Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401H1H3

Protein Details
Accession A0A401H1H3    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-72QSALAERQRKEAQRRKEQEDRDRREREVEAKLRLKRLEDEKREQERQRRBasic
74-96EEERGAKEREQRRKQEQERDALRBasic
354-392KASTSTSKPAAKKRPRSPSMSPTPSPPPPSKKRAPERGGHydrophilic
447-472AIEEERRHEEEKRRRRKEKELREKRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-104RKEAQRRKEQEDRDRREREVEAKLRLKRLEDEKREQERQRRLEEERGAKEREQRRKQEQERDALRYGPKKART
136-155EKRRRRLESEMRGRSAPRRS
359-391TSKPAAKKRPRSPSMSPTPSPPPPSKKRAPERG
452-472RRHEEEKRRRRKEKELREKRA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSTSFAALMALSATQTRQSDAAVQSALAERQRKEAQRRKEQEDRDRREREVEAKLRLKRLEDEKREQERQRRLEEERGAKEREQRRKQEQERDALRYGPKKARTDKNGYPVSGAARRRSSSSDDESAGANALTREEKRRRRLESEMRGRSAPRRSTHTGYSKAGRRLPGGAVDITTTEASFLSEPSGSQSIRERVAAEPAKLIKLNVNKRDTRTIDEILQDRAKARAKTLDGDQARSFSDWFGKGKKESPKKPTPQIGSASTSRDNTPGTKTSSGYASPAAHSAGLPKVPPAKSSAASATITSKAGARQLTRAPSALASRPAASSSKSLQKNAPSNGSIRAPVPRRSPASFSAKASTSTSKPAAKKRPRSPSMSPTPSPPPPSKKRAPERGGSALGAEIWKIFGKDRTAYTARDVLSDDEDMEADVRSLEFEEAQSSRIAKREEEAAIEEERRHEEEKRRRRKEKELREKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.22
7 0.22
8 0.25
9 0.21
10 0.2
11 0.2
12 0.22
13 0.24
14 0.23
15 0.27
16 0.24
17 0.32
18 0.4
19 0.47
20 0.55
21 0.62
22 0.67
23 0.73
24 0.8
25 0.81
26 0.83
27 0.85
28 0.85
29 0.87
30 0.85
31 0.84
32 0.81
33 0.75
34 0.71
35 0.65
36 0.61
37 0.6
38 0.58
39 0.57
40 0.6
41 0.63
42 0.64
43 0.62
44 0.58
45 0.55
46 0.59
47 0.6
48 0.61
49 0.65
50 0.68
51 0.75
52 0.8
53 0.81
54 0.8
55 0.79
56 0.78
57 0.76
58 0.72
59 0.68
60 0.69
61 0.7
62 0.69
63 0.67
64 0.65
65 0.61
66 0.58
67 0.62
68 0.62
69 0.64
70 0.65
71 0.66
72 0.71
73 0.78
74 0.84
75 0.85
76 0.83
77 0.82
78 0.79
79 0.76
80 0.68
81 0.62
82 0.59
83 0.54
84 0.54
85 0.52
86 0.53
87 0.54
88 0.62
89 0.67
90 0.69
91 0.72
92 0.72
93 0.73
94 0.71
95 0.63
96 0.56
97 0.48
98 0.45
99 0.42
100 0.39
101 0.35
102 0.34
103 0.35
104 0.36
105 0.37
106 0.38
107 0.38
108 0.4
109 0.38
110 0.34
111 0.34
112 0.32
113 0.29
114 0.24
115 0.17
116 0.12
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.11
121 0.2
122 0.29
123 0.38
124 0.47
125 0.55
126 0.6
127 0.64
128 0.72
129 0.74
130 0.75
131 0.78
132 0.75
133 0.69
134 0.64
135 0.6
136 0.57
137 0.54
138 0.5
139 0.43
140 0.44
141 0.47
142 0.5
143 0.56
144 0.57
145 0.54
146 0.51
147 0.54
148 0.53
149 0.53
150 0.52
151 0.46
152 0.4
153 0.37
154 0.34
155 0.3
156 0.25
157 0.2
158 0.17
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.09
173 0.11
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.16
182 0.25
183 0.25
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.17
191 0.23
192 0.31
193 0.35
194 0.4
195 0.42
196 0.44
197 0.52
198 0.49
199 0.46
200 0.43
201 0.37
202 0.33
203 0.34
204 0.32
205 0.27
206 0.26
207 0.21
208 0.18
209 0.2
210 0.22
211 0.2
212 0.19
213 0.22
214 0.22
215 0.24
216 0.25
217 0.29
218 0.25
219 0.28
220 0.27
221 0.23
222 0.22
223 0.2
224 0.18
225 0.11
226 0.13
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.24
233 0.32
234 0.39
235 0.45
236 0.52
237 0.59
238 0.64
239 0.7
240 0.71
241 0.66
242 0.61
243 0.58
244 0.52
245 0.46
246 0.41
247 0.37
248 0.31
249 0.28
250 0.24
251 0.21
252 0.19
253 0.17
254 0.19
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.22
261 0.21
262 0.18
263 0.18
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.19
279 0.21
280 0.21
281 0.23
282 0.23
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.14
293 0.16
294 0.15
295 0.18
296 0.22
297 0.25
298 0.25
299 0.25
300 0.22
301 0.21
302 0.23
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.17
312 0.18
313 0.26
314 0.28
315 0.3
316 0.33
317 0.39
318 0.45
319 0.45
320 0.46
321 0.39
322 0.38
323 0.39
324 0.36
325 0.3
326 0.24
327 0.28
328 0.28
329 0.32
330 0.35
331 0.38
332 0.42
333 0.43
334 0.46
335 0.45
336 0.5
337 0.48
338 0.45
339 0.43
340 0.39
341 0.38
342 0.37
343 0.35
344 0.28
345 0.29
346 0.31
347 0.34
348 0.39
349 0.47
350 0.54
351 0.61
352 0.69
353 0.74
354 0.8
355 0.79
356 0.81
357 0.79
358 0.79
359 0.79
360 0.76
361 0.67
362 0.62
363 0.63
364 0.6
365 0.59
366 0.56
367 0.55
368 0.56
369 0.64
370 0.68
371 0.71
372 0.76
373 0.81
374 0.79
375 0.76
376 0.75
377 0.73
378 0.66
379 0.56
380 0.46
381 0.35
382 0.3
383 0.23
384 0.16
385 0.09
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.14
391 0.18
392 0.22
393 0.24
394 0.31
395 0.33
396 0.34
397 0.36
398 0.37
399 0.34
400 0.32
401 0.31
402 0.25
403 0.25
404 0.24
405 0.2
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.12
410 0.1
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.18
425 0.23
426 0.25
427 0.22
428 0.23
429 0.28
430 0.28
431 0.29
432 0.3
433 0.27
434 0.29
435 0.3
436 0.29
437 0.27
438 0.29
439 0.29
440 0.29
441 0.34
442 0.41
443 0.49
444 0.59
445 0.67
446 0.74
447 0.81
448 0.86
449 0.9
450 0.91
451 0.91
452 0.92