FuNGI

A0A401GMZ0

Protein Details

Accession

A0A401GMZ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-40	AAPAPNLKPKAKEKEKKAKVVNKPQSDRLKTV	Hydrophilic
67-90	QWKVYYQGKFKKRLNKENIPSRAY	Hydrophilic
367-387	VGPGERKSKREREKGRALPDE	Basic
402-421	MDTSPKRKGRAEKRPAVPNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-31	LKPKAKEKEKKAKVVNK
225-256	GKKEDAKKKGEMPAQKPAESQTSKKAAKKAAK
371-382	ERKSKREREKGR
407-415	KRKGRAEKR
479-498	RGGPRPRGRGRGRGGMRGSG

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSPTEHGNAAPAPNLKPKAKEKEKKAKVVNKPQSDRLKTVVRRLPPNLPEDVFWQSVQKWVTDDTVQWKVYYQGKFKKRLNKENIPSRAYITFKDEEILGEFSREYDGHMFRDKAGNESIAVVEFAPYQKIPAEKKKADSRLATIEKDEDYISFLESLKDSSTKPFDAENLDTLIAAAQPPPPPTTTPLLEALKAEKSAQKDKEAIVRNHPHYKDQAGPTGHSAGKKEDAKKKGEMPAQKPAESQTSKKAAKKAAKAAHQHQQQQGQPGAPSVNAPAKAAATGAPAKQPAGSTQPKAPRPPRERQQHKLSPSNPTATAVGDPPTTASADAPAAQSDTPVQPAPARRTRPMLGLASRQFEAALSEAGVGPGERKSKREREKGRALPDEGAAAASGTTPSSSNMDTSPKRKGRAEKRPAVPNAALLPQISRAPLVTSAAPAPAPFILQRDGQQQPPKILTRPGDGQLDDSGLPQEDSGAVRGGPRPRGRGRGRGGMRGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.4
3	0.45
4	0.53
5	0.6
6	0.68
7	0.74
8	0.76
9	0.81
10	0.87
11	0.89
12	0.9
13	0.89
14	0.88
15	0.9
16	0.9
17	0.89
18	0.86
19	0.85
20	0.85
21	0.81
22	0.74
23	0.69
24	0.69
25	0.63
26	0.66
27	0.64
28	0.61
29	0.63
30	0.64
31	0.67
32	0.62
33	0.61
34	0.57
35	0.51
36	0.45
37	0.41
38	0.4
39	0.33
40	0.28
41	0.27
42	0.22
43	0.26
44	0.26
45	0.23
46	0.19
47	0.19
48	0.22
49	0.2
50	0.23
51	0.24
52	0.3
53	0.3
54	0.29
55	0.27
56	0.29
57	0.35
58	0.38
59	0.41
60	0.43
61	0.51
62	0.6
63	0.66
64	0.72
65	0.75
66	0.8
67	0.81
68	0.82
69	0.84
70	0.85
71	0.86
72	0.79
73	0.7
74	0.62
75	0.57
76	0.49
77	0.41
78	0.36
79	0.3
80	0.27
81	0.26
82	0.23
83	0.19
84	0.2
85	0.2
86	0.14
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.14
91	0.13
92	0.12
93	0.15
94	0.17
95	0.19
96	0.24
97	0.25
98	0.24
99	0.31
100	0.29
101	0.26
102	0.26
103	0.24
104	0.19
105	0.2
106	0.18
107	0.13
108	0.12
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.08
115	0.09
116	0.11
117	0.16
118	0.22
119	0.31
120	0.4
121	0.42
122	0.49
123	0.58
124	0.62
125	0.63
126	0.59
127	0.54
128	0.54
129	0.54
130	0.48
131	0.4
132	0.36
133	0.3
134	0.28
135	0.24
136	0.15
137	0.12
138	0.12
139	0.11
140	0.1
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.14
149	0.18
150	0.17
151	0.18
152	0.18
153	0.19
154	0.22
155	0.23
156	0.2
157	0.18
158	0.17
159	0.16
160	0.15
161	0.13
162	0.08
163	0.07
164	0.06
165	0.07
166	0.09
167	0.11
168	0.12
169	0.13
170	0.14
171	0.17
172	0.21
173	0.2
174	0.2
175	0.24
176	0.24
177	0.23
178	0.23
179	0.21
180	0.18
181	0.18
182	0.16
183	0.14
184	0.17
185	0.25
186	0.26
187	0.27
188	0.28
189	0.29
190	0.36
191	0.41
192	0.38
193	0.4
194	0.45
195	0.47
196	0.53
197	0.52
198	0.46
199	0.41
200	0.42
201	0.39
202	0.34
203	0.35
204	0.29
205	0.28
206	0.28
207	0.29
208	0.28
209	0.23
210	0.22
211	0.17
212	0.22
213	0.26
214	0.32
215	0.36
216	0.39
217	0.42
218	0.44
219	0.46
220	0.47
221	0.48
222	0.48
223	0.44
224	0.49
225	0.48
226	0.45
227	0.41
228	0.36
229	0.38
230	0.33
231	0.3
232	0.27
233	0.32
234	0.36
235	0.38
236	0.41
237	0.41
238	0.46
239	0.5
240	0.52
241	0.5
242	0.53
243	0.55
244	0.55
245	0.56
246	0.55
247	0.55
248	0.5
249	0.5
250	0.45
251	0.44
252	0.41
253	0.33
254	0.28
255	0.23
256	0.2
257	0.14
258	0.12
259	0.1
260	0.12
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.16
278	0.19
279	0.2
280	0.26
281	0.33
282	0.37
283	0.45
284	0.5
285	0.53
286	0.56
287	0.64
288	0.67
289	0.71
290	0.76
291	0.76
292	0.79
293	0.76
294	0.76
295	0.75
296	0.68
297	0.65
298	0.59
299	0.55
300	0.45
301	0.38
302	0.33
303	0.25
304	0.23
305	0.16
306	0.14
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.13
328	0.19
329	0.26
330	0.32
331	0.36
332	0.37
333	0.42
334	0.43
335	0.44
336	0.43
337	0.41
338	0.36
339	0.39
340	0.39
341	0.36
342	0.35
343	0.31
344	0.26
345	0.21
346	0.19
347	0.12
348	0.1
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.09
357	0.16
358	0.16
359	0.21
360	0.29
361	0.39
362	0.5
363	0.59
364	0.66
365	0.69
366	0.78
367	0.83
368	0.84
369	0.8
370	0.72
371	0.64
372	0.55
373	0.46
374	0.35
375	0.27
376	0.17
377	0.11
378	0.08
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.07
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.13
389	0.21
390	0.26
391	0.3
392	0.39
393	0.42
394	0.46
395	0.52
396	0.6
397	0.63
398	0.69
399	0.76
400	0.75
401	0.78
402	0.83
403	0.79
404	0.75
405	0.65
406	0.57
407	0.5
408	0.42
409	0.34
410	0.25
411	0.23
412	0.19
413	0.19
414	0.16
415	0.13
416	0.12
417	0.13
418	0.14
419	0.15
420	0.13
421	0.14
422	0.15
423	0.15
424	0.15
425	0.13
426	0.13
427	0.11
428	0.12
429	0.11
430	0.13
431	0.15
432	0.16
433	0.19
434	0.25
435	0.28
436	0.34
437	0.41
438	0.42
439	0.45
440	0.49
441	0.5
442	0.47
443	0.5
444	0.46
445	0.45
446	0.47
447	0.46
448	0.45
449	0.41
450	0.4
451	0.34
452	0.33
453	0.26
454	0.22
455	0.19
456	0.15
457	0.15
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.11
465	0.14
466	0.2
467	0.25
468	0.33
469	0.37
470	0.45
471	0.5
472	0.6
473	0.65
474	0.69
475	0.7
476	0.72
477	0.71
478	0.72

A0A401GMZ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer