FuNGI

C4R540

Protein Details

Accession

C4R540

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-65	SAIQRKAHTLRKYKDDNQRYTRAH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 4, cyto 3.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007231 Nucleoporin_int_Nup93/Nic96
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
KEGG	ppa:PAS_chr3_1204 -
Pfam	View protein in Pfam PF04097 Nic96

Amino Acid Sequences

MPSVEDKALVGGTKSQLKELLVSSRNLPKTLTDISPIHLGLSAIQRKAHTLRKYKDDNQRYTRAHYLLAGSGISAEEIETDLLEISVPQTLDVAMGQKNYADLSNGIDTYIESKKEENILAAIEQSLTMAAKDFDAYVAQNISMDWNQRKKELRESFDIILNGTSKEPSNELVEYTQFGNASKKFKSDPNLTWSANKPILANRVEFTDVEVSSTLPTNVLNPSVSYALRQKFEEYAQAIYELNAARQNNKPYELTNVFAQITKQANDIKSRQLYETWKILYHLVDFNEPAAFQERKFVKGHDSEVLDSFEAIALRKRIIERSRSYLEQQFMDYIDSIYIRLSNKEESKLNTPETPIVDNVTKVKLFVEHRYKKEDTWKIQNLLFINGLPIWAIIFYLLRAGCLDDALNLTLKNSDSFTKVERSFPTYLKAYVNSSDRGFNQELHGRLINEFNQFFKHMNKEADPFRYAVYKLISRCELSRKNLPYITLSVEDWLWVHFTLCREGTNDDDPIYERYSLLDLQKTVLKLGPDNFNGSFNNPLYLQTLIFTGLYEHAVQYFYSISEIDSVHLAIALYYCGLLRSTTDKSNTTQLLTYRGERNIPEINFARLIGTYTRTFKISDPRVAVEYLILICLGGDLPDGRGKEQIELGLSSIRELVLETREFSLLLGKIDREGFRVPGIIEERKNLLHLPDKESFLRKITEQAAIKADDEGRVFDSLLLYQLSENYDTVISLINKLLGDLLASTDLETAIDTPAERAAEGSIIALAERLMKQYSSSTEISGKVLLKHRETCSLLLKMVECRDLFVKQEWEKALKQIGQLDMLPIVAGVNVAVARSKVEVFNSYDESVAKNVPDLLVMTLTCIAQLTYQLTSSEFNGLVKSDKIKYLKEVARNCMLYAGILQYKMPRETYSMLVSLESML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.28
4	0.28
5	0.3
6	0.29
7	0.34
8	0.3
9	0.31
10	0.35
11	0.41
12	0.43
13	0.41
14	0.38
15	0.31
16	0.33
17	0.37
18	0.33
19	0.3
20	0.29
21	0.31
22	0.34
23	0.32
24	0.27
25	0.23
26	0.21
27	0.18
28	0.26
29	0.29
30	0.27
31	0.29
32	0.29
33	0.33
34	0.4
35	0.46
36	0.46
37	0.5
38	0.56
39	0.63
40	0.72
41	0.76
42	0.81
43	0.82
44	0.83
45	0.8
46	0.83
47	0.77
48	0.74
49	0.73
50	0.63
51	0.54
52	0.47
53	0.41
54	0.33
55	0.3
56	0.24
57	0.16
58	0.15
59	0.13
60	0.1
61	0.08
62	0.06
63	0.05
64	0.06
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.08
74	0.08
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.11
81	0.1
82	0.11
83	0.12
84	0.11
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.13
91	0.16
92	0.16
93	0.15
94	0.14
95	0.14
96	0.17
97	0.2
98	0.17
99	0.16
100	0.17
101	0.2
102	0.24
103	0.24
104	0.21
105	0.18
106	0.18
107	0.17
108	0.17
109	0.14
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.09
129	0.12
130	0.13
131	0.19
132	0.25
133	0.31
134	0.33
135	0.4
136	0.48
137	0.48
138	0.57
139	0.6
140	0.59
141	0.58
142	0.62
143	0.58
144	0.54
145	0.5
146	0.4
147	0.32
148	0.28
149	0.21
150	0.17
151	0.16
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.14
156	0.17
157	0.16
158	0.17
159	0.18
160	0.18
161	0.18
162	0.17
163	0.17
164	0.13
165	0.14
166	0.18
167	0.21
168	0.24
169	0.24
170	0.26
171	0.28
172	0.33
173	0.4
174	0.42
175	0.44
176	0.47
177	0.52
178	0.51
179	0.53
180	0.5
181	0.5
182	0.44
183	0.39
184	0.33
185	0.31
186	0.36
187	0.33
188	0.32
189	0.25
190	0.26
191	0.26
192	0.25
193	0.23
194	0.2
195	0.17
196	0.17
197	0.16
198	0.14
199	0.13
200	0.14
201	0.12
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.12
210	0.14
211	0.13
212	0.14
213	0.2
214	0.23
215	0.25
216	0.26
217	0.25
218	0.26
219	0.27
220	0.3
221	0.24
222	0.22
223	0.2
224	0.2
225	0.18
226	0.16
227	0.18
228	0.12
229	0.12
230	0.15
231	0.15
232	0.17
233	0.23
234	0.29
235	0.28
236	0.31
237	0.31
238	0.28
239	0.36
240	0.34
241	0.31
242	0.26
243	0.26
244	0.24
245	0.23
246	0.22
247	0.2
248	0.2
249	0.19
250	0.2
251	0.22
252	0.24
253	0.29
254	0.31
255	0.33
256	0.34
257	0.35
258	0.34
259	0.34
260	0.37
261	0.36
262	0.38
263	0.32
264	0.29
265	0.29
266	0.29
267	0.25
268	0.23
269	0.21
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.16
274	0.15
275	0.13
276	0.12
277	0.14
278	0.13
279	0.12
280	0.2
281	0.21
282	0.24
283	0.25
284	0.25
285	0.26
286	0.29
287	0.32
288	0.28
289	0.29
290	0.27
291	0.27
292	0.27
293	0.21
294	0.18
295	0.15
296	0.11
297	0.09
298	0.08
299	0.1
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.2
305	0.24
306	0.32
307	0.33
308	0.39
309	0.43
310	0.43
311	0.46
312	0.44
313	0.41
314	0.34
315	0.31
316	0.25
317	0.21
318	0.19
319	0.16
320	0.11
321	0.09
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.08
327	0.1
328	0.12
329	0.16
330	0.18
331	0.22
332	0.24
333	0.25
334	0.31
335	0.33
336	0.33
337	0.3
338	0.29
339	0.28
340	0.27
341	0.25
342	0.19
343	0.18
344	0.16
345	0.16
346	0.16
347	0.16
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.15
352	0.17
353	0.24
354	0.34
355	0.39
356	0.42
357	0.48
358	0.49
359	0.47
360	0.54
361	0.54
362	0.49
363	0.51
364	0.54
365	0.5
366	0.51
367	0.51
368	0.42
369	0.35
370	0.3
371	0.2
372	0.15
373	0.12
374	0.11
375	0.07
376	0.06
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.12
404	0.13
405	0.19
406	0.2
407	0.23
408	0.23
409	0.27
410	0.28
411	0.28
412	0.29
413	0.24
414	0.25
415	0.23
416	0.22
417	0.18
418	0.19
419	0.21
420	0.19
421	0.18
422	0.19
423	0.18
424	0.21
425	0.21
426	0.18
427	0.18
428	0.2
429	0.2
430	0.21
431	0.21
432	0.17
433	0.17
434	0.18
435	0.18
436	0.16
437	0.16
438	0.14
439	0.14
440	0.15
441	0.15
442	0.16
443	0.17
444	0.18
445	0.2
446	0.21
447	0.24
448	0.26
449	0.28
450	0.26
451	0.23
452	0.2
453	0.2
454	0.19
455	0.17
456	0.16
457	0.16
458	0.16
459	0.18
460	0.19
461	0.17
462	0.19
463	0.24
464	0.27
465	0.28
466	0.35
467	0.36
468	0.38
469	0.38
470	0.38
471	0.32
472	0.28
473	0.26
474	0.2
475	0.17
476	0.14
477	0.12
478	0.12
479	0.1
480	0.08
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.07
485	0.08
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.13
491	0.15
492	0.16
493	0.16
494	0.13
495	0.13
496	0.14
497	0.15
498	0.15
499	0.12
500	0.1
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.13
506	0.11
507	0.12
508	0.15
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.12
514	0.15
515	0.19
516	0.18
517	0.21
518	0.21
519	0.21
520	0.21
521	0.2
522	0.21
523	0.16
524	0.16
525	0.13
526	0.14
527	0.13
528	0.13
529	0.12
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.1
