FuNGI

A0A401GMT1

Protein Details

Accession

A0A401GMT1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-382	DGTRSSKKRKREDTDSRKRKRSKRSKSDSESNSNSDSERERNKSKKRRQKRRESDSDDGEFDRKGKKKKRKTDESDEEDGGSSSSEDEKHRRKKKGKKRKESSDRESGDS	Basic
384-416	DASPESEKRRSRKSSRSKSKSRKHSSSPAPDLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-299	SSKKRKREDTDSRKRKRSKRSKS
310-328	ERERNKSKKRRQKRRESDS
331-343	GEFDRKGKKKKRK
361-375	KHRRKKKGKKRKESS
389-407	SEKRRSRKSSRSKSKSRKH

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKPNALEQKLHQAALADSKKTLSQKECETLIPDKAARVEAINFLLGTGMFKALKDTKGALSFRAVMKKELEVKKDMSDEESMVLSHIQASGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCIKSLVQKQLIKAVKSVKYPTRKIYMLFHLDPSVEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACLRFIRDRSLPKHKSQDGDSKTSQPLFPISAAPSYPTAQQILAFLSKSRITETQLDVEHIEMLLNVLVLDGEVEKVPAFGAVMWEANVAEEREDESDDDGTRSSKKRKREDTDSRKRKRSKRSKSDSESNSNSDSERERNKSKKRRQKRRESDSDDGEFDRKGKKKKRKTDESDEEDGGSSSSEDEKHRRKKKGKKRKESSDRESGDSSDASPESEKRRSRKSSRSKSKSRKHSSSPAPDLSSTSMVMEEDYGAYVYRAIKQEKVGFGLSQAPCVRCPTFDFCKNTGPVNPKECVYYGKWLTTIPVARE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.37
3	0.33
4	0.38
5	0.38
6	0.28
7	0.25
8	0.27
9	0.31
10	0.33
11	0.39
12	0.35
13	0.37
14	0.43
15	0.48
16	0.48
17	0.46
18	0.47
19	0.44
20	0.41
21	0.4
22	0.33
23	0.3
24	0.3
25	0.29
26	0.25
27	0.23
28	0.21
29	0.2
30	0.2
31	0.19
32	0.17
33	0.15
34	0.15
35	0.12
36	0.11
37	0.09
38	0.1
39	0.09
40	0.09
41	0.15
42	0.19
43	0.2
44	0.22
45	0.24
46	0.26
47	0.33
48	0.34
49	0.3
50	0.29
51	0.32
52	0.34
53	0.4
54	0.36
55	0.32
56	0.33
57	0.37
58	0.43
59	0.45
60	0.45
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.44
65	0.4
66	0.33
67	0.29
68	0.25
69	0.22
70	0.2
71	0.16
72	0.13
73	0.13
74	0.09
75	0.08
76	0.09
77	0.08
78	0.07
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.15
86	0.18
87	0.17
88	0.21
89	0.23
90	0.25
91	0.31
92	0.38
93	0.44
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.31
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.43
111	0.43
112	0.5
113	0.54
114	0.48
115	0.44
116	0.44
117	0.39
118	0.41
119	0.46
120	0.45
121	0.49
122	0.53
123	0.54
124	0.53
125	0.5
126	0.48
127	0.47
128	0.47
129	0.45
130	0.42
131	0.38
132	0.33
133	0.31
134	0.29
135	0.25
136	0.18
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.16
163	0.19
164	0.22
165	0.24
166	0.29
167	0.33
168	0.4
169	0.43
170	0.51
171	0.52
172	0.54
173	0.61
174	0.58
175	0.56
176	0.53
177	0.56
178	0.5
179	0.52
180	0.48
181	0.43
182	0.42
183	0.4
184	0.35
185	0.26
186	0.23
187	0.17
188	0.16
189	0.14
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.12
211	0.14
212	0.18
213	0.2
214	0.22
215	0.21
216	0.21
217	0.19
218	0.18
219	0.15
220	0.11
221	0.09
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.02
229	0.02
230	0.03
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.06
249	0.05
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.12
263	0.16
264	0.25
265	0.29
266	0.38
267	0.47
268	0.57
269	0.64
270	0.71
271	0.78
272	0.8
273	0.87
274	0.89
275	0.87
276	0.87
277	0.88
278	0.86
279	0.86
280	0.86
281	0.86
282	0.86
283	0.88
284	0.89
285	0.88
286	0.89
287	0.84
288	0.81
289	0.74
290	0.65
291	0.57
292	0.47
293	0.39
294	0.31
295	0.27
296	0.25
297	0.28
298	0.31
299	0.37
300	0.45
301	0.56
302	0.65
303	0.73
304	0.78
305	0.83
306	0.89
307	0.92
308	0.94
309	0.94
310	0.94
311	0.94
312	0.92
313	0.88
314	0.83
315	0.75
316	0.65
317	0.56
318	0.46
319	0.35
320	0.28
321	0.29
322	0.28
323	0.35
324	0.43
325	0.53
326	0.62
327	0.73
328	0.82
329	0.85
330	0.89
331	0.9
332	0.9
333	0.87
334	0.82
335	0.72
336	0.62
337	0.51
338	0.41
339	0.3
340	0.2
341	0.12
342	0.07
343	0.08
344	0.1
345	0.13
346	0.21
347	0.31
348	0.42
349	0.51
350	0.61
351	0.69
352	0.78
353	0.86
354	0.89
355	0.9
356	0.91
357	0.93
358	0.94
359	0.95
360	0.95
361	0.91
362	0.9
363	0.82
364	0.75
365	0.66
366	0.55
367	0.46
368	0.36
369	0.29
370	0.22
371	0.18
372	0.15
373	0.16
374	0.19
375	0.23
376	0.31
377	0.37
378	0.4
379	0.5
380	0.58
381	0.66
382	0.73
383	0.78
384	0.81
385	0.86
386	0.9
387	0.91
388	0.93
389	0.94
390	0.94
391	0.93
392	0.91
393	0.88
394	0.88
395	0.87
396	0.86
397	0.84
398	0.78
399	0.71
400	0.62
401	0.56
402	0.49
403	0.4
404	0.3
405	0.23
406	0.17
407	0.14
408	0.14
409	0.12
410	0.09
411	0.07
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.09
417	0.1
418	0.15
419	0.2
420	0.22
421	0.25
422	0.31
423	0.38
424	0.38
425	0.4
426	0.37
427	0.31
428	0.31
429	0.37
430	0.3
431	0.31
432	0.33
433	0.31
434	0.3
435	0.36
436	0.35
437	0.28
438	0.33
439	0.34
440	0.39
441	0.45
442	0.51
443	0.49
444	0.56
445	0.57
446	0.55
447	0.54
448	0.53
449	0.53
450	0.51
451	0.5
452	0.43
453	0.44
454	0.41
455	0.4
456	0.36
457	0.38
458	0.36
459	0.37
460	0.37
461	0.34
462	0.35
463	0.37

A0A401GMT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer