Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428T568

Protein Details
Accession A0A428T568    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33IDHSAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTEBasic
53-80VVNGDLKAEKKRKKKSKKDKHVEEAAVPBasic
85-111SAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVBasic
116-163SSVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQKKHKKDHQPEPEPEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-40KADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSK
59-72KAEKKRKKKSKKDK
92-102KSEKKHKKKKH
124-153KKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQKKHKK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.333, cyto 9.5, mito_nucl 8.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHSAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVVAPADLPAPEVVNGDLKAEKKRKKKSKKDKHVEEAAVPAEDESAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVEEADSSVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQKKHKKDHQPEPEPEAEAEEDASPDPDAMDVDFAIPARPKSKSSSNIHQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLYPIGWAQPVTNCQYQHLRHLQNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGEQPGRNGAAMDDETPTTVMSKDEAAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGEKIKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKQGEKGCCGRGGRDGQDAQGQEGWSEATEETRSRIQHDALRCGRGGADAGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.71
3 0.78
4 0.85
5 0.89
6 0.9
7 0.94
8 0.96
9 0.96
10 0.95
11 0.93
12 0.92
13 0.91
14 0.84
15 0.76
16 0.67
17 0.6
18 0.51
19 0.51
20 0.51
21 0.48
22 0.52
23 0.54
24 0.62
25 0.69
26 0.78
27 0.79
28 0.8
29 0.78
30 0.73
31 0.7
32 0.62
33 0.57
34 0.46
35 0.36
36 0.26
37 0.22
38 0.18
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.17
45 0.18
46 0.27
47 0.36
48 0.44
49 0.5
50 0.61
51 0.71
52 0.79
53 0.88
54 0.9
55 0.92
56 0.95
57 0.96
58 0.96
59 0.94
60 0.93
61 0.85
62 0.75
63 0.68
64 0.58
65 0.47
66 0.36
67 0.26
68 0.17
69 0.13
70 0.11
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.11
78 0.18
79 0.23
80 0.31
81 0.41
82 0.52
83 0.63
84 0.72
85 0.81
86 0.86
87 0.92
88 0.94
89 0.95
90 0.92
91 0.87
92 0.84
93 0.8
94 0.7
95 0.59
96 0.47
97 0.35
98 0.27
99 0.21
100 0.14
101 0.06
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.09
108 0.15
109 0.22
110 0.29
111 0.37
112 0.48
113 0.57
114 0.69
115 0.76
116 0.81
117 0.85
118 0.9
119 0.93
120 0.92
121 0.87
122 0.84
123 0.78
124 0.7
125 0.6
126 0.49
127 0.39
128 0.32
129 0.28
130 0.24
131 0.28
132 0.32
133 0.41
134 0.51
135 0.61
136 0.68
137 0.79
138 0.85
139 0.88
140 0.91
141 0.93
142 0.93
143 0.91
144 0.84
145 0.79
146 0.71
147 0.61
148 0.5
149 0.41
150 0.3
151 0.21
152 0.17
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.18
175 0.25
176 0.33
177 0.38
178 0.47
179 0.54
180 0.61
181 0.61
182 0.58
183 0.52
184 0.46
185 0.46
186 0.37
187 0.3
188 0.25
189 0.28
190 0.26
191 0.26
192 0.24
193 0.18
194 0.21
195 0.18
196 0.16
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.23
220 0.24
221 0.29
222 0.34
223 0.36
224 0.39
225 0.43
226 0.45
227 0.44
228 0.45
229 0.42
230 0.37
231 0.32
232 0.28
233 0.26
234 0.22
235 0.18
236 0.17
237 0.19
238 0.16
239 0.17
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.07
246 0.09
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.13
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.07
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.14
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.25
319 0.25
320 0.27
321 0.27
322 0.24
323 0.24
324 0.33
325 0.35
326 0.36
327 0.39
328 0.42
329 0.44
330 0.46
331 0.49
332 0.4
333 0.39
334 0.35
335 0.32
336 0.27
337 0.24
338 0.2
339 0.15
340 0.13
341 0.09
342 0.08
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.13
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.19
371 0.24
372 0.31
373 0.34
374 0.4
375 0.48
376 0.57
377 0.62
378 0.7
379 0.69
380 0.71
381 0.68
382 0.62
383 0.53
384 0.44
385 0.41
386 0.32
387 0.28
388 0.19
389 0.17
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.09
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.13
403 0.2
404 0.21
405 0.22
406 0.25
407 0.28
408 0.33
409 0.33
410 0.33
411 0.35
412 0.4
413 0.41
414 0.45
415 0.42
416 0.39
417 0.43
418 0.41
419 0.36
420 0.32
421 0.28
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.12
426 0.13
427 0.11
428 0.1
429 0.13
430 0.14
431 0.17
432 0.22
433 0.23
434 0.25
435 0.3
436 0.31
437 0.35
438 0.41
439 0.48
440 0.48
441 0.51
442 0.48
443 0.44
444 0.4
445 0.34