FuNGI

A0A401GCZ4

Protein Details

Accession

A0A401GCZ4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-34	GHRAPECPSKKQFYQRPKKSEAAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 19, E.R. 3, vacu 2, mito 1, cyto 1, golg 1, cyto_mito 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MVIEAVCGGKGHRAPECPSKKQFYQRPKKSEAASTSVNVTDGKTKADAKPKDGAMKESSTSVAVTAPVPSVHIEEAWSACTSFSPLCEEEIVIDCSDFAVQEEIRISDAHQAFGSVLETGHRIDIFDSGASRHMTLHLDRLSNFHTTMPHWIHAANSEIFYSHGIGDLLMHLPAENSGKHIRLKSVLHAPAMHATLISLGLIEAAGFSWLGHEGELTIINRQNDVIVSVPHNDNLYQIFYDSSLASLATAPVQLSLFKIHKRLGHINYGYIKDMLQQNHLTGIALDPHNSKTVKCKTCLIAKAHCAPIASVRRSPLTEKFGEHLHMDIWGPATVFIIDRCKYVLTIVDDVTRWLEMPLMRVKFEAFGKYVSIEAHLQTQDGVHVKIVQSDHGGEFLSAVMDSHLERAGTIRKLTVHDTPEHNGVAERTHLTVFNGIRAALACSGLPKWLWGEALAYVVYVYNRTARCALQGQSPFEVHYGHTPDISNLHEWGSTVFVTVATDSKFDARGHEVCWIGLDRMSNGHRIYWLKERKISVERNIVFSSESPHVEGEHDFDIGPTSNISDATLPPPKHPRYVPESECSPMLEPGEIREPEHPNIVTTESALTEITIDENDECEVLAYLVGVAASDSLGFDPRTITEAKRRPDWPEWQEAMHDEIRRLESRKAWVYMDPPSRLSGQNVVSSKWVFHMKRNARGEVTGYRARLVAQGFTQVKGVNYFSDDTYAAVCKLASICVILSVAAHNGWFTHQVDVKSTYLYGKLRDDEKIYMQPPSDIELDGLKPGQILLLLIALYGLHQSGRCWYIRLCKILEGFKLVRLEHDHTVFYWRHPDGEISIIFLHIDDMTLVCLLLANLLHLKVMIKSELEITDNGELHWLLRIEVRRNLEKHTIALSQWAYIDSIIACYGFSDAKPLSQPMDPHVRLFVDQCPVSTAEYATMRDKPYLEALGALQYVSIATRPDITFAVGQLAQFGRNPGIAHWSALKCIYQYLKGTVDIWLMLGSSEDNDIVGYSDADGMSTEGHRAISGYIFMLNGGAVSWSSKCQNLVTLSTTEAKYVALTHTSKEAIRLRSFIKKLFGDPEHPLPLCSNNQSTIALAKDDRFHARTTSVLHKQQQTAQW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.46
3	0.54
4	0.56
5	0.62
6	0.66
7	0.69
8	0.75
9	0.79
10	0.79
11	0.82
12	0.83
13	0.85
14	0.83
15	0.83
16	0.77
17	0.76
18	0.71
19	0.65
20	0.59
21	0.51
22	0.47
23	0.41
24	0.37
25	0.28
26	0.24
27	0.24
28	0.21
29	0.23
30	0.23
31	0.27
32	0.33
33	0.42
34	0.45
35	0.44
36	0.51
37	0.52
38	0.58
39	0.55
40	0.53
41	0.48
42	0.48
43	0.44
44	0.38
45	0.34
46	0.26
47	0.24
48	0.19
49	0.15
50	0.12
51	0.12
52	0.11
53	0.11
54	0.1
55	0.11
56	0.12
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.13
62	0.14
63	0.15
64	0.15
65	0.13
66	0.12
67	0.12
68	0.14
69	0.12
70	0.13
71	0.16
72	0.16
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.18
77	0.21
78	0.22
79	0.16
80	0.15
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.1
85	0.08
86	0.1
87	0.09
88	0.11
89	0.13
90	0.13
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.2
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.18
99	0.17
100	0.18
101	0.18
102	0.09
103	0.08
104	0.08
105	0.09
106	0.1
107	0.11
108	0.11
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.15
117	0.15
118	0.15
119	0.14
120	0.16
121	0.18
122	0.19
123	0.25
124	0.26
125	0.27
126	0.27
127	0.3
128	0.3
129	0.29
130	0.28
131	0.23
132	0.21
133	0.2
134	0.28
135	0.29
136	0.27
137	0.26
138	0.25
139	0.24
140	0.24
141	0.27
142	0.2
143	0.17
144	0.16
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.06
159	0.07
160	0.09
161	0.11
162	0.09
163	0.13
164	0.16
165	0.2
166	0.24
167	0.26
168	0.28
169	0.31
170	0.33
171	0.35
172	0.41
173	0.41
174	0.39
175	0.38
176	0.36
177	0.34
178	0.33
179	0.27
180	0.17
181	0.14
182	0.12
183	0.12
184	0.1
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.04
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.16
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.16
210	0.13
211	0.14
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.16
216	0.17
217	0.17
218	0.18
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.16
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.12
228	0.11
229	0.09
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.13
243	0.16
244	0.18
245	0.22
246	0.25
247	0.28
248	0.34
249	0.42
250	0.41
251	0.47
252	0.45
253	0.47
254	0.48
255	0.47
256	0.41
257	0.33
258	0.29
