FuNGI

A0A428U104

Protein Details

Accession

A0A428U104

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-46	HPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAG	Hydrophilic
181-208	APVAKEVNPKRPKKQKEEKTNFNRAPKT	Hydrophilic
440-467	NTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPTLSES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-48	HPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAGPK
188-201	NPKRPKKQKEEKTN
424-463	DKKAGEKAKGSGTKGTNTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPT
471-481	ESSRKKLKKNA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGPSGSAPGHPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAGPKPVAQPNAGSQNGMKPSVEERRKLYDGWSEPPPAQFTDIAIMTTKKALLDGIRYHMMKFSQAKIGDKPIDPSDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAPKIEAPEAPQVDEQEAERLAQMKAEREAQRAVDQAKIAPVAKEVNPKRPKKQKEEKTNFNRAPKTQAAKKESELRYEEALPWHLEDAEGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDQSVFRMVPLEKWYKFTSKPPFQPFTIDEAEALMGKKVDVGRWVMKDEEKRAGRQDLEATRQLLYGRGPMVMSSKMMTRPLSLKKNDDEDTKDSKDRIRREQLGANLFGDGDEQEVDRELAEELKEEIERQKACDDSEDNPWSSSSDDSDSDEEEEGEEDKKEEEKKEDDDKKAGEKAKGSGTKGTNTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPTLSESSGNESSRKKLKKNATPAAGSRAGTPLPQGAAARRMGAGSGSDGEATGGEMSDGAVSRKKKLKLVSGSARGTPSASRAGSPIPTQGGASPSAGGSIIEPSEILEKIPNDGIVIGDLIKLFQHRLGDRPGQMPKSEWIQLVKKLCDYGPDKRLRRRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.28
4	0.31
5	0.32
6	0.4
7	0.42
8	0.42
9	0.47
10	0.53
11	0.62
12	0.62
13	0.65
14	0.66
15	0.74
16	0.81
17	0.85
18	0.87
19	0.88
20	0.92
21	0.9
22	0.91
23	0.9
24	0.87
25	0.87
26	0.86
27	0.86
28	0.79
29	0.74
30	0.69
31	0.67
32	0.67
33	0.6
34	0.57
35	0.55
36	0.63
37	0.65
38	0.6
39	0.54
40	0.52
41	0.57
42	0.5
43	0.42
44	0.33
45	0.34
46	0.36
47	0.35
48	0.28
49	0.22
50	0.28
51	0.37
52	0.43
53	0.4
54	0.41
55	0.48
56	0.5
57	0.49
58	0.46
59	0.45
60	0.43
61	0.43
62	0.43
63	0.38
64	0.37
65	0.4
66	0.38
67	0.29
68	0.28
69	0.24
70	0.2
71	0.21
72	0.2
73	0.17
74	0.17
75	0.16
76	0.15
77	0.16
78	0.15
79	0.11
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.19
84	0.21
85	0.24
86	0.29
87	0.3
88	0.3
89	0.31
90	0.29
91	0.3
92	0.3
93	0.29
94	0.3
95	0.32
96	0.35
97	0.36
98	0.43
99	0.41
100	0.38
101	0.39
102	0.35
103	0.36
104	0.33
105	0.34
106	0.3
107	0.28
108	0.28
109	0.27
110	0.25
111	0.21
112	0.23
113	0.19
114	0.21
115	0.27
116	0.33
117	0.37
118	0.41
119	0.47
120	0.52
121	0.61
122	0.64
123	0.64
124	0.64
125	0.63
126	0.69
127	0.71
128	0.68
129	0.62
130	0.6
131	0.57
132	0.57
133	0.54
134	0.44
135	0.41
136	0.44
137	0.42
138	0.37
139	0.32
140	0.27
141	0.24
142	0.23
143	0.19
144	0.13
145	0.13
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.11
150	0.13
151	0.14
152	0.14
153	0.16
154	0.24
155	0.26
156	0.27
157	0.29
158	0.28
159	0.29
160	0.3
161	0.29
162	0.24
163	0.22
164	0.2
165	0.19
166	0.2
167	0.17
168	0.14
169	0.14
170	0.15
171	0.17
172	0.26
173	0.28
174	0.36
175	0.45
176	0.51
177	0.59
178	0.66
179	0.72
180	0.73
181	0.81
182	0.81
183	0.83
184	0.87
185	0.88
186	0.88
187	0.89
188	0.84
189	0.81
190	0.76
191	0.66
192	0.63
193	0.59
194	0.56
195	0.52
196	0.55
197	0.52
198	0.5
199	0.52
200	0.55
201	0.5
202	0.49
203	0.46
204	0.39
205	0.36
206	0.35
207	0.33
208	0.25
209	0.25
210	0.19
211	0.17
212	0.15
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.08
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.08
248	0.1
249	0.15
250	0.21
251	0.2
252	0.24
253	0.26
254	0.28
255	0.3
256	0.35
257	0.41
258	0.43
259	0.5
260	0.54
261	0.55
262	0.51
263	0.54
264	0.47
265	0.43
266	0.37
267	0.29
268	0.22
269	0.19
270	0.18
271	0.15
272	0.13
273	0.07
274	0.05
275	0.05
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.11
281	0.15
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.2
286	0.22
287	0.23
288	0.28
289	0.26
290	0.27
291	0.28
292	0.3
293	0.27
294	0.25
295	0.28
296	0.23
297	0.26
298	0.26
299	0.24
300	0.22
301	0.22
302	0.2
303	0.16
304	0.13
305	0.11
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.12
317	0.12
318	0.12
319	0.17
320	0.24
321	0.31
322	0.31
323	0.34
324	0.34
325	0.39
326	0.4
327	0.37
328	0.35
329	0.33
330	0.37
331	0.37
332	0.36
333	0.32
334	0.34
335	0.38
336	0.39
337	0.42
338	0.44
339	0.46
340	0.48
341	0.51
342	0.52
343	0.48
344	0.44
345	0.35
346	0.27
347	0.22
348	0.18
349	0.14
350	0.09
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.1
368	0.15
369	0.15
370	0.16
371	0.18
372	0.18
373	0.18
374	0.21
375	0.21
376	0.18
377	0.26
378	0.27
379	0.25
380	0.25
381	0.25
382	0.22
383	0.2
384	0.18
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.14
393	0.12
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.11
402	0.14
403	0.16
404	0.19
405	0.22
406	0.27
407	0.37
408	0.44
409	0.44
410	0.45
411	0.44
412	0.44
413	0.48
414	0.46
415	0.39
416	0.34
417	0.33
418	0.38
419	0.41
420	0.38
421	0.39
422	0.37
423	0.37
424	0.37
425	0.37
426	0.35
427	0.33
428	0.37
429	0.36
430	0.41
431	0.4
432	0.42
433	0.47
434	0.51
435	0.59
436	0.61
437	0.64
438	0.68
439	0.76
440	0.81
441	0.84
442	0.84
443	0.84
444	0.87
445	0.87
446	0.85
447	0.84
448	0.81
449	0.75
450	0.68
451	0.6
452	0.5
453	0.41
454	0.4
455	0.34
456	0.3
457	0.29
458	0.27
459	0.3
460	0.38
461	0.44
462	0.42
463	0.47
464	0.56
465	0.62
466	0.71
467	0.74
468	0.71
469	0.7
470	0.67
471	0.65
472	0.58
473	0.49
474	0.39
475	0.33
476	0.27
477	0.22
478	0.21
479	0.15
480	0.12
481	0.14
482	0.13
483	0.13
484	0.17
485	0.18
486	0.18
487	0.16
488	0.16
489	0.14
490	0.14
491	0.12
492	0.09
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.13
509	0.14
510	0.21
511	0.29
512	0.33
513	0.38
514	0.43
515	0.52
516	0.55
517	0.64
518	0.67
519	0.68
520	0.67
521	0.64
522	0.59
523	0.5
524	0.42
525	0.33
526	0.26
527	0.24
528	0.22
529	0.2
530	0.2
531	0.22
532	0.24
533	0.24
534	0.25
535	0.21
536	0.21
537	0.2
538	0.21
539	0.2
540	0.19
541	0.18
542	0.15
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.13
557	0.13
558	0.16
559	0.18
560	0.17
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.11
565	0.11
566	0.09
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.1
572	0.1
573	0.12
574	0.19
575	0.2
576	0.24
577	0.32
578	0.38
579	0.41
580	0.46
581	0.52
582	0.49
583	0.49
584	0.47
585	0.44
586	0.43
587	0.43
588	0.39
589	0.38
590	0.4
591	0.46
592	0.5
593	0.49
594	0.46
595	0.45
596	0.42
597	0.44
598	0.44
599	0.46
600	0.48
601	0.56
602	0.61

A0A428U104

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer