Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A401H3G4

Protein Details
Accession A0A401H3G4    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
904-972IMDGRKRQLRTARVRKMNPSLQCQPHLQCTKVKSRDPSRKPCKARTGRSGSRRLKKRCKTFMTITRMISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-294DMRSRSRSKSRGRGAKS
938-960RDPSRKPCKARTGRSGSRRLKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSLTSESHLSHLNIVPKLAADGSNWITYKERMFTVMGSRGLLRHLQGTARRPPNPPPFPMPSPAQAAMTASMTPATAVSTTATTGTGTTTTSATTTPAARQAQSSMTPEEYLKTVEAAEQKLDEYVQKEYAARQQIYGTISDQLLLRVKKLGTAVDVWLAVQNEYESKSDMYSGALRTRLQNTKCEEGADVRAHLDTLAKMREELASMGAPISDADFSAHVFASLPETFSPLLQALSTAARVAKTTLSADDLLASILEEHDRRKAHLKPESALSVKADMRSRSRSKSRGRGAKSKDMECYNCGRKGHFSRDCWREGGGKEGQGPKDQSPKKDSSGSKNAKGKPAANAAVGDSATDHAFTATFDSTALAAKPSEVKVEVYDSGATRHMSPYRDAFVTFKAIGLKPITAADGRKFHATGEGTMRIEIPNGDQSTTVMLEDVLYAPEIAFALIPIARADTAGYSTTFENGECRLYSRRHSRTIGRIPSTNGLYKVEHPKSREVASVAEESKDECALVSLSVMDFHRRMGHIAPAIAEHLVCEGRVKGIQLTDKASPDKNCESCIQAKITRQPVPKEREGGRAKELGDRIHSDVWGPARTETLGGKRYFTSFTDDATRWTDLYLLRVKSGTFSAYKLFEARLKTQDGKAIKALQSDRGGEYLSQAFKDHLEVQGTISRLTVHDTPQHNGLAERINRTLPEHARAMLITAELPKSLWGEALMHAMWLKNRTSTRALDGKTPYEARYGKLPDLHDLHEFGAKVWVRIEDADKLESKARAGRFVGYSDESKGYCVYWPEKRSVSVERNVRFINQLIVADEAQPEGAKETVVLTSPATPSAPAQEPEYEPRTSETQAAPPATSPTASLTPSSDAAAKEPASAKSDSESGTGHSQRARKASAYVKRLNDGSGIMDGRKRQLRTARVRKMNPSLQCQPHLQCTKVKSRDPSRKPCKARTGRSGSRRLKKRCKTFMTITRMISLNRLRILTLSVQNSSSGSSTMQMAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.24
4 0.24
5 0.21
6 0.18
7 0.12
8 0.17
9 0.2
10 0.25
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.28
15 0.31
16 0.28
17 0.26
18 0.23
19 0.24
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.31
24 0.29
25 0.29
26 0.27
27 0.28
28 0.28
29 0.22
30 0.19
31 0.2
32 0.25
33 0.31
34 0.37
35 0.45
36 0.51
37 0.54
38 0.55
39 0.63
40 0.68
41 0.68
42 0.66
43 0.64
44 0.63
45 0.62
46 0.64
47 0.58
48 0.51
49 0.51
50 0.46
51 0.4
52 0.32
53 0.3
54 0.26
55 0.23
56 0.19
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.22
85 0.25
86 0.25
87 0.26
88 0.27
89 0.28
90 0.3
91 0.31
92 0.27
93 0.26
94 0.27
95 0.26
96 0.25
97 0.22
98 0.2
99 0.16
100 0.14
101 0.12
102 0.15
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.17
111 0.15
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.28
118 0.33
119 0.31
120 0.29
121 0.28
122 0.31
123 0.31
124 0.3
125 0.24
126 0.18
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.21
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.23
139 0.19
140 0.21
141 0.21
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.21
163 0.22
164 0.25
165 0.33
166 0.38
167 0.37
168 0.41
169 0.43
170 0.47
171 0.46
172 0.43
173 0.37
174 0.32
175 0.36
176 0.31
177 0.26
178 0.21
179 0.21
180 0.19
181 0.18
182 0.16
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.14
248 0.15
249 0.18
250 0.25
251 0.3
252 0.37
253 0.43
254 0.46
255 0.43
256 0.47
257 0.5
258 0.44
259 0.4
260 0.32
261 0.29
262 0.27
263 0.28
264 0.28
265 0.25
266 0.29
267 0.36
