Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GFB1

Protein Details
Accession A0A401GFB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-294HQQGHHSHDCPKKKPKNPRNTSRMHKEIQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-279K
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 13, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MQLIPAAAFSAIPVHRHIISNPFPTMTAPKPTELKLSQPEPFSGDMSKTKIFLQRVQTYVDINDEIYNSNKKKIAFAMSFMRGGTAEAWAETWYDDHTDNLGKLKDYGTFDAWVIDFNKAFQETDPMGSAMKDLESLHQTGEVQDYVNLFLVLMKKAKITEYPARLHYFKIGLSCRLLERIMNVNPLPTDMEGWYKKAVEIDNQTKSMQMYTKFQNSCPSRQQQKQGQQQRKGPVYTRDPNAMDIDRMSQEERDRHIKGGLCFECHQQGHHSHDCPKKKPKNPRNTSRMHKEIQVEEYEREPSTSKTEDVEEDTASVKRMTISDSNVSKLLQELRKMQKERNDWIKKLEGSDFGSDGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.26
5 0.28
6 0.34
7 0.37
8 0.37
9 0.34
10 0.33
11 0.33
12 0.37
13 0.32
14 0.34
15 0.31
16 0.34
17 0.37
18 0.38
19 0.43
20 0.39
21 0.43
22 0.42
23 0.45
24 0.45
25 0.43
26 0.43
27 0.38
28 0.38
29 0.32
30 0.26
31 0.25
32 0.24
33 0.27
34 0.27
35 0.25
36 0.27
37 0.32
38 0.34
39 0.36
40 0.42
41 0.44
42 0.44
43 0.46
44 0.44
45 0.39
46 0.36
47 0.32
48 0.24
49 0.18
50 0.17
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.24
55 0.22
56 0.26
57 0.29
58 0.28
59 0.3
60 0.33
61 0.38
62 0.31
63 0.34
64 0.37
65 0.36
66 0.36
67 0.33
68 0.3
69 0.21
70 0.2
71 0.17
72 0.11
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.18
93 0.19
94 0.21
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.16
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.14
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.17
147 0.22
148 0.27
149 0.29
150 0.32
151 0.35
152 0.35
153 0.33
154 0.29
155 0.23
156 0.18
157 0.2
158 0.18
159 0.17
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.11
166 0.12
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.09
176 0.09
177 0.07
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.21
188 0.26
189 0.28
190 0.29
191 0.29
192 0.27
193 0.27
194 0.24
195 0.21
196 0.16
197 0.18
198 0.2
199 0.28
200 0.28
201 0.29
202 0.37
203 0.37
204 0.41
205 0.44
206 0.48
207 0.49
208 0.53
209 0.61
210 0.61
211 0.67
212 0.72
213 0.75
214 0.76
215 0.75
216 0.76
217 0.75
218 0.71
219 0.64
220 0.58
221 0.55
222 0.54
223 0.54
224 0.5
225 0.48
226 0.43
227 0.42
228 0.42
229 0.35
230 0.27
231 0.21
232 0.2
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.18
238 0.21
239 0.25
240 0.29
241 0.3
242 0.3
243 0.33
244 0.35
245 0.33
246 0.39
247 0.36
248 0.33
249 0.33
250 0.34
251 0.37
252 0.32
253 0.32
254 0.27
255 0.3
256 0.33
257 0.38
258 0.4
259 0.42
260 0.5
261 0.57
262 0.61
263 0.67
264 0.7
265 0.73
266 0.81
267 0.82
268 0.86
269 0.88
270 0.9
271 0.88
272 0.87
273 0.88
274 0.87
275 0.83
276 0.74
277 0.69
278 0.64
279 0.59
280 0.54
281 0.5
282 0.43
283 0.37
284 0.36
285 0.34
286 0.28
287 0.25
288 0.23
289 0.19
290 0.22
291 0.23
292 0.22
293 0.21
294 0.23
295 0.24
296 0.27
297 0.27
298 0.22
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.19
303 0.17
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.16
308 0.19
309 0.23
310 0.3
311 0.32
312 0.34
313 0.34
314 0.33
315 0.29
316 0.28
317 0.32
318 0.28
319 0.31
320 0.38
321 0.47
322 0.56
323 0.6
324 0.62
325 0.63
326 0.66
327 0.71
328 0.73
329 0.72
330 0.65
331 0.68
332 0.71
333 0.64
334 0.61
335 0.55
336 0.49
337 0.43
338 0.44