Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428TDL7

Protein Details
Accession A0A428TDL7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35EDSGPDPRRIKRRKGADGTAAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-27RRIKRRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVDYSSSDSADEDSGPDPRRIKRRKGADGTAAHSSRTSDTTRTPSNPTADAGGRPHKDTEASSMPPLPDTFHDLYASTVRQSVVDDPSLHQGRKRQVPHVVGNWPSHLYVEWHPSTTQHALLTELLADIEKQASGEIELFNFLTSDLGSPLPLHISLSRPLSLSTGNKDEFLDRITQTFTGSGIAPFIVRPRGLAWYRSPDSDRTFLILRVASGASKAREEAVRTLNPELTALLAKSNTVATQFGQPTLYQRDASDQDTREAVGTAFHISIGWTFHLPGDKLSLETLGIFKQSKFADIRDWEIKVTGIKAKIGNVVNHVALKETGRSTAPPLGSVPFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.18
4 0.21
5 0.25
6 0.29
7 0.35
8 0.46
9 0.53
10 0.61
11 0.65
12 0.73
13 0.79
14 0.83
15 0.83
16 0.81
17 0.78
18 0.72
19 0.71
20 0.61
21 0.51
22 0.42
23 0.36
24 0.29
25 0.27
26 0.26
27 0.2
28 0.25
29 0.32
30 0.37
31 0.39
32 0.43
33 0.45
34 0.46
35 0.44
36 0.4
37 0.37
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.34
42 0.33
43 0.33
44 0.33
45 0.31
46 0.31
47 0.29
48 0.3
49 0.28
50 0.28
51 0.28
52 0.29
53 0.28
54 0.28
55 0.27
56 0.22
57 0.17
58 0.22
59 0.22
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.26
77 0.3
78 0.29
79 0.28
80 0.31
81 0.36
82 0.43
83 0.46
84 0.43
85 0.47
86 0.53
87 0.56
88 0.55
89 0.53
90 0.48
91 0.45
92 0.41
93 0.35
94 0.29
95 0.23
96 0.19
97 0.17
98 0.15
99 0.21
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.24
105 0.23
106 0.21
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.1
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.14
153 0.15
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.15
182 0.16
183 0.19
184 0.2
185 0.26
186 0.28
187 0.29
188 0.3
189 0.28
190 0.3
191 0.3
192 0.27
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.17
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.15
210 0.18
211 0.21
212 0.22
213 0.24
214 0.25
215 0.25
216 0.23
217 0.21
218 0.17
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.2
237 0.24
238 0.25
239 0.19
240 0.19
241 0.24
242 0.25
243 0.29
244 0.31
245 0.27
246 0.26
247 0.26
248 0.26
249 0.21
250 0.19
251 0.15
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.1
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.18
281 0.19
282 0.23
283 0.23
284 0.24
285 0.29
286 0.31
287 0.38
288 0.37
289 0.38
290 0.34
291 0.32
292 0.32
293 0.26
294 0.26
295 0.25
296 0.22
297 0.24
298 0.26
299 0.27
300 0.33
301 0.35
302 0.34
303 0.33
304 0.34
305 0.32
306 0.32
307 0.3
308 0.25
309 0.22
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.2
314 0.2
315 0.21
316 0.24
317 0.3
318 0.28
319 0.26
320 0.26