268 0.4
269 0.44
270 0.5
271 0.55
272 0.6
273 0.67
274 0.72
275 0.73
276 0.75
277 0.77
278 0.76
279 0.77
280 0.74
281 0.67
282 0.63
283 0.58
284 0.54
285 0.47
286 0.48
287 0.43
288 0.42
289 0.4
290 0.36
291 0.39
292 0.43
293 0.51
294 0.5
295 0.5
296 0.55
297 0.59
298 0.6
299 0.53
300 0.48
301 0.42
302 0.36
303 0.36
304 0.29
305 0.26
306 0.28
307 0.32
308 0.32
309 0.31
310 0.33
311 0.31
312 0.38
313 0.4
314 0.4
315 0.41
316 0.44
317 0.44
318 0.49
319 0.5
320 0.48
321 0.56
322 0.57
323 0.58
324 0.62
325 0.62
326 0.6
327 0.6
328 0.53
329 0.47
330 0.48
331 0.41
332 0.34
333 0.31
334 0.25
335 0.23
336 0.2
337 0.15
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.11
372 0.14
373 0.16
374 0.16
375 0.18
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.2
380 0.19
381 0.17
382 0.19
383 0.17
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.15
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.11
394 0.12
395 0.14
396 0.16
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.19
405 0.21
406 0.2
407 0.2
408 0.21
409 0.15
410 0.15
411 0.13
412 0.1
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.11
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.04
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.08
456 0.1
457 0.13
458 0.15
459 0.21
460 0.3
461 0.34
462 0.39
463 0.42
464 0.45
465 0.51
466 0.58
467 0.58
468 0.51
469 0.47
470 0.44
471 0.44
472 0.41
473 0.33
474 0.25
475 0.2
476 0.19
477 0.21
478 0.28
479 0.29
480 0.3
481 0.31
482 0.33
483 0.34
484 0.34
485 0.32
486 0.24
487 0.2
488 0.2
489 0.21
490 0.17
491 0.15
492 0.14
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.08
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.09
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.09
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.09
532 0.12
533 0.13
534 0.15
535 0.17
536 0.18
537 0.2
538 0.22
539 0.21
540 0.24
541 0.28
542 0.26
543 0.26
544 0.25
545 0.27
546 0.27
547 0.29
548 0.28
549 0.25
550 0.27
551 0.32
552 0.37
553 0.39
554 0.4
555 0.43
556 0.47
557 0.51
558 0.51
559 0.5
560 0.47
561 0.5
562 0.5
563 0.48
564 0.42
565 0.39
566 0.36
567 0.35
568 0.34
569 0.26
570 0.24
571 0.24
572 0.23
573 0.21
574 0.2
575 0.15
576 0.16
577 0.17
578 0.16
579 0.15
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.13
585 0.16
586 0.2
587 0.2
588 0.21
589 0.21
590 0.22
591 0.23
592 0.22
593 0.24
594 0.18
595 0.2
596 0.23
597 0.23
598 0.23
599 0.25
600 0.24
601 0.17
602 0.16
603 0.17
604 0.13
605 0.17
606 0.2
607 0.18
608 0.18
609 0.18
610 0.18
611 0.17
612 0.17
613 0.15
614 0.11
615 0.11
616 0.13
617 0.14
618 0.15
619 0.15
620 0.15
621 0.17
622 0.19
623 0.22
624 0.23
625 0.26
626 0.28
627 0.28
628 0.32
629 0.3
630 0.29
631 0.28
632 0.29
633 0.26
634 0.29
635 0.29
636 0.28
637 0.29
638 0.29
639 0.26
640 0.22
641 0.21
642 0.16
643 0.17
644 0.16
645 0.14
646 0.13
647 0.13
648 0.13
649 0.12
650 0.15
651 0.14
652 0.13
653 0.14
654 0.14
655 0.15
