.86
1139	0.83
1140	0.82
1141	0.8
1142	0.74
1143	0.71
1144	0.65
1145	0.58
1146	0.54
1147	0.51
1148	0.45
1149	0.42
1150	0.41
1151	0.34
1152	0.31
1153	0.3
1154	0.27
1155	0.26
1156	0.22
1157	0.18
1158	0.15
1159	0.16
1160	0.16
1161	0.16
1162	0.17
1163	0.17
1164	0.17
1165	0.19
1166	0.2
1167	0.25
1168	0.25
1169	0.23
1170	0.21
1171	0.2
1172	0.21
1173	0.2
1174	0.23
1175	0.19
1176	0.2
1177	0.27
1178	0.26
1179	0.32
1180	0.37
1181	0.42
1182	0.42
1183	0.41
1184	0.44
1185	0.43
1186	0.5
1187	0.51
1188	0.48
1189	0.47
1190	0.46
1191	0.46
1192	0.42
1193	0.38
1194	0.32
1195	0.3
1196	0.32
1197	0.28
1198	0.25
1199	0.24
1200	0.23
1201	0.21
1202	0.19
1203	0.16
1204	0.11
1205	0.1
1206	0.1
1207	0.13
1208	0.12
1209	0.13
1210	0.13
1211	0.14
1212	0.14
1213	0.14
1214	0.12
1215	0.09
1216	0.12
1217	0.15
1218	0.17
1219	0.15
1220	0.19
1221	0.23
1222	0.26
1223	0.28
1224	0.34
1225	0.38
1226	0.44
1227	0.48
1228	0.47
1229	0.46
1230	0.43
1231	0.47
1232	0.39
1233	0.35
1234	0.31
1235	0.28
1236	0.25
1237	0.23
1238	0.23
1239	0.18
1240	0.2
1241	0.19
1242	0.17
1243	0.17
1244	0.2
1245	0.2
1246	0.21
1247	0.24
1248	0.25
1249	0.24
1250	0.32

A0A401GGW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer