FuNGI

A0A401GR04

Protein Details

Accession

A0A401GR04

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-131	AFQNASKKAKENRKERRSKCGNKANATAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
109-120	KKAKENRKERRS

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, mito 5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MQRVKDLRPNDFNLTKLDEELTSMAMIRALPVEEYGAFTSALLQRDILSKDVVTQAFVTEEINRRHRTTSPPKADQALTTASSSQLTCDFCEGKGHTQSNCYAFQNASKKAKENRKERRSKCGNKANATAAAAATQNTTQIDPTTVTESAGKASLSDPLQLDADFDWNADTGATSHMTPHHHWLRNYKPLVIPIKLADNTIVMSAGVGTVVFNPVIAGKAVRPVEFTRVLHVPRLRNNLLSCLYLVRQKGFRIHIESKFMTFLHSRQTLFVASITENYTAFLNGTVQPAPESAQAITTVPLDLNLWHRRFAHHNYADVQKMIREELVTGLMLNSKQQPDPICEPCLAGKMHANPFPTSDSHASKPLELIHTDVHGPLPVCTHSGYRYWITFIYDYSRFRVVLLLKAKSEAFDAFKQYKAYAENLLEAKIKAVQDDKGGEYMSNAFIQFTQEAGIERRHTTRNRPQQNGVAEQANRTMDNDITAMLAESKLPPSFWGECIGSMVHVWNRLPTAVVKGATPYELWYKRKPDVSHLRVWGCTAYVHVQKDQRTGLGPHMQKCVFIGYPAGYKGWKFYNPDTKKTIISERADFDERYFPGLKCTSDIPPPPPMSFPPADIIPLPVAPVPGQDLGGDGAHVPNPILGPVASEADPPVPPAPPAPEHPVTPPPPDPSEHHRVPTPPPFEPIDHRPIAQHRVPRNIRPTWKMRTLPPPMQDAESEDELDVIDADADFVEVQFAGLSAGADPWTYKQAMGSPDADKWQQAANEEIVSLMANNTWDIVPLPPGKRAIGSGWVFKVKHNADGSVERYKGRLVAKGYSQRPGFDYTEVFAPTFRQPALRLILALAAAEDLELHSVDISSAFLNGDLEEEIYMQQPEGFHQGGPEMVCRLNKSLYGLKQGARQWNKKLHEVLTKMGFTRLQSDRSIYVYIRGDVHIIVPVFIDDMTLASKSKKALDDTVKELKSYFKLRDLGSTQFLLGIDIKRDHAKHTISLSQRQYIVDMLERYGLSDCKSVSTPMDPGAELSKALAPQTQEEAEYMHKVPYLSAVGALMYLAITTRPDIMFAIGCLARFNANPGPAHWIAVKHVFRYLKGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.43
3	0.37
4	0.33
5	0.24
6	0.23
7	0.22
8	0.19
9	0.14
10	0.13
11	0.12
12	0.11
13	0.11
14	0.09
15	0.1
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.11
20	0.1
21	0.13
22	0.14
23	0.13
24	0.13
25	0.12
26	0.17
27	0.19
28	0.21
29	0.18
30	0.18
31	0.18
32	0.23
33	0.25
34	0.21
35	0.19
36	0.17
37	0.2
38	0.26
39	0.24
40	0.21
41	0.19
42	0.19
43	0.18
44	0.18
45	0.16
46	0.16
47	0.23
48	0.29
49	0.37
50	0.4
51	0.42
52	0.45
53	0.48
54	0.53
55	0.56
56	0.6
57	0.63
58	0.66
59	0.67
60	0.69
61	0.66
62	0.57
63	0.5
64	0.43
65	0.35
66	0.29
67	0.26
68	0.21
69	0.21
70	0.2
71	0.17
72	0.17
73	0.17
74	0.17
75	0.21
76	0.21
77	0.2
78	0.27
79	0.29
80	0.31
81	0.38
82	0.41
83	0.38
84	0.4
85	0.45
86	0.42
87	0.43
88	0.38
89	0.32
90	0.29
91	0.36
92	0.4
93	0.44
94	0.48
95	0.47
96	0.53
97	0.6
98	0.69
99	0.71
100	0.73
101	0.76
102	0.79
103	0.87
104	0.84
105	0.86
106	0.86
107	0.87
108	0.87
109	0.86
110	0.84
111	0.8
112	0.81
113	0.75
114	0.68
115	0.58
116	0.49
117	0.38
118	0.3
119	0.24
120	0.19
121	0.15
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.12
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.15
131	0.17
132	0.17
133	0.17
134	0.18
135	0.17
136	0.17
137	0.17
138	0.15
139	0.11
140	0.11
141	0.16
142	0.15
143	0.18
144	0.17
145	0.17
146	0.18
147	0.17
148	0.18
149	0.13
150	0.15
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.06
159	0.08
160	0.09
161	0.08
162	0.1
163	0.14
164	0.18
165	0.2
166	0.29
167	0.36
168	0.41
169	0.44
170	0.52
171	0.57
172	0.63
173	0.63
174	0.58
175	0.51
176	0.53
177	0.55
178	0.48
179	0.41
180	0.33
181	0.37
182	0.34
183	0.32
184	0.24
185	0.19
186	0.18
187	0.16
188	0.15
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.14
207	0.16
208	0.16
209	0.19
210	0.2
211	0.25
212	0.3
213	0.3
214	0.27
215	0.31
216	0.32
217	0.35
218	0.39
219	0.39
220	0.41
221	0.5
222	0.47
223	0.46
224	0.46
225	0.45
226	0.42
227	0.37
228	0.3
229	0.24
230	0.24
231	0.24
232	0.24
233	0.22
234	0.23
235	0.24
236	0.3
237	0.31
238	0.35
239	0.38
240	0.44
241	0.44
242	0.48
243	0.46
244	0.42
245	0.39
246	0.35
247	0.3
248	0.24
249	0.22
250	0.23
251	0.25
252	0.24
253	0.24
254	0.25
255	0.23
256	0.22
257	0.21
258	0.15
259	0.12
260	0.13
261	0.14
262	0.13
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.1
267	0.1
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.13
277	0.12
278	0.12
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.07
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.15
291	0.22
292	0.23
293	0.25
294	0.26
295	0.29
296	0.35
297	0.4
298	0.44
299	0.39
300	0.41
301	0.41
302	0.45
303	0.43
304	0.38
305	0.32
306	0.22
307	0.2
308	0.18
309	0.15
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.1
320	0.12
321	0.13
322	0.14
323	0.17
324	0.18
325	0.23
326	0.29
327	0.31
328	0.29
329	0.27
330	0.28
331	0.26
332	0.28
333	0.22
334	0.17
335	0.18
336	0.22
337	0.27
338	0.29
339	0.3
340	0.26
341	0.28
342	0.29
343	0.26
344	0.24
345	0.24
346	0.25
347	0.25
348	0.3
349	0.29
350	0.27
351	0.27
352	0.25
353	0.23
354	0.19
355	0.2
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.09
364	0.1
365	0.09
366	0.1
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.16
372	0.17
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.18
377	0.17
378	0.16
379	0.17
380	0.19
381	0.2
382	0.21
383	0.22
384	0.2
385	0.19
386	0.23
387	0.19
388	0.22
389	0.26
390	0.25
391	0.23
392	0.25
393	0.25
394	0.21
395	0.21
396	0.16
397	0.15
398	0.15
399	0.2
400	0.2
401	0.22
402	0.22
403	0.21
404	0.22
405	0.2
406	0.2
407	0.18
408	0.17
409	0.18
410	0.18
411	0.19
412	0.18
413	0.16
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.11
418	0.13
419	0.12
420	0.13
421	0.15
422	0.16
423	0.14
424	0.14
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.09
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.12
441	0.12
442	0.14
443	0.17
444	0.22
445	0.25
446	0.32
447	0.41
448	0.49
449	0.56
450	0.59
451	0.59
452	0.6
453	0.61
454	0.55
455	0.47
456	0.41
457	0.32
458	0.28
459	0.27
460	0.21
461	0.18
462	0.15
463	0.14
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.11
480	0.12
481	0.12
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.15
486	0.14
487	0.1
488	0.09
489	0.1
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.11
499	0.12
500	0.12
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.11
506	0.09
507	0.15
508	0.19
509	0.23
510	0.26
511	0.3
512	0.33
513	0.39
514	0.38
515	0.4
516	0.46
517	0.48
518	0.49
519	0.49
520	0.47
521	0.42
522	0.41
523	0.32
524	0.22
525	0.17
526	0.12
527	0.11
528	0.14
529	0.15
530	0.18
531	0.21
532	0.22
533	0.25
534	0.24
535	0.21
536	0.19
537	0.19
538	0.19
539	0.23
540	0.25
541	0.24
542	0.29
543	0.28
544	0.26
545	0.25
546	0.24
547	0.16
548	0.13
549	0.12
550	0.08
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.08
555	0.08
556	0.1
557	0.12
558	0.14
559	0.17
560	0.21
561	0.32
562	0.35
563	0.4
564	0.41
565	0.4
566	0.38
567	0.37
568	0.38
569	0.33
570	0.32
571	0.3
572	0.28
573	0.3
574	0.31
575	0.28
576	0.25
577	0.23
578	0.2
579	0.21
580	0.22
581	0.18
582	0.21
583	0.22
584	0.21
585	0.17
586	0.19
587	0.18
588	0.21
589	0.23
590	0.21
591	0.26
592	0.27
593	0.26
594	0.26
595	0.24
596	0.25
597	0.23
598	0.21
599	0.17
600	0.16
601	0.16
602	0.14
603	0.14
604	0.1
605	0.09
606	0.09
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.09
636	0.09
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.09
642	0.12
643	0.12
644	0.16
645	0.21
646	0.21
647	0.22
648	0.25
649	0.3
650	0.3
651	0.32
652	0.31
653	0.28
654	0.28
655	0.3
656	0.31
657	0.32
658	0.37
659	0.35
660	0.35
661	0.34
662	0.34
663	0.38
664	0.42
665	0.39
666	0.32
667	0.33
668	0.33
669	0.33
670	0.36
671	0.36
672	0.34
673	0.31
674	0.3
675	0.3
676	0.31
677	0.36
678	0.34
679	0.36
680	0.34
681	0.43
682	0.47
683	0.5
684	0.53
685	0.54
686	0.56
687	0.55
688	0.58
689	0.54
690	0.59
691	0.55
692	0.54
693	0.56
694	0.58
695	0.58
696	0.54
697	0.51
698	0.44
699	0.42
700	0.37
701	0.3
702	0.27
703	0.22
704	0.19
705	0.15
706	0.14
707	0.12
708	0.12
709	0.09
710	0.05
711	0.04
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.03
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.05
731	0.06
732	0.08
733	0.09
734	0.08
735	0.09
736	0.13
737	0.15
738	0.18
739	0.19
740	0.18
741	0.19
742	0.22
743	0.22
744	0.18
745	0.17
746	0.17
747	0.16
748	0.15
749	0.16
750	0.15
751	0.15
752	0.14
753	0.13
754	0.1
755	0.09
756	0.08
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.05
763	0.06
764	0.06
765	0.07
766	0.1
767	0.16
768	0.17
769	0.19
770	0.21
771	0.21
772	0.21
773	0.22
774	0.19
775	0.22
776	0.23
777	0.24
778	0.25
779	0.29
780	0.29
781	0.28
782	0.36
783	0.29
784	0.34
785	0.31
786	0.3
787	0.28
788	0.33
789	0.36
790	0.33
791	0.34
792	0.27
793	0.27
794	0.26
795	0.27
796	0.25
797	0.26
798	0.22
799	0.25
800	0.32
801	0.4
802	0.42
803	0.44
804	0.43
805	0.39
806	0.39
807	0.4
808	0.34
809	0.27
810	0.26
811	0.2
812	0.23
813	0.22
814	0.2
815	0.15
816	0.16
817	0.16
818	0.17
819	0.16
820	0.15
821	0.16
822	0.2
823	0.24
824	0.22
825	0.2
826	0.18
827	0.19
828	0.16
829	0.15
830	0.1
831	0.06
832	0.05
833	0.04
834	0.04
835	0.03
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.05
842	0.05
843	0.05
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.06
852	0.06
853	0.06
854	0.06
855	0.07
856	0.08
857	0.08
858	0.07
859	0.08
860	0.08
861	0.09
862	0.13
863	0.14
864	0.12
865	0.13
866	0.13
867	0.14
868	0.14
869	0.14
870	0.12
871	0.13
872	0.15
873	0.17
874	0.19
875	0.19
876	0.19
877	0.23
878	0.28
879	0.29
880	0.35
881	0.37
882	0.36
883	0.41
884	0.45
885	0.51
886	0.53
887	0.56
888	0.56
889	0.62
890	0.64
891	0.64
892	0.64
893	0.59
894	0.59
895	0.56
896	0.53
897	0.49
898	0.47
899	0.41
900	0.39
901	0.34
902	0.26
903	0.31
904	0.29
905	0.27
906	0.27
907	0.29
908	0.29
909	0.3
910	0.32
911	0.24
912	0.27
913	0.26
914	0.26
915	0.24
916	0.23
917	0.21
918	0.18
919	0.19
920	0.16
921	0.14
922	0.12
923	0.11
924	0.1
925	0.1
926	0.09
927	0.09
928	0.05
929	0.05
930	0.07
931	0.07
932	0.08
933	0.09
934	0.12
935	0.13
936	0.18
937	0.22
938	0.24
939	0.32
940	0.4
941	0.44
942	0.49
943	0.57
944	0.52
945	0.48
946	0.45
947	0.41
948	0.39
949	0.4
950	0.36
951	0.34
952	0.38
953	0.39
954	0.46
955	0.45
956	0.43
957	0.41
958	0.38
959	0.31
960	0.28
961	0.27
962	0.21
963	0.2
964	0.18
965	0.18
966	0.19
967	0.21
968	0.25
969	0.26
970	0.28
971	0.32
972	0.33
973	0.34
974	0.38
975	0.43
976	0.43
977	0.51
978	0.52
979	0.49
980	0.48
981	0.44
982	0.4
983	0.34
984	0.31
985	0.27
986	0.24
987	0.2
988	0.21
989	0.21
990	0.21
991	0.21
992	0.2
993	0.17
994	0.19
995	0.18
996	0.18
997	0.2
998	0.21
999	0.21
1000	0.23
1001	0.23
1002	0.23
1003	0.25
1004	0.22
1005	0.22
1006	0.23
1007	0.21
1008	0.18
1009	0.17
1010	0.16
1011	0.15
1012	0.16
1013	0.17
1014	0.16
1015	0.18
1016	0.22
1017	0.22
1018	0.2
1019	0.19
1020	0.21
1021	0.21
1022	0.23
1023	0.22
1024	0.19
1025	0.19
1026	0.19
1027	0.19
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.17
1031	0.16
1032	0.15
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.12
1036	0.08
1037	0.05
1038	0.04
1039	0.04
1040	0.04
1041	0.05
1042	0.06
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.14
1050	0.18
1051	0.16
1052	0.16
1053	0.16
1054	0.16
1055	0.16
1056	0.15
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.24
1060	0.25
1061	0.26
1062	0.33
1063	0.31
1064	0.33
1065	0.3
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.36
1069	0.37
1070	0.3
1071	0.37
1072	0.37

A0A401GR04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer