FuNGI

A0A428TY40

Protein Details

Accession

A0A428TY40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-39	ADDGDTPKRESKRPKKQGGKARQHQHSNID	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-31	KRESKRPKKQGGKAR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MATKREFQEADDGDTPKRESKRPKKQGGKARQHQHSNIDPTWGQKYVFSGSGNATTVPAGEESEFEDDSEAMAYLNSVRQEANGIPHLLVAPKVQIGPQLPADFERDDDADQDEEGPADRSIYETGIGDSRGYYEDGAYVGLPEWVEEDDYEEGEAPEYEDDDFDEEGAIHEAYFASLMDQYLHLRSVLHTKPPSNALSRLSPSQATTAAPFGHQSSPIAVWSRLLRTTDPHPLQLALMSKDTILRILRVLLGGKFLRRGYTLPERTSRWLWALLARLPDKGELNYAEIGWVRDLGRRAVLLGRSLAEMAALREELAEGGLGAHEAVDRSSSDEDVMVDAEELEVEGAVSPEQDEDDTTPPEVEQDEGQLSKADTPAPQPTSPTPKPDTEEGEIDEEEEDVAMDLASESEAEDGEVAPQPKEDLEEARARLLAQLDNGPTSDDEAEAEKEAAKQRSRANLRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.37
4	0.4
5	0.41
6	0.47
7	0.56
8	0.66
9	0.74
10	0.82
11	0.86
12	0.9
13	0.93
14	0.93
15	0.93
16	0.91
17	0.91
18	0.89
19	0.87
20	0.83
21	0.8
22	0.77
23	0.74
24	0.65
25	0.6
26	0.52
27	0.47
28	0.46
29	0.4
30	0.32
31	0.25
32	0.27
33	0.25
34	0.27
35	0.24
36	0.22
37	0.22
38	0.25
39	0.24
40	0.22
41	0.19
42	0.15
43	0.15
44	0.13
45	0.11
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.11
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.09
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.13
68	0.14
69	0.18
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.19
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.13
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.14
83	0.15
84	0.18
85	0.21
86	0.2
87	0.2
88	0.21
89	0.24
90	0.2
91	0.19
92	0.18
93	0.15
94	0.15
95	0.15
96	0.16
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.1
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.1
111	0.08
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.1
116	0.09
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.06
149	0.07
150	0.07
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.07
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.16
175	0.17
176	0.23
177	0.25
178	0.25
179	0.27
180	0.31
181	0.33
182	0.29
183	0.3
184	0.26
185	0.27
186	0.28
187	0.27
188	0.25
189	0.23
190	0.2
191	0.19
192	0.17
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.14
215	0.18
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.24
220	0.23
221	0.22
222	0.22
223	0.2
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.07
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.13
247	0.16
248	0.26
249	0.3
250	0.3
251	0.34
252	0.35
253	0.38
254	0.39
255	0.34
256	0.26
257	0.22
258	0.2
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.21
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.19
267	0.17
268	0.15
269	0.15
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.12
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.04
315	0.05
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.08
343	0.11
344	0.12
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.08
352	0.09
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.13
359	0.13
360	0.12
361	0.11
362	0.15
363	0.22
364	0.25
365	0.25
366	0.27
367	0.31
368	0.4
369	0.41
370	0.45
371	0.42
372	0.41
373	0.45
374	0.46
375	0.46
376	0.4
377	0.4
378	0.35
379	0.34
380	0.3
381	0.27
382	0.22
383	0.16
384	0.12
385	0.1
386	0.08
387	0.04
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.07
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.18
412	0.25
413	0.26
414	0.27
415	0.27
416	0.25
417	0.25
418	0.24
419	0.21
420	0.17
421	0.2
422	0.2
423	0.2
424	0.2
425	0.19
426	0.17
427	0.18
428	0.16
429	0.12
430	0.12
431	0.13
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.13
436	0.17
437	0.24
438	0.3
439	0.31
440	0.35
441	0.4
442	0.5
443	0.56
444	0.59
445	0.6
446	0.61
447	0.61
448	0.62
449	0.59
450	0.51
451	0.45
452	0.38
453	0.31
454	0.22
455	0.19
456	0.13
457	0.1
458	0.07
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.14
467	0.16
468	0.24
469	0.23
470	0.21

A0A428TY40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer