Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GJU6

Protein Details
Accession A0A401GJU6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-32LLPLRSIGLRRRDQRRRDVVHINPYFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008978  HSP20-like_chaperone  
IPR039742  Shq1  
IPR007009  Shq1_dom  
Gene Ontology GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04925  SHQ1  
Amino Acid Sequences MMKLPHLLPLRSIGLRRRDQRRRDVVHINPYFLRLNFIHALVDDERASASYDPSSGYLIVALTKAVKGQEFKDLDLLTKLLTPRPPGHPPEQSVIEVLSSEDAPVTEDDVLSARTQSLTLEHDEFLQAAQNDWQIPQDLPEALPPLQMSATHRYGFLDMHSGYFRHVAHTENEVNELGRDAETCPPDERRRKRLEHEEEKWDEEYYMADFVEDEYIQELIAWRNPHVTATDEFKYTEEENLTMLRLPRREYLATPSQAHNLYLTLLSLLFSHAYDTRTTQHDPTPESAWTISSLTPAFSVLDPPPYSPTPPPLSQSSSFDASELAAVFTASYRRALAFPLHRSFALAEACRADVAARLTKGKRAVTRCLLEMKHILDHHDVYYVYSKIWVDDFCVWTAAYASDDVLHQLSRDVARLKMEKSMIGWDLDELEALTREAAEREPDSDDESEDEIDRMLPAPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.52
3 0.6
4 0.66
5 0.71
6 0.76
7 0.82
8 0.85
9 0.83
10 0.82
11 0.83
12 0.8
13 0.81
14 0.75
15 0.68
16 0.58
17 0.54
18 0.49
19 0.4
20 0.37
21 0.26
22 0.3
23 0.27
24 0.27
25 0.24
26 0.21
27 0.25
28 0.2
29 0.23
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.16
35 0.12
36 0.13
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.15
55 0.17
56 0.25
57 0.26
58 0.27
59 0.3
60 0.29
61 0.28
62 0.27
63 0.25
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.24
70 0.27
71 0.34
72 0.41
73 0.43
74 0.49
75 0.51
76 0.52
77 0.52
78 0.51
79 0.45
80 0.38
81 0.33
82 0.25
83 0.19
84 0.15
85 0.11
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.14
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.17
144 0.16
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.17
151 0.16
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.21
157 0.23
158 0.2
159 0.21
160 0.19
161 0.18
162 0.16
163 0.14
164 0.1
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.2
173 0.29
174 0.38
175 0.44
176 0.49
177 0.57
178 0.6
179 0.67
180 0.72
181 0.74
182 0.74
183 0.72
184 0.71
185 0.65
186 0.62
187 0.55
188 0.44
189 0.33
190 0.24
191 0.19
192 0.11
193 0.09
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.05
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.15
223 0.16
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.19
236 0.2
237 0.2
238 0.25
239 0.29
240 0.31
241 0.31
242 0.3
243 0.29
244 0.29
245 0.28
246 0.22
247 0.15
248 0.12
249 0.1
250 0.09
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.19
266 0.19
267 0.21
268 0.23
269 0.25
270 0.26
271 0.26
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.17
276 0.15
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.11
287 0.09
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.19
292 0.19
293 0.22
294 0.2
295 0.25
296 0.26
297 0.27
298 0.29
299 0.29
300 0.33
301 0.33
302 0.35
303 0.33
304 0.31
305 0.29
306 0.26
307 0.22
308 0.17
309 0.16
310 0.12
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.18
324 0.23
325 0.3
326 0.32
327 0.33
328 0.32
329 0.33
330 0.32
331 0.29
332 0.27
333 0.21
334 0.19
335 0.18
336 0.19
337 0.17
338 0.17
339 0.13
340 0.11
341 0.14
342 0.17
343 0.17
344 0.23
345 0.25
346 0.29
347 0.34
348 0.37
349 0.41
350 0.41
351 0.48
352 0.5
353 0.52
354 0.51
355 0.53
356 0.48
357 0.44
358 0.43
359 0.37
360 0.34
361 0.31
362 0.32
363 0.28
364 0.29
365 0.26
366 0.24
367 0.22
368 0.19
369 0.23
370 0.2
371 0.16
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.18
376 0.16
377 0.16
378 0.21
379 0.23
380 0.2
381 0.22
382 0.2
383 0.18
384 0.19
385 0.15
386 0.11
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.13
397 0.13
398 0.17
399 0.18
400 0.19
401 0.26
402 0.3
403 0.3
404 0.33
405 0.34
406 0.31
407 0.3
408 0.34
409 0.29
410 0.26
411 0.25
412 0.19
413 0.19
414 0.18
415 0.16
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.11
425 0.14
426 0.15
427 0.17
428 0.2
429 0.21
430 0.24
431 0.24
432 0.23
433 0.21
434 0.22
435 0.21
436 0.19
437 0.18
438 0.14
439 0.14
440 0.13