FuNGI

A0A401GYC1

Protein Details

Accession

A0A401GYC1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
950-970	ILTKSLPKPRHEKLTKKLGMP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSTSADNTSNSNAYRIPLLKEDNWLPWKRRVEAILNDKGLQEYVTGKTLKPQPSNDPANRAAREAEISAWGEKDLKAQNVIVLSLGDSQMVHIAGAKTAWAMWEQLRTVKEQRGQHGILALCWRFYRMQAKEEDNISSHITQLRQIQEQLHLMRKVVSDEDFRLILATSLLESWDSFLSSYFGAEGADNVHPQLTSQELIAIILDENRRRHERGERGQSSDQAMVAKGKKRPFGEYKKCSICGKPRHLGNECRHRDKVKCMNCGKFGHKATDCWAKGGGKAGQGPPMKQQKTECAYEAHEVESKEDEAKIAYDNDSDTVSLGSDGKIASFYEWFADSGTTSHITNRREVFTTYQALEDHAITGIGPQPMQALGRSTVDVKSEVGDRKVKFRLHGVLYALTAPNSLLSIMHLDDAGGRVLMEADEDLDNDPDKSNAKLVYIAMSAHGNADADEPKTLSDAKRSLEWPKWEQAVQTELNQLQGMETWELVEPPEDRKPIGNKWVLVKKTNKEGEIIKYKARLVAKGYSQIPGMDYTETFAPVVHLETIRAILGLAAILDWEIGQMDVKGAYLNGTLKEEVYMRQPKGYNDGTYRVCKLKKTLYRLKQSGREWNIVLNRKLLDAGFKHLFSDPCVYIRIKGDKIEIVTVWVDDLLIFTNDCALMDQLKRELRNMFEVTDLGEPQKIVGIEIERDRSKQTIKISQTKYIESILHKNGLTNANTVGMPLDPNTVLEKEEPETDDECDRDNGYASLIGSLMYTAIAMRPDIAHTVQRLSSFTANPGMAHWTAAKCVLRYLSGMRELGIIYGPIADVKPKDQSIFVGYSDADYANDIRDRKSISGYLFKLGNGMITWSSKKQTTVASSTTEAEYMASAEAAKEAMWLQTLFKEIGFEQQDPTILFEDNTVAISIARDPQFHAKSKHFDVKHHYVCEKLRDKYIDIHYCPTEDMIADILTKSLPKPRHEKLTKKLGMPIGLRGSVEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.28
4	0.3
5	0.35
6	0.35
7	0.4
8	0.42
9	0.45
10	0.51
11	0.54
12	0.53
13	0.55
14	0.6
15	0.57
16	0.59
17	0.56
18	0.55
19	0.58
20	0.63
21	0.63
22	0.59
23	0.56
24	0.51
25	0.46
26	0.39
27	0.29
28	0.21
29	0.16
30	0.15
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.27
35	0.35
36	0.42
37	0.45
38	0.48
39	0.52
40	0.6
41	0.7
42	0.67
43	0.66
44	0.63
45	0.66
46	0.62
47	0.55
48	0.47
49	0.39
50	0.37
51	0.31
52	0.26
53	0.21
54	0.21
55	0.21
56	0.19
57	0.18
58	0.17
59	0.16
60	0.22
61	0.23
62	0.24
63	0.25
64	0.25
65	0.27
66	0.26
67	0.26
68	0.19
69	0.14
70	0.13
71	0.12
72	0.12
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.07
88	0.09
89	0.11
90	0.16
91	0.17
92	0.22
93	0.23
94	0.27
95	0.31
96	0.36
97	0.41
98	0.42
99	0.47
100	0.5
101	0.5
102	0.46
103	0.46
104	0.4
105	0.35
106	0.37
107	0.32
108	0.25
109	0.24
110	0.25
111	0.21
112	0.25
113	0.32
114	0.29
115	0.34
116	0.39
117	0.44
118	0.46
119	0.48
120	0.45
121	0.37
122	0.35
123	0.33
124	0.27
125	0.24
126	0.23
127	0.21
128	0.22
129	0.27
130	0.29
131	0.28
132	0.3
133	0.31
134	0.31
135	0.37
136	0.38
137	0.39
138	0.35
139	0.33
140	0.33
141	0.32
142	0.3
143	0.26
144	0.25
145	0.22
146	0.23
147	0.26
148	0.23
149	0.21
150	0.2
151	0.17
152	0.14
153	0.11
154	0.08
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.06
159	0.06
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.07
190	0.1
191	0.13
192	0.17
193	0.19
194	0.25
195	0.3
196	0.31
197	0.35
198	0.41
199	0.48
200	0.54
201	0.63
202	0.61
203	0.64
204	0.65
205	0.63
206	0.57
207	0.47
208	0.38
209	0.28
210	0.24
211	0.23
212	0.25
213	0.28
214	0.3
215	0.34
216	0.39
217	0.4
218	0.47
219	0.52
220	0.58
221	0.64
222	0.66
223	0.7
224	0.7
225	0.71
226	0.66
227	0.63
228	0.62
229	0.61
230	0.62
231	0.61
232	0.59
233	0.64
234	0.67
235	0.68
236	0.68
237	0.69
238	0.67
239	0.67
240	0.67
241	0.63
242	0.61
243	0.62
244	0.63
245	0.6
246	0.63
247	0.63
248	0.65
249	0.67
250	0.68
251	0.62
252	0.6
253	0.54
254	0.52
255	0.47
256	0.42
257	0.41
258	0.46
259	0.42
260	0.35
261	0.36
262	0.28
263	0.28
264	0.32
265	0.29
266	0.22
267	0.26
268	0.25
269	0.3
270	0.31
271	0.31
272	0.34
273	0.41
274	0.39
275	0.39
276	0.4
277	0.41
278	0.44
279	0.46
280	0.39
281	0.31
282	0.33
283	0.33
284	0.31
285	0.24
286	0.23
287	0.2
288	0.2
289	0.19
290	0.17
291	0.15
292	0.14
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.13
329	0.18
330	0.19
331	0.24
332	0.26
333	0.26
334	0.27
335	0.29
336	0.28
337	0.27
338	0.29
339	0.25
340	0.23
341	0.21
342	0.2
343	0.2
344	0.16
345	0.12
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.12
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.14
369	0.16
370	0.18
371	0.23
372	0.23
373	0.28
374	0.33
375	0.34
376	0.3
377	0.33
378	0.36
379	0.32
380	0.34
381	0.3
382	0.25
383	0.24
384	0.24
385	0.2
386	0.14
387	0.11
388	0.08
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.03
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.09
443	0.08
444	0.12
445	0.14
446	0.14
447	0.17
448	0.19
449	0.23
450	0.26
451	0.31
452	0.29
453	0.3
454	0.31
455	0.29
456	0.28
457	0.25
458	0.24
459	0.2
460	0.18
461	0.17
462	0.15
463	0.15
464	0.15
465	0.13
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.09
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.15
482	0.19
483	0.21
484	0.28
485	0.27
486	0.26
487	0.31
488	0.37
489	0.36
490	0.38
491	0.41
492	0.36
493	0.42
494	0.44
495	0.38
496	0.34
497	0.35
498	0.36
499	0.38
500	0.37
501	0.3
502	0.29
503	0.29
504	0.31
505	0.29
506	0.24
507	0.2
508	0.22
509	0.22
510	0.26
511	0.26
512	0.23
513	0.22
514	0.21
515	0.18
516	0.14
517	0.14
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.06
534	0.06
535	0.05
536	0.04
537	0.04
538	0.03
539	0.03
540	0.02
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.05
557	0.06
558	0.07
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.16
566	0.22
567	0.21
568	0.25
569	0.27
570	0.27
571	0.32
572	0.34
573	0.3
574	0.26
575	0.31
576	0.3
577	0.3
578	0.33
579	0.32
580	0.31
581	0.29
582	0.31
583	0.35
584	0.39
585	0.45
586	0.53
587	0.56
588	0.64
589	0.69
590	0.71
591	0.69
592	0.67
593	0.68
594	0.62
595	0.56
596	0.47
597	0.46
598	0.46
599	0.45
600	0.41
601	0.34
602	0.3
603	0.27
604	0.27
605	0.22
606	0.2
607	0.15
608	0.2
609	0.19
610	0.19
611	0.2
612	0.22
613	0.22
614	0.19
615	0.23
616	0.18
617	0.17
618	0.19
619	0.19
620	0.18
621	0.23
622	0.26
623	0.23
624	0.24
625	0.25
626	0.24
627	0.25
628	0.24
629	0.19
630	0.15
631	0.14
632	0.12
633	0.1
634	0.08
635	0.07
636	0.05
637	0.06
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.04
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.08
648	0.09
649	0.11
650	0.15
651	0.19
652	0.19
653	0.21
654	0.23
655	0.22
656	0.27
657	0.28
658	0.23
659	0.21
660	0.2
661	0.2
662	0.19
663	0.17
664	0.12
665	0.11
666	0.1
667	0.09
668	0.11
669	0.09
670	0.08
671	0.09
672	0.1
673	0.12
674	0.15
675	0.2
676	0.18
677	0.19
678	0.21
679	0.22
680	0.23
681	0.25
682	0.29
683	0.32
684	0.38
685	0.47
686	0.49
687	0.54
688	0.54
689	0.51
690	0.47
691	0.41
692	0.37
693	0.31
694	0.34
695	0.3
696	0.31
697	0.29
698	0.29
699	0.31
700	0.32
701	0.3
702	0.24
703	0.22
704	0.19
705	0.19
706	0.18
707	0.14
708	0.1
709	0.09
710	0.08
711	0.1
712	0.08
713	0.09
714	0.11
715	0.11
716	0.12
717	0.12
718	0.14
719	0.13
720	0.16
721	0.16
722	0.16
723	0.17
724	0.18
725	0.19
726	0.18
727	0.18
728	0.17
729	0.17
730	0.14
731	0.14
732	0.13
733	0.11
734	0.12
735	0.11
736	0.1
737	0.09
738	0.09
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.06
749	0.07
750	0.08
751	0.1
752	0.12
753	0.14
754	0.14
755	0.17
756	0.18
757	0.19
758	0.19
759	0.2
760	0.23
761	0.2
762	0.21
763	0.23
764	0.21
765	0.2
766	0.2
767	0.2
768	0.17
769	0.17
770	0.18
771	0.14
772	0.15
773	0.2
774	0.21
775	0.17
776	0.19
777	0.19
778	0.18
779	0.19
780	0.21
781	0.21
782	0.24
783	0.23
784	0.21
785	0.21
786	0.2
787	0.19
788	0.16
789	0.11
790	0.07
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.09
796	0.09
797	0.12
798	0.17
799	0.18
800	0.19
801	0.19
802	0.21
803	0.23
804	0.24
805	0.22
806	0.19
807	0.18
808	0.17
809	0.17
810	0.16
811	0.11
812	0.1
813	0.1
814	0.12
815	0.16
816	0.16
817	0.17
818	0.2
819	0.23
820	0.23
821	0.27
822	0.28
823	0.28
824	0.36
825	0.36
826	0.36
827	0.34
828	0.32
829	0.3
830	0.25
831	0.22
832	0.13
833	0.14
834	0.12
835	0.14
836	0.18
837	0.19
838	0.23
839	0.24
840	0.25
841	0.26
842	0.3
843	0.33
844	0.36
845	0.35
846	0.36
847	0.36
848	0.36
849	0.34
850	0.28
851	0.22
852	0.16
853	0.14
854	0.11
855	0.09
856	0.07
857	0.06
858	0.06
859	0.06
860	0.06
861	0.06
862	0.06
863	0.06
864	0.07
865	0.09
866	0.09
867	0.1
868	0.12
869	0.15
870	0.14
871	0.14
872	0.15
873	0.14
874	0.22
875	0.24
876	0.23
877	0.22
878	0.23
879	0.25
880	0.24
881	0.26
882	0.19
883	0.16
884	0.15
885	0.14
886	0.15
887	0.13
888	0.13
889	0.11
890	0.09
891	0.09
892	0.1
893	0.11
894	0.16
895	0.17
896	0.17
897	0.2
898	0.3
899	0.35
900	0.41
901	0.45
902	0.46
903	0.52
904	0.59
905	0.66
906	0.58
907	0.59
908	0.62
909	0.67
910	0.68
911	0.67
912	0.61
913	0.58
914	0.6
915	0.64
916	0.63
917	0.56
918	0.56
919	0.53
920	0.54
921	0.56
922	0.62
923	0.61
924	0.56
925	0.58
926	0.51
927	0.48
928	0.46
929	0.38
930	0.29
931	0.2
932	0.18
933	0.13
934	0.12
935	0.11
936	0.11
937	0.1
938	0.1
939	0.11
940	0.12
941	0.18
942	0.24
943	0.31
944	0.4
945	0.47
946	0.58
947	0.66
948	0.74
949	0.76
950	0.81
951	0.8
952	0.74
953	0.74
954	0.68
955	0.66
956	0.58
957	0.56
958	0.5
959	0.45

A0A401GYC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer