Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428TM92

Protein Details
Accession A0A428TM92    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-169IEIELQKRPKRPKELCHQGPDPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MAPASRRRRRSDTEDGDDDEDRYQNRSQATAVDSPKRQRLRLEPNATDGATDDESHARGVNGTSSSADADNGFQPGAIIRVSVENFVTYEKAEFLPGPHLNMVVGPNGTGKSSLVCAICLGLGYSPKHLGRAGSVKEFVKHGKDTATIEIELQKRPKRPKELCHQGPDPTRTKIRKNGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.67
3 0.62
4 0.55
5 0.47
6 0.38
7 0.31
8 0.23
9 0.22
10 0.21
11 0.2
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.28
18 0.31
19 0.34
20 0.38
21 0.42
22 0.5
23 0.51
24 0.49
25 0.48
26 0.53
27 0.56
28 0.62
29 0.66
30 0.58
31 0.59
32 0.59
33 0.53
34 0.43
35 0.33
36 0.26
37 0.18
38 0.17
39 0.13
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.25
119 0.26
120 0.26
121 0.29
122 0.29
123 0.29
124 0.31
125 0.3
126 0.27
127 0.26
128 0.23
129 0.23
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.27
134 0.23
135 0.22
136 0.27
137 0.27
138 0.29
139 0.35
140 0.36
141 0.42
142 0.51
143 0.6
144 0.64
145 0.71
146 0.75
147 0.79
148 0.84
149 0.85
150 0.83
151 0.78
152 0.75
153 0.75
154 0.73
155 0.67
156 0.62
157 0.63
158 0.61
159 0.65