FuNGI

A0A401GQW3

Protein Details

Accession

A0A401GQW3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-354	GLGHYSRNCRLPRKRRPPQELNLFEG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
577-582	ARMKAK

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 8, pero 4, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF03732 Retrotrans_gag PF17917 RT_RNaseH PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MDPQAQLAALAAGLPEDTYHALEAILRDLDHRVTHAQAPALSADNIRIALEHGFANAQFNLPPAHFTLPPAPPPPPVSVHPGQFKVDLAHFHGKDSDDLGAWLTLIEDYLRGQHIPEVDWPLQVPMLFRGEAQRWYVAQKKKIGRGFTWAELRKALTDKFDTPLRVETLRNELRSVPWKGNLTRYAAAFRDLETQIPEVDMTFGDRLSNFLSRLPVEFAKDIRRDKPKNVEEMYFLAREIERLSNLHHVPAQHQNNTNGFCKKTKGFTHHLFSSSSSSPSAASSSPSAPPTSSSPSTGPVPMDLDAMEQPPPLKTKDRVSRVRCFNCNGLGHYSRNCRLPRKRRPPQELNLFEGSEPPLFTDCCEEPLELSVLDLSDDAPEPHLLPTYAVQLAPSVNAKPLQLASAIIDTGAAYCYIKPSVVRRANLTTYPMMAHSVRSAGATTTSAWAHFAIKIGGWQKPICAFILDTDTLRFDMVIGQEWLQKYNAQPDWATRSWFLTDPRTCQVVRLHAMTVQQPLPLPRIAGAAASNRWASLVAAPLELYSLAEEPVTESPQETSGHKSPLAKIKSFGARLHARMKAKFPRLFRTKLGAPPAGRCEHVIDVTGTRPIRAHGRPLSPPEHEEVRKFVDEGLQDGIIEPSKSPWSAPLILIRKKDGKMRVCVDFRQLNNFTVRNAYPLPRIDDSYQNLRGARFFTTLDLRSGYWQIPLSAASRPLTAFATRFGHYQFCVMPLGLCNAPATFQNFMNDLLRSRLDRCVMVYLDDIIIYSPNLPQHLADVDWVLTRLDHQGLILHEDKCQWVQTELTYLGHIVSIAGVRPNPEKVQAITEWPRPDNVTRLRGFLNLTGYYRRFMKGFAKIAGPMYDLLKGNPRKRAEIKWSAPCEQAFVALKSRLTSAPLLSYPSPWRLFVLDVDASGHAIGGILHQSQNDFPKGEGDCSRFAFKESDLRPIAFESRRMTPTEQRYSAQEREMLAIDHCLQKWRSYVEGSPVVVRSDHESLKYFLSQKHLGRRLARFADNIAHFDVLIRYHPGRNQLAADALSRRDGQADVPDYEASGPLFANPMEPAVDHDRSALFETLKKWREDLLRDASAEPSRRGFLVRDGALFHSVDLGQGEVFLPVLVNLDEALRVIREVHTDLGHLGVRAVAEALKSRVWLPIVTELVEFVIRRCDACQFTQRELHLPSRCTHFLVRMPLIVGLSTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.06
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.1
9	0.11
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.12
14	0.13
15	0.15
16	0.17
17	0.16
18	0.18
19	0.18
20	0.21
21	0.25
22	0.27
23	0.28
24	0.26
25	0.27
26	0.26
27	0.26
28	0.23
29	0.19
30	0.18
31	0.17
32	0.16
33	0.14
34	0.13
35	0.11
36	0.12
37	0.13
38	0.11
39	0.11
40	0.12
41	0.12
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.12
46	0.14
47	0.15
48	0.14
49	0.16
50	0.16
51	0.19
52	0.19
53	0.22
54	0.29
55	0.31
56	0.36
57	0.38
58	0.36
59	0.36
60	0.39
61	0.4
62	0.37
63	0.35
64	0.38
65	0.4
66	0.44
67	0.47
68	0.47
69	0.45
70	0.42
71	0.4
72	0.36
73	0.33
74	0.29
75	0.29
76	0.36
77	0.34
78	0.34
79	0.36
80	0.33
81	0.32
82	0.31
83	0.25
84	0.16
85	0.16
86	0.16
87	0.13
88	0.11
89	0.1
90	0.08
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.05
95	0.06
96	0.09
97	0.11
98	0.1
99	0.11
100	0.14
101	0.15
102	0.16
103	0.2
104	0.25
105	0.24
106	0.25
107	0.25
108	0.23
109	0.23
110	0.21
111	0.18
112	0.14
113	0.17
114	0.16
115	0.16
116	0.21
117	0.23
118	0.26
119	0.27
120	0.27
121	0.24
122	0.3
123	0.38
124	0.4
125	0.44
126	0.49
127	0.55
128	0.6
129	0.65
130	0.65
131	0.58
132	0.59
133	0.58
134	0.55
135	0.57
136	0.52
137	0.48
138	0.44
139	0.44
140	0.39
141	0.37
142	0.33
143	0.28
144	0.3
145	0.3
146	0.32
147	0.35
148	0.33
149	0.32
150	0.34
151	0.32
152	0.3
153	0.29
154	0.28
155	0.34
156	0.38
157	0.37
158	0.34
159	0.32
160	0.35
161	0.42
162	0.43
163	0.37
164	0.37
165	0.42
166	0.43
167	0.5
168	0.48
169	0.46
170	0.44
171	0.42
172	0.41
173	0.35
174	0.35
175	0.28
176	0.25
177	0.26
178	0.23
179	0.23
180	0.21
181	0.21
182	0.18
183	0.18
184	0.16
185	0.1
186	0.11
187	0.09
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.16
196	0.14
197	0.15
198	0.18
199	0.18
200	0.2
201	0.23
202	0.21
203	0.23
204	0.24
205	0.25
206	0.3
207	0.36
208	0.39
209	0.42
210	0.51
211	0.52
212	0.58
213	0.66
214	0.64
215	0.66
216	0.65
217	0.59
218	0.51
219	0.51
220	0.47
221	0.36
222	0.3
223	0.23
224	0.19
225	0.18
226	0.18
227	0.16
228	0.14
229	0.14
230	0.17
231	0.23
232	0.23
233	0.25
234	0.24
235	0.22
236	0.25
237	0.34
238	0.38
239	0.36
240	0.4
241	0.43
242	0.46
243	0.49
244	0.5
245	0.45
246	0.41
247	0.37
248	0.38
249	0.37
250	0.4
251	0.43
252	0.45
253	0.49
254	0.54
255	0.59
256	0.58
257	0.56
258	0.49
259	0.44
260	0.43
261	0.35
262	0.3
263	0.23
264	0.19
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.12
269	0.12
270	0.13
271	0.15
272	0.17
273	0.18
274	0.19
275	0.17
276	0.19
277	0.21
278	0.25
279	0.25
280	0.25
281	0.24
282	0.26
283	0.28
284	0.28
285	0.24
286	0.18
287	0.19
288	0.16
289	0.16
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.11
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.13
299	0.15
300	0.19
301	0.22
302	0.32
303	0.41
304	0.5
305	0.58
306	0.62
307	0.69
308	0.74
309	0.78
310	0.72
311	0.66
312	0.6
313	0.57
314	0.53
315	0.46
316	0.42
317	0.38
318	0.37
319	0.38
320	0.41
321	0.37
322	0.42
323	0.44
324	0.47
325	0.54
326	0.63
327	0.69
328	0.74
329	0.81
330	0.85
331	0.9
332	0.9
333	0.89
334	0.89
335	0.81
336	0.75
337	0.68
338	0.58
339	0.48
340	0.4
341	0.32
342	0.21
343	0.17
344	0.13
345	0.11
346	0.1
347	0.11
348	0.14
349	0.13
350	0.15
351	0.16
352	0.15
353	0.14
354	0.16
355	0.16
356	0.11
357	0.11
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.11
375	0.12
376	0.11
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.09
383	0.09
384	0.11
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.09
406	0.13
407	0.23
408	0.29
409	0.3
410	0.32
411	0.37
412	0.39
413	0.39
414	0.38
415	0.28
416	0.23
417	0.22
418	0.19
419	0.17
420	0.14
421	0.13
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.09
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.11
442	0.13
443	0.14
444	0.16
445	0.15
446	0.16
447	0.17
448	0.18
449	0.15
450	0.13
451	0.12
452	0.1
453	0.14
454	0.14
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.12
471	0.13
472	0.12
473	0.19
474	0.2
475	0.19
476	0.19
477	0.2
478	0.27
479	0.27
480	0.28
481	0.2
482	0.21
483	0.21
484	0.23
485	0.23
486	0.24
487	0.25
488	0.27
489	0.28
490	0.29
491	0.28
492	0.28
493	0.29
494	0.26
495	0.26
496	0.24
497	0.22
498	0.22
499	0.23
500	0.22
501	0.22
502	0.16
503	0.15
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.14
508	0.12
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.11
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.07
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.09
543	0.11
544	0.1
545	0.15
546	0.17
547	0.19
548	0.2
549	0.21
550	0.22
551	0.3
552	0.32
553	0.27
554	0.26
555	0.28
556	0.32
557	0.33
558	0.3
559	0.28
560	0.28
561	0.3
562	0.34
563	0.35
564	0.33
565	0.32
566	0.38
567	0.39
568	0.45
569	0.46
570	0.44
571	0.48
572	0.51
573	0.53
574	0.48
575	0.46
576	0.42
577	0.41
578	0.43
579	0.37
580	0.32
581	0.32
582	0.34
583	0.29
584	0.26
585	0.22
586	0.2
587	0.17
588	0.16
589	0.14
590	0.11
591	0.1
592	0.1
593	0.14
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.16
599	0.17
600	0.22
601	0.24
602	0.27
603	0.3
604	0.34
605	0.36
606	0.31
607	0.32
608	0.28
609	0.29
610	0.26
611	0.25
612	0.23
613	0.23
614	0.22
615	0.21
616	0.18
617	0.16
618	0.15
619	0.15
620	0.14
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.09
633	0.12
634	0.13
635	0.14
636	0.2
637	0.26
638	0.3
639	0.31
640	0.32
641	0.33
642	0.33
643	0.38
644	0.38
645	0.37
646	0.39
647	0.41
648	0.45
649	0.43
650	0.43
651	0.43
652	0.4
653	0.36
654	0.37
655	0.35
656	0.3
657	0.31
658	0.31
659	0.25
660	0.24
661	0.23
662	0.18
663	0.18
664	0.18
665	0.18
666	0.2
667	0.23
668	0.21
669	0.23
670	0.22
671	0.26
672	0.27
673	0.3
674	0.31
675	0.28
676	0.28
677	0.26
678	0.25
679	0.21
680	0.2
681	0.15
682	0.13
683	0.13
684	0.17
685	0.17
686	0.17
687	0.17
688	0.15
689	0.15
690	0.17
691	0.15
692	0.13
693	0.12
694	0.12
695	0.11
696	0.12
697	0.11
698	0.11
699	0.13
700	0.11
701	0.12
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.12
706	0.11
707	0.12
708	0.15
709	0.15
710	0.16
711	0.16
712	0.16
713	0.15
714	0.17
715	0.14
716	0.12
717	0.12
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.12
722	0.1
723	0.1
724	0.09
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.11
729	0.1
730	0.11
731	0.12
732	0.13
733	0.14
734	0.15
735	0.14
736	0.13
737	0.13
738	0.14
739	0.14
740	0.15
741	0.17
742	0.17
743	0.17
744	0.18
745	0.19
746	0.18
747	0.18
748	0.16
749	0.14
750	0.12
751	0.12
752	0.1
753	0.06
754	0.06
755	0.05
756	0.05
757	0.06
758	0.07
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.09
763	0.1
764	0.1
765	0.09
766	0.08
767	0.08
768	0.08
769	0.09
770	0.07
771	0.06
772	0.07
773	0.08
774	0.08
775	0.08
776	0.07
777	0.1
778	0.1
779	0.15
780	0.17
781	0.16
782	0.16
783	0.17
784	0.18
785	0.16
786	0.17
787	0.14
788	0.11
789	0.12
790	0.11
791	0.14
792	0.14
793	0.14
794	0.13
795	0.12
796	0.11
797	0.1
798	0.09
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.06
805	0.08
806	0.1
807	0.13
808	0.13
809	0.16
810	0.17
811	0.17
812	0.21
813	0.2
814	0.25
815	0.27
816	0.31
817	0.32
818	0.31
819	0.31
820	0.29
821	0.3
822	0.32
823	0.34
824	0.36
825	0.33
826	0.35
827	0.35
828	0.34
829	0.34
830	0.28
831	0.26
832	0.2
833	0.21
834	0.24
835	0.23
836	0.23
837	0.24
838	0.23
839	0.19
840	0.2
841	0.25
842	0.28
843	0.31
844	0.31
845	0.31
846	0.31
847	0.32
848	0.3
849	0.25
850	0.18
851	0.15
852	0.16
853	0.15
854	0.15
855	0.22
856	0.28
857	0.32
858	0.39
859	0.4
860	0.44
861	0.48
862	0.55
863	0.56
864	0.59
865	0.62
866	0.63
867	0.66
868	0.62
869	0.6
870	0.52
871	0.45
872	0.35
873	0.32
874	0.25
875	0.22
876	0.23
877	0.22
878	0.22
879	0.2
880	0.22
881	0.18
882	0.18
883	0.18
884	0.15
885	0.17
886	0.17
887	0.2
888	0.19
889	0.21
890	0.22
891	0.27
892	0.27
893	0.24
894	0.25
895	0.22
896	0.23
897	0.2
898	0.22
899	0.16
900	0.15
901	0.16
902	0.14
903	0.13
904	0.12
905	0.11
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.04
910	0.06
911	0.07
912	0.07
913	0.08
914	0.09
915	0.12
916	0.16
917	0.18
918	0.17
919	0.16
920	0.21
921	0.22
922	0.25
923	0.27
924	0.27
925	0.28
926	0.3
927	0.33
928	0.28
929	0.29
930	0.27
931	0.23
932	0.29
933	0.27
934	0.33
935	0.32
936	0.32
937	0.31
938	0.31
939	0.36
940	0.29
941	0.32
942	0.27
943	0.31
944	0.32
945	0.35
946	0.37
947	0.39
948	0.46
949	0.51
950	0.5
951	0.46
952	0.49
953	0.53
954	0.52
955	0.46
956	0.4
957	0.32
958	0.31
959	0.31
960	0.26
961	0.19
962	0.19
963	0.18
964	0.19
965	0.19
966	0.22
967	0.22
968	0.24
969	0.27
970	0.27
971	0.28
972	0.27
973	0.29
974	0.31
975	0.34
976	0.33
977	0.32
978	0.3
979	0.28
980	0.25
981	0.23
982	0.21
983	0.21
984	0.22
985	0.21
986	0.23
987	0.24
988	0.26
989	0.3
990	0.28
991	0.26
992	0.32
993	0.36
994	0.39
995	0.48
996	0.53
997	0.54
998	0.58
999	0.61
1000	0.62
1001	0.61
1002	0.59
1003	0.5
1004	0.45
1005	0.47
1006	0.41
1007	0.38
1008	0.31
1009	0.25
1010	0.22
1011	0.22
1012	0.2
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.2
1018	0.23
1019	0.29
1020	0.31
1021	0.32
1022	0.32
1023	0.29
1024	0.29
1025	0.27
1026	0.27
1027	0.22
1028	0.2
1029	0.21
1030	0.2
1031	0.18
1032	0.17
1033	0.17
1034	0.16
1035	0.21
1036	0.24
1037	0.23
1038	0.24
1039	0.24
1040	0.23
1041	0.22
1042	0.21
1043	0.14
1044	0.1
1045	0.09
1046	0.07
1047	0.09
1048	0.08
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.09
1054	0.14
1055	0.19
1056	0.21
1057	0.2
1058	0.21
1059	0.21
1060	0.22
1061	0.25
1062	0.23
1063	0.18
1064	0.2
1065	0.24
1066	0.32
1067	0.37
1068	0.37
1069	0.34
1070	0.38
1071	0.44
1072	0.45
1073	0.49
1074	0.48
1075	0.46
1076	0.47
1077	0.47
1078	0.45
1079	0.44
1080	0.42
1081	0.36
1082	0.31
1083	0.28
1084	0.27
1085	0.29
1086	0.26
1087	0.26
1088	0.31
1089	0.31
1090	0.29
1091	0.3
1092	0.32
1093	0.32
1094	0.3
1095	0.23
1096	0.17
1097	0.15
1098	0.14
1099	0.13
1100	0.11
1101	0.08
1102	0.09
1103	0.09
1104	0.06
1105	0.07
1106	0.06
1107	0.05
1108	0.05
1109	0.07
1110	0.06
1111	0.06
1112	0.06
1113	0.07
1114	0.07
1115	0.07
1116	0.08
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.09
1120	0.1
1121	0.13
1122	0.15
1123	0.18
1124	0.17
1125	0.18
1126	0.18
1127	0.19
1128	0.19
1129	0.16
1130	0.14
1131	0.12
1132	0.11
1133	0.1
1134	0.11
1135	0.08
1136	0.09
1137	0.12
1138	0.14
1139	0.14
1140	0.15
1141	0.16
1142	0.19
1143	0.2
1144	0.19
1145	0.2
1146	0.25
1147	0.26
1148	0.26
1149	0.25
1150	0.22
1151	0.22
1152	0.23
1153	0.19
1154	0.12
1155	0.18
1156	0.17
1157	0.18
1158	0.19
1159	0.25
1160	0.27
1161	0.33
1162	0.41
1163	0.4
1164	0.45
1165	0.51
1166	0.51
1167	0.51
1168	0.52
1169	0.54
1170	0.52
1171	0.49
1172	0.47
1173	0.49
1174	0.49
1175	0.46
1176	0.44
1177	0.42
1178	0.42
1179	0.48
1180	0.47
1181	0.41
1182	0.4
1183	0.37
1184	0.35

A0A401GQW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer