Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428U6X7

Protein Details
Accession A0A428U6X7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-270NGAGAQKRKNARGPGRPRKRARADSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-266AQKRKNARGPGRPRKRAR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MLPPHADPYDVPASPLRAKNRTMATDTSSKDGDVVTARDGHKASPAARIGTPRGTPRGTPRGTPRATPKIATPANDEKPDRSTPAAAEPTEPKSIDKRNGDKDAQVNGDAVADTTAGFRDDVEIDEFIDHRVDEATSTVDIQVKWEGGETTWETEWSLQEQVPTLVFKYWDKLDGRDAATSLDIYHVFKILKRTSLPGKSKKPQYMYQVQWVGYRRTDSTWEHEDKLREIAPAELEKFEAKEMANGAGAQKRKNARGPGRPRKRARADSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.41
4 0.4
5 0.42
6 0.47
7 0.51
8 0.51
9 0.49
10 0.46
11 0.44
12 0.46
13 0.46
14 0.43
15 0.36
16 0.31
17 0.27
18 0.24
19 0.21
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.19
24 0.2
25 0.23
26 0.24
27 0.22
28 0.24
29 0.26
30 0.26
31 0.27
32 0.29
33 0.28
34 0.29
35 0.32
36 0.31
37 0.32
38 0.34
39 0.32
40 0.34
41 0.33
42 0.34
43 0.39
44 0.46
45 0.42
46 0.44
47 0.48
48 0.53
49 0.53
50 0.55
51 0.55
52 0.55
53 0.55
54 0.51
55 0.45
56 0.45
57 0.45
58 0.42
59 0.4
60 0.4
61 0.43
62 0.47
63 0.46
64 0.38
65 0.4
66 0.4
67 0.36
68 0.29
69 0.25
70 0.21
71 0.27
72 0.28
73 0.24
74 0.24
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.27
79 0.21
80 0.24
81 0.29
82 0.34
83 0.39
84 0.42
85 0.47
86 0.52
87 0.52
88 0.5
89 0.48
90 0.44
91 0.38
92 0.32
93 0.25
94 0.19
95 0.18
96 0.14
97 0.1
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.09
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.24
162 0.25
163 0.23
164 0.22
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.12
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.19
177 0.2
178 0.23
179 0.23
180 0.28
181 0.34
182 0.43
183 0.5
184 0.53
185 0.6
186 0.65
187 0.72
188 0.75
189 0.72
190 0.69
191 0.69
192 0.69
193 0.64
194 0.64
195 0.6
196 0.53
197 0.52
198 0.49
199 0.44
200 0.36
201 0.35
202 0.28
203 0.25
204 0.3
205 0.28
206 0.31
207 0.36
208 0.38
209 0.38
210 0.42
211 0.42
212 0.38
213 0.4
214 0.34
215 0.27
216 0.24
217 0.23
218 0.22
219 0.23
220 0.23
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.2
235 0.23
236 0.22
237 0.28
238 0.34
239 0.39
240 0.47
241 0.54
242 0.59
243 0.67
244 0.76
245 0.8
246 0.85
247 0.89
248 0.9
249 0.9
250 0.91