Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428T5S1

Protein Details
Accession A0A428T5S1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-251IEEPQPKQPKKPARKAGKSRASKRKAPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-254PKQPKKPARKAGKSRASKRKAPASKR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 10.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Amino Acid Sequences MAPIRVLRFARSDDKSAFVLVQVTPKGSKPLDLKLVGTEGEAPYVASLKHDRVVSLRVKNCPASEDEWQSILEALFQQEPVPDIQATATVQSDKSISITIRKEIQGITQRLGAVTLNYDPDEAIELFEWCGAAAESSATSKQAVADLTVKSTDSEAAVAQLQSQLEELLRAKDEDETALLRKFRDLLNEKKVKIREQQQVLASTTFNASMPGHSQPSESVEIKIEEPQPKQPKKPARKAGKSRASKRKAPASKRVEESEEEEVQSMDVDIKQEPEDTDPGHTTEATASVSSDNEDDAGVLSSSSQQRDVSESAAPREEAPSQVSQPPPRRELPFSLRKSAKPAPPPAGSDTDSDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.37
4 0.32
5 0.24
6 0.22
7 0.18
8 0.22
9 0.19
10 0.21
11 0.21
12 0.22
13 0.28
14 0.25
15 0.31
16 0.29
17 0.35
18 0.4
19 0.4
20 0.4
21 0.36
22 0.37
23 0.31
24 0.27
25 0.23
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.14
35 0.15
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.29
41 0.33
42 0.39
43 0.42
44 0.43
45 0.47
46 0.49
47 0.47
48 0.43
49 0.39
50 0.34
51 0.35
52 0.35
53 0.33
54 0.3
55 0.3
56 0.27
57 0.25
58 0.2
59 0.15
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.24
88 0.25
89 0.25
90 0.23
91 0.29
92 0.32
93 0.32
94 0.31
95 0.28
96 0.28
97 0.26
98 0.26
99 0.2
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.19
172 0.23
173 0.28
174 0.37
175 0.42
176 0.43
177 0.47
178 0.49
179 0.45
180 0.46
181 0.48
182 0.46
183 0.45
184 0.49
185 0.46
186 0.46
187 0.44
188 0.38
189 0.29
190 0.21
191 0.17
192 0.13
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.15
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.17
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.32
215 0.41
216 0.45
217 0.49
218 0.54
219 0.59
220 0.65
221 0.74
222 0.75
223 0.76
224 0.82
225 0.87
226 0.89
227 0.89
228 0.88
229 0.88
230 0.89
231 0.84
232 0.81
233 0.78
234 0.77
235 0.77
236 0.74
237 0.75
238 0.72
239 0.73
240 0.7
241 0.66
242 0.59
243 0.51
244 0.48
245 0.43
246 0.36
247 0.3
248 0.25
249 0.22
250 0.18
251 0.16
252 0.12
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.11
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.23
295 0.24
296 0.21
297 0.22
298 0.24
299 0.25
300 0.27
301 0.26
302 0.23
303 0.24
304 0.23
305 0.21
306 0.22
307 0.23
308 0.24
309 0.29
310 0.34
311 0.41
312 0.49
313 0.54
314 0.55
315 0.58
316 0.6
317 0.6
318 0.63
319 0.63
320 0.64
321 0.63
322 0.67
323 0.66
324 0.63
325 0.66
326 0.65
327 0.64
328 0.63
329 0.66
330 0.63
331 0.63
332 0.64
333 0.61
334 0.58
335 0.51
336 0.44
337 0.41