259	0.23
260	0.28
261	0.24
262	0.24
263	0.23
264	0.22
265	0.23
266	0.23
267	0.19
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.12
272	0.14
273	0.14
274	0.15
275	0.19
276	0.2
277	0.19
278	0.24
279	0.34
280	0.37
281	0.38
282	0.42
283	0.42
284	0.5
285	0.57
286	0.53
287	0.49
288	0.5
289	0.54
290	0.51
291	0.48
292	0.4
293	0.33
294	0.36
295	0.38
296	0.36
297	0.31
298	0.31
299	0.32
300	0.34
301	0.37
302	0.35
303	0.32
304	0.31
305	0.31
306	0.3
307	0.3
308	0.3
309	0.27
310	0.21
311	0.15
312	0.14
313	0.12
314	0.11
315	0.11
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.13
324	0.13
325	0.13
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.14
330	0.17
331	0.15
332	0.17
333	0.18
334	0.19
335	0.18
336	0.19
337	0.19
338	0.14
339	0.1
340	0.08
341	0.1
342	0.08
343	0.12
344	0.18
345	0.19
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.2
350	0.21
351	0.2
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.15
356	0.15
357	0.12
358	0.13
359	0.11
360	0.11
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.13
369	0.09
370	0.11
371	0.11
372	0.14
373	0.14
374	0.13
375	0.12
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.12
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.08
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.14
398	0.16
399	0.18
400	0.21
401	0.24
402	0.22
403	0.24
404	0.27
405	0.28
406	0.29
407	0.27
408	0.24
409	0.2
410	0.17
411	0.14
412	0.12
413	0.11
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.15
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.08
427	0.08
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.07
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.06
448	0.1
449	0.1
450	0.12
451	0.14
452	0.13
453	0.16
454	0.19
455	0.2
456	0.22
457	0.25
458	0.26
459	0.26
460	0.26
461	0.24
462	0.21
463	0.2
464	0.14
465	0.14
466	0.15
467	0.14
468	0.14
469	0.14
470	0.14
471	0.15
472	0.16
473	0.13
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.14
495	0.15
496	0.15
497	0.19
498	0.18
499	0.15
500	0.16
501	0.15
502	0.11
503	0.11
504	0.11
505	0.07
506	0.1
507	0.11
508	0.14
509	0.13
510	0.13
511	0.15
512	0.16
513	0.19
514	0.25
515	0.31
516	0.31
517	0.34
518	0.35
519	0.37
520	0.43
521	0.44
522	0.4
523	0.43
524	0.41
525	0.41
526	0.4
527	0.35
528	0.29
529	0.25
530	0.23
531	0.15
532	0.15
533	0.12
534	0.11
535	0.11
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.09
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.09
554	0.15
555	0.15
556	0.18
557	0.26
558	0.27
559	0.3
560	0.31
561	0.32
562	0.34
563	0.41
564	0.41
565	0.36
566	0.36
567	0.33
568	0.33
569	0.29
570	0.22
571	0.15
572	0.13
573	0.1
574	0.08
575	0.09
576	0.14
577	0.13
578	0.13
579	0.17
580	0.2
581	0.2
582	0.23
583	0.21
584	0.16
585	0.17
586	0.18
587	0.13
588	0.1
589	0.1
590	0.07
591	0.08
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.04
598	0.05
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.02
613	0.02
614	0.02
615	0.02
616	0.02
617	0.03
618	0.03
619	0.04
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.08
625	0.09
626	0.11
627	0.19
628	0.25
629	0.28
630	0.34
631	0.35
632	0.39
633	0.44
634	0.51
635	0.46
636	0.48
637	0.46
638	0.41
639	0.4
640	0.35
641	0.33
642	0.27
643	0.24
644	0.16
645	0.16
646	0.19
647	0.2
648	0.22
649	0.21
650	0.21
651	0.26
652	0.29
653	0.29
654	0.28
655	0.28
656	0.27
657	0.33
658	0.35
659	0.3
660	0.27
661	0.27
662	0.28
663	0.27
664	0.26
665	0.23
666	0.2
667	0.24
668	0.23
669	0.23
670	0.23
671	0.22
672	0.21
673	0.18
674	0.24
675	0.2
676	0.24
677	0.34
678	0.38
679	0.47
680	0.51
681	0.51
682	0.44
683	0.44
684	0.42
685	0.35
686	0.35
687	0.29
688	0.25
689	0.23
690	0.22
691	0.22
692	0.21
693	0.19
694	0.14
695	0.11