656 0.18
657 0.18
658 0.16
659 0.14
660 0.13
661 0.11
662 0.14
663 0.14
664 0.13
665 0.2
666 0.23
667 0.24
668 0.26
669 0.27
670 0.24
671 0.22
672 0.22
673 0.22
674 0.21
675 0.23
676 0.22
677 0.22
678 0.22
679 0.24
680 0.29
681 0.24
682 0.26
683 0.24
684 0.23
685 0.23
686 0.22
687 0.21
688 0.15
689 0.12
690 0.09
691 0.1
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.08
696 0.09
697 0.09
698 0.08
699 0.07
700 0.08
701 0.09
702 0.11
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.16
711 0.18
712 0.22
713 0.26
714 0.27
715 0.31
716 0.36
717 0.36
718 0.37
719 0.39
720 0.37
721 0.37
722 0.37
723 0.32
724 0.32
725 0.32
726 0.26
727 0.31
728 0.32
729 0.31
730 0.33
731 0.34
732 0.32
733 0.34
734 0.35
735 0.29
736 0.27
737 0.25
738 0.23
739 0.22
740 0.17
741 0.21
742 0.19
743 0.18
744 0.18
745 0.17
746 0.16
747 0.17
748 0.19
749 0.17
750 0.19
751 0.21
752 0.21
753 0.22
754 0.25
755 0.24
756 0.23
757 0.24
758 0.23
759 0.26
760 0.26
761 0.27
762 0.25
763 0.26
764 0.28
765 0.25
766 0.25
767 0.23
768 0.24
769 0.21
770 0.2
771 0.19
772 0.16
773 0.15
774 0.18
775 0.21
776 0.27
777 0.29
778 0.33
779 0.35
780 0.37
781 0.39
782 0.43
783 0.44
784 0.44
785 0.5
786 0.47
787 0.49
788 0.48
789 0.45
790 0.38
791 0.33
792 0.28
793 0.22
794 0.21
795 0.17
796 0.18
797 0.17
798 0.16
799 0.15
800 0.11
801 0.1
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.07
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.08
810 0.09
811 0.1
812 0.09
813 0.12
814 0.12
815 0.13
816 0.12
817 0.12
818 0.12
819 0.17
820 0.2
821 0.18
822 0.2
823 0.23
824 0.26
825 0.31
826 0.34
827 0.29
828 0.26
829 0.28
830 0.29
831 0.26
832 0.28
833 0.25
834 0.26
835 0.31
836 0.32
837 0.29
838 0.26
839 0.28
840 0.25
841 0.22
842 0.18
843 0.17
844 0.18
845 0.19
846 0.19
847 0.17
848 0.19
849 0.2
850 0.2
851 0.19
852 0.16
853 0.17
854 0.21
855 0.19
856 0.2
857 0.22
858 0.23
859 0.24
860 0.24
861 0.23
862 0.21
863 0.24
864 0.22
865 0.2
866 0.19
867 0.18
868 0.25
869 0.27
870 0.27
871 0.3
872 0.33
873 0.36
874 0.41
875 0.41
876 0.35
877 0.4
878 0.46
879 0.5
880 0.55
881 0.58
882 0.56
883 0.57
884 0.56
885 0.5
886 0.42
887 0.34
888 0.27
889 0.24
890 0.22
891 0.19
892 0.22
893 0.23
894 0.29
895 0.34
896 0.34
897 0.37
898 0.44
899 0.53
900 0.61
901 0.7
902 0.73
903 0.77
904 0.81
905 0.82
906 0.83
907 0.81
908 0.76
909 0.74
910 0.73
911 0.69
912 0.67
913 0.65
914 0.59
915 0.61
916 0.6
917 0.54
918 0.5
919 0.51
920 0.58
921 0.6
922 0.63
923 0.63
924 0.68
925 0.77
926 0.81
927 0.85
928 0.85
929 0.88
930 0.89
931 0.89
932 0.89
933 0.89
934 0.88
935 0.88
936 0.87
937 0.87
938 0.88
939 0.89
940 0.88
941 0.88
942 0.88
943 0.88
944 0.89
945 0.9
946 0.91
947 0.91
948 0.89
949 0.87
950 0.87
951 0.86
952 0.85
953 0.81
954 0.72
955 0.66
956 0.59
957 0.51
958 0.49
959 0.45
960 0.41
961 0.38
962 0.37
963 0.33
964 0.31
965 0.34
966 0.33
967 0.34
968 0.32
969 0.31
970 0.31
971 0.31
972 0.3
973 0.28
974 0.22
975 0.16
976 0.13
977 0.13