Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GIG7

Protein Details
Accession A0A401GIG7    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSSRHDYRRRDRSWERDDRDRYRERBasic
33-73RYRDAPVPRRSRSRSPPRRGDRPKDRDVRDRDRRGPDRRDHBasic
215-235GSVQIKKMRTWRQYMNRRGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-95DRDRYRERARDRDRGRYRDAPVPRRSRSRSPPRRGDRPKDRDVRDRDRRGPDRRDHGRNDRSERDRRDAKGRDDRDQR
104-104R
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRHDYRRRDRSWERDDRDRYRERARDRDRGRYRDAPVPRRSRSRSPPRRGDRPKDRDVRDRDRRGPDRRDHGRNDRSERDRRDAKGRDDRDQRDVKDVREARREYIPKARETEREAARNRDKDARLPHEQDGPSEEKLAVGEPDARDSRSAPPGSEESPNSHSREDSTVPPEEGEEDEVMDATNDDDVAMMAMLGMSGFGSTKGKHVEGNQEGSVQIKKMRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.8
3 0.8
4 0.84
5 0.82
6 0.81
7 0.78
8 0.74
9 0.73
10 0.74
11 0.72
12 0.74
13 0.74
14 0.76
15 0.74
16 0.79
17 0.79
18 0.77
19 0.77
20 0.73
21 0.7
22 0.68
23 0.72
24 0.7
25 0.7
26 0.72
27 0.71
28 0.72
29 0.75
30 0.76
31 0.77
32 0.79
33 0.8
34 0.81
35 0.86
36 0.85
37 0.89
38 0.9
39 0.9
40 0.89
41 0.87
42 0.87
43 0.85
44 0.82
45 0.81
46 0.8
47 0.8
48 0.79
49 0.79
50 0.78
51 0.79
52 0.81
53 0.8
54 0.8
55 0.77
56 0.77
57 0.77
58 0.76
59 0.74
60 0.75
61 0.75
62 0.74
63 0.73
64 0.72
65 0.7
66 0.72
67 0.69
68 0.67
69 0.65
70 0.61
71 0.63
72 0.61
73 0.62
74 0.63
75 0.62
76 0.62
77 0.65
78 0.64
79 0.63
80 0.62
81 0.54
82 0.53
83 0.51
84 0.43
85 0.44
86 0.46
87 0.42
88 0.45
89 0.45
90 0.39
91 0.44
92 0.45
93 0.39
94 0.43
95 0.41
96 0.36
97 0.39
98 0.39
99 0.34
100 0.37
101 0.42
102 0.37
103 0.41
104 0.4
105 0.44
106 0.47
107 0.46
108 0.44
109 0.43
110 0.4
111 0.38
112 0.43
113 0.42
114 0.41
115 0.42
116 0.42
117 0.41
118 0.4
119 0.35
120 0.32
121 0.29
122 0.23
123 0.21
124 0.19
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.09
129 0.06
130 0.09
131 0.08
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.18
138 0.21
139 0.22
140 0.18
141 0.21
142 0.23
143 0.24
144 0.26
145 0.23
146 0.21
147 0.25
148 0.29
149 0.28
150 0.26
151 0.24
152 0.23
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.19
162 0.17
163 0.15
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.07
191 0.11
192 0.15
193 0.16
194 0.19
195 0.22
196 0.31
197 0.34
198 0.39
199 0.36
200 0.33
201 0.33
202 0.32
203 0.3
204 0.22
205 0.22
206 0.2
207 0.24
208 0.32
209 0.42
210 0.47
211 0.53
212 0.62
213 0.68
214 0.75
215 0.81
216 0.83
217 0.79
218 0.78
219 0.74
220 0.73
221 0.7
222 0.68
223 0.66