696	0.18
697	0.18
698	0.18
699	0.19
700	0.17
701	0.16
702	0.17
703	0.17
704	0.1
705	0.11
706	0.12
707	0.11
708	0.12
709	0.12
710	0.1
711	0.11
712	0.11
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.06
720	0.06
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.06
733	0.09
734	0.09
735	0.12
736	0.15
737	0.16
738	0.19
739	0.22
740	0.22
741	0.19
742	0.19
743	0.16
744	0.17
745	0.18
746	0.18
747	0.18
748	0.21
749	0.22
750	0.24
751	0.26
752	0.24
753	0.26
754	0.3
755	0.28
756	0.27
757	0.25
758	0.24
759	0.22
760	0.23
761	0.2
762	0.14
763	0.13
764	0.13
765	0.13
766	0.13
767	0.12
768	0.09
769	0.08
770	0.08
771	0.07
772	0.05
773	0.05
774	0.04
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.05
786	0.08
787	0.11
788	0.12
789	0.14
790	0.16
791	0.25
792	0.3
793	0.34
794	0.32
795	0.33
796	0.36
797	0.38
798	0.37
799	0.34
800	0.29
801	0.29
802	0.31
803	0.27
804	0.27
805	0.27
806	0.3
807	0.28
808	0.29
809	0.25
810	0.23
811	0.29
812	0.26
813	0.23
814	0.26
815	0.22
816	0.21
817	0.22
818	0.22
819	0.18
820	0.22
821	0.2
822	0.16
823	0.15
824	0.14
825	0.13
826	0.12
827	0.11
828	0.07
829	0.07
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.05
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.05
839	0.05
840	0.05
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.08
846	0.08
847	0.1
848	0.1
849	0.09
850	0.1
851	0.12
852	0.13
853	0.14
854	0.13
855	0.14
856	0.16
857	0.16
858	0.15
859	0.14
860	0.13
861	0.11
862	0.14
863	0.12
864	0.09
865	0.13
866	0.18
867	0.21
868	0.27
869	0.32
870	0.37
871	0.38
872	0.43
873	0.46
874	0.42
875	0.4
876	0.38
877	0.35
878	0.28
879	0.32
880	0.27
881	0.21
882	0.2
883	0.18
884	0.15
885	0.13
886	0.13
887	0.08
888	0.08
889	0.07
890	0.07
891	0.06
892	0.06
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.11
897	0.11
898	0.13
899	0.15
900	0.16
901	0.18
902	0.2
903	0.21
904	0.21
905	0.32
906	0.3
907	0.29
908	0.31
909	0.29
910	0.27
911	0.29
912	0.28
913	0.24
914	0.23
915	0.22
916	0.22
917	0.22
918	0.22
919	0.21
920	0.18
921	0.15
922	0.17
923	0.19
924	0.2
925	0.23
926	0.23
927	0.25
928	0.25
929	0.23
930	0.25
931	0.24
932	0.21
933	0.18
934	0.17
935	0.17
936	0.16
937	0.14
938	0.1
939	0.08
940	0.08
941	0.07
942	0.08
943	0.06
944	0.06
945	0.11
946	0.12
947	0.14
948	0.14
949	0.16
950	0.16
951	0.15
952	0.19
953	0.15
954	0.15
955	0.16
956	0.16
957	0.15
958	0.15
959	0.17
960	0.14
961	0.15
962	0.16
963	0.13
964	0.19
965	0.19
966	0.2
967	0.25
968	0.24
969	0.24
970	0.26
971	0.26
972	0.19
973	0.24
974	0.25
975	0.23
976	0.25
977	0.28
978	0.28
979	0.29
980	0.29
981	0.26
982	0.24
983	0.19
984	0.17
985	0.12
986	0.1
987	0.08
988	0.08
989	0.06
990	0.06
991	0.07
992	0.06
993	0.06
994	0.06
995	0.06
996	0.07
997	0.07
998	0.07
999	0.07
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.09
1020	0.08
1021	0.06
1022	0.05
1023	0.05
1024	0.05
1025	0.06
1026	0.08
1027	0.11
1028	0.13
1029	0.15
1030	0.17
1031	0.18
1032	0.23
1033	0.25
1034	0.28
1035	0.28
1036	0.28
1037	0.28
1038	0.32
1039	0.31
1040	0.26
1041	0.22
1042	0.19
1043	0.16
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.17
1047	0.18
1048	0.19
1049	0.23
1050	0.25
1051	0.25
1052	0.31
1053	0.35
1054	0.36
1055	0.38
1056	0.41
1057	0.42
1058	0.49
1059	0.53
1060	0.49
1061	0.5
1062	0.45
1063	0.47
1064	0.51
1065	0.51
1066	0.46
1067	0.48
1068	0.51
1069	0.5
1070	0.48
1071	0.45
1072	0.38
1073	0.39
1074	0.4
1075	0.39
1076	0.36
1077	0.31
1078	0.33
1079	0.32
1080	0.31
1081	0.3
1082	0.26
1083	0.24
1084	0.22
1085	0.23
1086	0.25
1087	0.28
1088	0.34
1089	0.33
1090	0.33
1091	0.33
1092	0.33
1093	0.33
1094	0.34
1095	0.4
1096	0.42
1097	0.48
1098	0.54
1099	0.58
1100	0.6

A0A401GCZ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer