Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428UJX6

Protein Details
Accession A0A428UJX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
642-676QLTTHSPAKKTPKKGKENRRPTPRKARISDKALLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
649-673AKKTPKKGKENRRPTPRKARISDKA
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026851  Dna2/JHS1_DEXXQ-box  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017116  F:single-stranded DNA helicase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0033567  P:DNA replication, Okazaki fragment processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13087  AAA_12  
PF13604  AAA_30  
CDD cd18041  DEXXQc_DNA2  
cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MTSAEREKKSRCFGDVIIEEGSASVDTDNPKINRFHYTFIKQNHPAGFSFLESELTVGEPIVVSDEEGHFALAIGYVTAVKRRRISVAVDRRLHNARIRQPGFDENDNQTFASIMEVAHEGATQDETHGKIKEPPIRYRLDQDEFSNGMATVRNNLVQMMADDVFGSRQIRRLIVDLQPPRFKSVPTQYTISDRDSLNVDQHRAIEKVMSAQDYALVLGMPGTGKTTTIAHIIRALTSQGKSVLLTSHTHTAVDNILLKLKGDKIPILRLGAPAKVHPEVQEFAILAGQPMKTFDEIKDAWHGTPIVGTTCLGINHPIFHERTFDYCIVDEASQITLPICAGPIRMARTFVLVGDHNQLPPVVRNEEAREGGLDVSLFKLLSDTHPQSVVNLEHQYRMCEDIMTLSNTLIYHGKLRCGTEQLRKRKLDIPRMDALRQRHYDASTFHAATPRSFCAAPGRCWLYDLLESEARVRFINTDTILPQVREEAQGKRIVNSAEVRIVSQLVDSLLTVGVPETEIGVMTHYRAQLFMLKEKLKGYAGVEMHTTDRFQGRDKEVIVLSLVRSNDACNIGDLLKDWRRINVAFTRAKTKLLVIGSKSTLKGSGSENMLSRFISLMEDRHWIYDMPPDGLENHYFEDMGTQLTTHSPAKKTPKKGKENRRPTPRKARISDKALLKGKLITRDILNEMTNGAYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.5
3 0.45
4 0.37
5 0.32
6 0.27
7 0.22
8 0.21
9 0.11
10 0.1
11 0.07
12 0.09
13 0.11
14 0.14
15 0.22
16 0.22
17 0.27
18 0.29
19 0.31
20 0.38
21 0.38
22 0.42
23 0.44
24 0.5
25 0.54
26 0.57
27 0.64
28 0.6
29 0.63
30 0.61
31 0.55
32 0.48
33 0.45
34 0.4
35 0.31
36 0.29
37 0.23
38 0.2
39 0.17
40 0.17
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.07
64 0.07
65 0.14
66 0.18
67 0.23
68 0.27
69 0.29
70 0.33
71 0.35
72 0.42
73 0.47
74 0.53
75 0.58
76 0.6
77 0.59
78 0.61
79 0.62
80 0.59
81 0.55
82 0.53
83 0.52
84 0.57
85 0.57
86 0.53
87 0.52
88 0.56
89 0.54
90 0.5
91 0.47
92 0.41
93 0.43
94 0.41
95 0.37
96 0.3
97 0.24
98 0.2
99 0.16
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.12
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.23
118 0.3
119 0.37
120 0.4
121 0.46
122 0.48
123 0.53
124 0.54
125 0.55
126 0.55
127 0.52
128 0.49
129 0.43
130 0.43
131 0.39
132 0.36
133 0.3
134 0.22
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.09
155 0.14
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.21
160 0.23
161 0.27
162 0.35
163 0.37
164 0.42
165 0.46
166 0.46
167 0.48
168 0.44
169 0.4
170 0.39
171 0.43
172 0.42
173 0.4
174 0.42
175 0.38
176 0.43
177 0.45
178 0.39
179 0.32
180 0.26
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.25
185 0.25
186 0.24
187 0.22
188 0.24
189 0.25
190 0.22
191 0.22
192 0.17
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.13
233 0.14
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.1
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.18
251 0.18
252 0.22
253 0.24
254 0.24
255 0.22
256 0.22
257 0.23
258 0.22
259 0.2
260 0.17
261 0.19
262 0.17
263 0.17
264 0.15
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.14
283 0.14
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.13
309 0.15
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.08
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.12
338 0.12
339 0.09
340 0.1
341 0.13
342 0.13
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.12
348 0.13
349 0.11
350 0.11
351 0.13
352 0.15
353 0.18
354 0.18
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.08
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.13
370 0.15
371 0.15
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.19
376 0.17
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.17
384 0.19
385 0.16
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.12
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.12
396 0.1
397 0.09
398 0.13
399 0.13
400 0.17
401 0.17
402 0.19
403 0.2
404 0.24
405 0.28
406 0.32
407 0.41
408 0.48
409 0.55
410 0.54
411 0.56
412 0.57
413 0.61
414 0.61
415 0.59
416 0.55
417 0.53
418 0.56
419 0.55
420 0.53
421 0.49
422 0.46
423 0.42
424 0.38
425 0.34
426 0.32
427 0.32
428 0.29
429 0.3
430 0.26
431 0.25
432 0.24
433 0.25
434 0.25
435 0.23
436 0.25
437 0.21
438 0.19
439 0.18
440 0.18
441 0.23
442 0.27
443 0.28
444 0.31
445 0.33
446 0.3
447 0.31
448 0.31
449 0.24
450 0.23
451 0.22
452 0.2
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.18
458 0.16
459 0.14
460 0.12
461 0.12
462 0.16
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.18
467 0.19
468 0.18
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.17
473 0.19
474 0.19
475 0.21
476 0.27
477 0.27
478 0.26
479 0.28
480 0.25
481 0.26
482 0.25
483 0.23
484 0.21
485 0.21
486 0.2
487 0.18
488 0.17
489 0.14
490 0.11
491 0.1
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.16
516 0.19
517 0.23
518 0.27
519 0.28
520 0.3
521 0.31
522 0.32
523 0.28
524 0.27
525 0.24
526 0.23
527 0.22
528 0.21
529 0.21
530 0.2
531 0.2
532 0.19
533 0.18
534 0.13
535 0.16
536 0.16
537 0.19
538 0.25
539 0.28
540 0.32
541 0.33
542 0.35
543 0.31
544 0.31
545 0.28
546 0.22
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.13
551 0.13
552 0.14
553 0.16
554 0.17
555 0.17
556 0.14
557 0.16
558 0.15
559 0.15
560 0.16
561 0.2
562 0.22
563 0.28
564 0.27
565 0.28
566 0.32
567 0.32
568 0.37
569 0.37
570 0.4
571 0.41
572 0.43
573 0.48
574 0.45
575 0.46
576 0.41
577 0.35
578 0.33
579 0.31
580 0.34
581 0.29
582 0.33
583 0.34
584 0.37
585 0.36
586 0.31
587 0.28
588 0.24
589 0.23
590 0.22
591 0.24
592 0.24
593 0.26
594 0.27
595 0.27
596 0.28
597 0.25
598 0.22
599 0.17
600 0.14
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.16
605 0.2
606 0.2
607 0.21
608 0.21
609 0.19
610 0.18
611 0.22
612 0.23
613 0.21
614 0.2
615 0.2
616 0.2
617 0.23
618 0.24
619 0.19
620 0.19
621 0.17
622 0.17
623 0.16
624 0.16
625 0.14
626 0.13
627 0.11
628 0.09
629 0.09
630 0.11
631 0.15
632 0.17
633 0.23
634 0.24
635 0.32
636 0.43
637 0.52
638 0.61
639 0.68
640 0.74
641 0.8
642 0.88
643 0.91
644 0.92
645 0.94
646 0.94
647 0.94
648 0.93
649 0.92
650 0.93
651 0.92
652 0.91
653 0.88
654 0.87
655 0.86
656 0.84
657 0.81
658 0.78
659 0.77
660 0.73
661 0.67
662 0.58
663 0.55
664 0.53
665 0.53
666 0.47
667 0.41
668 0.37
669 0.4
670 0.42
671 0.39
672 0.35
673 0.27
674 0.25