Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428TIF8

Protein Details
Accession A0A428TIF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-92NKPSRPSSTRTPQSRKSRQYTCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MDSAITWNGLGGIRRDRSHHINESESTVGDGRNLEQDEPKVSEAIDMPEKHNPVAANETDRCYDVGVKWNNKPSRPSSTRTPQSRKSRQYTCAEAETLHQKTMQPRSRSPSPEHPEPLSSVVKSARELFEQREYEKSENKYNEALKLHTEALGASSPCIISIKGNLANALVRQGKHSEAKDIYQEILDLSTDVLDKKHPYRLSCRSNLASILEKKGQYEKAETVYRDVWELQRKWLGDNHRYTLASYNKLANALTRLKRFDKAVDIYRKALEARREVLGDKHPHTIITLGNLANALQNQGHDDEAKKKYKEAKDLGEEVLKGGHPHLKWIVGRHEEALKAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.38
4 0.44
5 0.5
6 0.55
7 0.51
8 0.52
9 0.52
10 0.52
11 0.47
12 0.4
13 0.33
14 0.26
15 0.21
16 0.18
17 0.17
18 0.13
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.22
23 0.24
24 0.26
25 0.28
26 0.28
27 0.22
28 0.2
29 0.21
30 0.19
31 0.21
32 0.24
33 0.23
34 0.25
35 0.3
36 0.32
37 0.3
38 0.31
39 0.27
40 0.23
41 0.27
42 0.26
43 0.27
44 0.28
45 0.31
46 0.29
47 0.29
48 0.27
49 0.22
50 0.23
51 0.18
52 0.25
53 0.31
54 0.36
55 0.4
56 0.49
57 0.53
58 0.54
59 0.58
60 0.54
61 0.57
62 0.56
63 0.55
64 0.56
65 0.61
66 0.67
67 0.71
68 0.73
69 0.72
70 0.79
71 0.84
72 0.84
73 0.81
74 0.79
75 0.77
76 0.75
77 0.72
78 0.65
79 0.58
80 0.5
81 0.41
82 0.37
83 0.37
84 0.32
85 0.26
86 0.23
87 0.22
88 0.28
89 0.37
90 0.42
91 0.4
92 0.43
93 0.5
94 0.57
95 0.59
96 0.59
97 0.6
98 0.59
99 0.61
100 0.6
101 0.54
102 0.48
103 0.45
104 0.43
105 0.34
106 0.27
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.17
113 0.18
114 0.2
115 0.21
116 0.26
117 0.27
118 0.27
119 0.28
120 0.31
121 0.3
122 0.35
123 0.34
124 0.34
125 0.34
126 0.35
127 0.36
128 0.33
129 0.35
130 0.31
131 0.29
132 0.23
133 0.23
134 0.22
135 0.18
136 0.16
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.15
162 0.19
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.15
171 0.14
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.09
183 0.11
184 0.18
185 0.2
186 0.23
187 0.31
188 0.4
189 0.46
190 0.48
191 0.51
192 0.46
193 0.45
194 0.43
195 0.37
196 0.34
197 0.29
198 0.29
199 0.27
200 0.25
201 0.25
202 0.29
203 0.3
204 0.25
205 0.27
206 0.25
207 0.26
208 0.3
209 0.3
210 0.28
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.27
217 0.27
218 0.28
219 0.3
220 0.3
221 0.3
222 0.34
223 0.37
224 0.36
225 0.4
226 0.39
227 0.39
228 0.39
229 0.38
230 0.41
231 0.38
232 0.34
233 0.31
234 0.31
235 0.27
236 0.28
237 0.27
238 0.21
239 0.21
240 0.26
241 0.3
242 0.31
243 0.35
244 0.37
245 0.4
246 0.41
247 0.39
248 0.38
249 0.38
250 0.44
251 0.48
252 0.48
253 0.48
254 0.46
255 0.44
256 0.39
257 0.38
258 0.35
259 0.3
260 0.3
261 0.3
262 0.31
263 0.3
264 0.32
265 0.36
266 0.36
267 0.34
268 0.36
269 0.34
270 0.33
271 0.32
272 0.3
273 0.23
274 0.2
275 0.21
276 0.16
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.13
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.17
290 0.23
291 0.31
292 0.39
293 0.37
294 0.42
295 0.51
296 0.57
297 0.64
298 0.63
299 0.64
300 0.63
301 0.66
302 0.64
303 0.58
304 0.5
305 0.41
306 0.35
307 0.27
308 0.2
309 0.19
310 0.22
311 0.18
312 0.23
313 0.26
314 0.3
315 0.32
316 0.37
317 0.44
318 0.43
319 0.45
320 0.43
321 0.45