568	0.13
569	0.16
570	0.19
571	0.21
572	0.22
573	0.28
574	0.28
575	0.25
576	0.24
577	0.22
578	0.25
579	0.25
580	0.27
581	0.25
582	0.26
583	0.27
584	0.25
585	0.28
586	0.28
587	0.26
588	0.28
589	0.25
590	0.26
591	0.24
592	0.24
593	0.2
594	0.14
595	0.15
596	0.11
597	0.13
598	0.14
599	0.17
600	0.18
601	0.18
602	0.19
603	0.2
604	0.29
605	0.31
606	0.34
607	0.34
608	0.34
609	0.35
610	0.34
611	0.31
612	0.21
613	0.17
614	0.11
615	0.09
616	0.07
617	0.05
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.05
625	0.08
626	0.09
627	0.1
628	0.13
629	0.13
630	0.15
631	0.15
632	0.15
633	0.14
634	0.13
635	0.14
636	0.13
637	0.12
638	0.11
639	0.1
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.09
644	0.1
645	0.11
646	0.12
647	0.13
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.15
652	0.13
653	0.13
654	0.13
655	0.12
656	0.14
657	0.17
658	0.18
659	0.16
660	0.17
661	0.16
662	0.16
663	0.17
664	0.15
665	0.17
666	0.21
667	0.23
668	0.23
669	0.24
670	0.25
671	0.24
672	0.26
673	0.22
674	0.21
675	0.24
676	0.26
677	0.31
678	0.32
679	0.35
680	0.37
681	0.4
682	0.39
683	0.33
684	0.32
685	0.26
686	0.28
687	0.27
688	0.31
689	0.29
690	0.3
691	0.31
692	0.3
693	0.29
694	0.26
695	0.24
696	0.19
697	0.18
698	0.16
699	0.15
700	0.14
701	0.14
702	0.12
703	0.12
704	0.1
705	0.11
706	0.1
707	0.08
708	0.08
709	0.09
710	0.1
711	0.11
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.1
717	0.13
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.13
722	0.13
723	0.13
724	0.13
725	0.08
726	0.08
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.05
753	0.05
754	0.08
755	0.08
756	0.1
757	0.1
758	0.11
759	0.12
760	0.15
761	0.18
762	0.21
763	0.21
764	0.22
765	0.24
766	0.25
767	0.25
768	0.26
769	0.25
770	0.25
771	0.32
772	0.35
773	0.37
774	0.43
775	0.44
776	0.48
777	0.49
778	0.48
779	0.47
780	0.44
781	0.4
782	0.35
783	0.34
784	0.31
785	0.31
786	0.32
787	0.25
788	0.24
789	0.26
790	0.25
791	0.27
792	0.26
793	0.33
794	0.3
795	0.37
796	0.38
797	0.4
798	0.4
799	0.42
800	0.43
801	0.37
802	0.38
803	0.37
804	0.35
805	0.33
806	0.31
807	0.28
808	0.22
809	0.19
810	0.15
811	0.1
812	0.08
813	0.06
814	0.05
815	0.04
816	0.04
817	0.04
818	0.05
819	0.06
820	0.06
821	0.07
822	0.09
823	0.11
824	0.12
825	0.14
826	0.18
827	0.21
828	0.25
829	0.29
830	0.28
831	0.27
832	0.26
833	0.25
834	0.23
835	0.21
836	0.17
837	0.14
838	0.14
839	0.13
840	0.14
841	0.13
842	0.12
843	0.12
844	0.11
845	0.12
846	0.12
847	0.12
848	0.11
849	0.1
850	0.09
851	0.08
852	0.11
853	0.12
854	0.12
855	0.13
856	0.14
857	0.15
858	0.16
859	0.17
860	0.18
861	0.16
862	0.16
863	0.16
864	0.16
865	0.18
866	0.19
867	0.23
868	0.22
869	0.29
870	0.32
871	0.34
872	0.39
873	0.46
874	0.5
875	0.54
876	0.58
877	0.57
878	0.62
879	0.6
880	0.54
881	0.47
882	0.4
883	0.31
884	0.26
885	0.25
886	0.19
887	0.18
888	0.19
889	0.22
890	0.27
891	0.29
892	0.3
893	0.26
894	0.28
895	0.31
896	0.34
897	0.33
898	0.3
899	0.28
900	0.26

C4R540

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer