Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428TXZ0

Protein Details
Accession A0A428TXZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-257VDRDERPRSQSRSRSRSRSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
244-256SRSRSRSRSRSRS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKNKDTVQADARRFLDERGSNATMAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVSFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELAPSDAVLHEYLHYGGDEFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVALTYMDEFVDDLLVKDRVCGTSLWKMPKRETLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEDEPEGENGTREESGELSDRDEMDVDRDERPRSQSRSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.41
4 0.34
5 0.35
6 0.36
7 0.36
8 0.32
9 0.32
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.13
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.26
133 0.31
134 0.4
135 0.48
136 0.53
137 0.6
138 0.67
139 0.69
140 0.67
141 0.63
142 0.57
143 0.5
144 0.4
145 0.32
146 0.25
147 0.18
148 0.1
149 0.08
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.2
165 0.25
166 0.33
167 0.38
168 0.41
169 0.42
170 0.5
171 0.52
172 0.48
173 0.47
174 0.44
175 0.43
176 0.4
177 0.39
178 0.32
179 0.27
180 0.24
181 0.2
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.07
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.2
221 0.19
222 0.22
223 0.25
224 0.28
225 0.3
226 0.37
227 0.43
228 0.45
229 0.53
230 0.59
231 0.66
232 0.73
233 0.79
234 0.83
235 0.85
236 0.89
237 0.9