Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428SBX2

Protein Details
Accession A0A428SBX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-470ERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSBasic
488-509PESQKTMTKKEMKKNQQAKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-462RKRQKRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10.5, cyto_nucl 8.333, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQPQAQVPPRAFSPPQPTPSPAASQSSFALPPQKRVRTDGPPSQPESPYATSPYAASPGPTGTPPAAANSPAYAHSPALPQPYATPYTNGHTTPGLNLPDARPNSTPPIQTPHHPPMPQYTNATMTPVPAPAVAPVVAPVQGPGAMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMNELYSTGFDEARTGFAQHPPGAKGSFYGAGPANQPAQSTPDQSQEQFAAQQAERAWSESSMRLAVQRTQEIGDPFLMVATLHRRADKIAREHHLSLNLDLKNNSQTMGKMRLPEQFPCPKVNIKTAQGPDAALVQTTGSYIPHDAYLVDQLALLSIASKQRLRGLLEDAHVVATNRQKTSHGDVPEDWAPAAAPMNAEPLQPIEKPAEGADATGVESVNGEGTNPLKRSAEGAGLTNGAPPVKLPKISSYMTTTMRDLARQERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSTTSRAGSVAPGTPGTTAPESQKTMTKKEMKKNQQAKAAELDSHQSQNTTSSLFAGLGGKGGLFGKKKTGKTYDWMNVGRGGSGASTPTRNPSGLGKGAGGSAAAAAPVNMAMTTEGRNRLGTWREDKEKGRNIQLRDWVSVLERDGREHKALQRAYLHLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.49
4 0.47
5 0.51
6 0.52
7 0.53
8 0.51
9 0.53
10 0.51
11 0.44
12 0.42
13 0.38
14 0.36
15 0.34
16 0.33
17 0.3
18 0.26
19 0.33
20 0.28
21 0.36
22 0.44
23 0.5
24 0.5
25 0.56
26 0.61
27 0.61
28 0.69
29 0.69
30 0.69
31 0.67
32 0.69
33 0.68
34 0.62
35 0.55
36 0.53
37 0.46
38 0.39
39 0.37
40 0.33
41 0.28
42 0.28
43 0.27
44 0.23
45 0.19
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.14
53 0.17
54 0.16
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.19
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.21
68 0.25
69 0.24
70 0.22
71 0.22
72 0.26
73 0.29
74 0.27
75 0.27
76 0.24
77 0.28
78 0.32
79 0.3
80 0.27
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.27
85 0.24
86 0.21
87 0.23
88 0.23
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.27
93 0.29
94 0.35
95 0.37
96 0.38
97 0.32
98 0.37
99 0.36
100 0.39
101 0.44
102 0.45
103 0.48
104 0.47
105 0.45
106 0.48
107 0.51
108 0.5
109 0.45
110 0.4
111 0.37
112 0.36
113 0.38
114 0.28
115 0.25
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.08
135 0.1
136 0.12
137 0.13
138 0.17
139 0.2
140 0.22
141 0.24
142 0.27
143 0.34
144 0.38
145 0.41
146 0.43
147 0.46
148 0.46
149 0.46
150 0.44
151 0.39
152 0.35
153 0.32
154 0.26
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.18
189 0.19
190 0.21
191 0.2
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.22
213 0.23
214 0.23
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.14
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.14
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.05
250 0.06
251 0.09
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.21
258 0.26
259 0.29
260 0.32
261 0.35
262 0.39
263 0.41
264 0.41
265 0.4
266 0.35
267 0.3
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.22
272 0.22
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.22
283 0.27
284 0.28
285 0.29
286 0.32
287 0.32
288 0.32
289 0.32
290 0.33
291 0.32
292 0.32
293 0.35
294 0.33
295 0.29
296 0.34
297 0.33
298 0.32
299 0.28
300 0.26
301 0.21
302 0.18
303 0.15
304 0.09
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.05
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.13
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.21
340 0.18
341 0.16
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.14
346 0.17
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.21
351 0.28
352 0.31
353 0.28
354 0.27
355 0.27
356 0.31
357 0.31
358 0.28
359 0.21
360 0.15
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.09
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.11
396 0.11
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.18
403 0.15
404 0.16
405 0.15
406 0.16
407 0.15
408 0.14
409 0.13
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.12
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.18
418 0.24
419 0.25
420 0.27
421 0.26
422 0.28
423 0.3
424 0.3
425 0.27
426 0.26
427 0.26
428 0.25
429 0.23
430 0.26
431 0.29
432 0.29
433 0.32
434 0.3
435 0.33
436 0.34
437 0.35
438 0.35
439 0.35
440 0.39
441 0.46
442 0.53
443 0.58
444 0.66
445 0.73
446 0.77
447 0.81
448 0.86
449 0.87
450 0.86
451 0.86
452 0.79
453 0.71
454 0.65
455 0.57
456 0.48
457 0.39
458 0.3
459 0.23
460 0.19
461 0.17
462 0.12
463 0.1
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.21
476 0.23
477 0.24
478 0.29
479 0.3
480 0.33
481 0.41
482 0.47
483 0.51
484 0.59
485 0.68
486 0.72
487 0.79
488 0.84
489 0.82
490 0.81
491 0.74
492 0.67
493 0.63
494 0.55
495 0.45
496 0.37
497 0.34
498 0.28
499 0.28
500 0.25
501 0.19
502 0.17
503 0.18
504 0.18
505 0.15
506 0.12
507 0.11
508 0.12
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.13
519 0.13
520 0.15
521 0.24
522 0.31
523 0.35
524 0.42
525 0.47
526 0.46
527 0.5
528 0.58
529 0.55
530 0.56
531 0.55
532 0.49
533 0.47
534 0.43
535 0.38
536 0.28
537 0.22
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.11
542 0.14
543 0.14
544 0.2
545 0.22
546 0.22
547 0.23
548 0.26
549 0.3
550 0.31
551 0.31
552 0.27
553 0.24
554 0.24
555 0.23
556 0.17
557 0.11
558 0.08
559 0.06
560 0.05
561 0.05
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.04
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.11
571 0.16
572 0.2
573 0.21
574 0.22
575 0.23
576 0.29
577 0.34
578 0.38
579 0.41
580 0.46
581 0.51
582 0.58
583 0.63
584 0.66
585 0.69
586 0.68
587 0.71
588 0.69
589 0.67
590 0.68
591 0.71
592 0.64
593 0.58
594 0.52
595 0.43
596 0.39
597 0.36
598 0.31
599 0.3
600 0.27
601 0.29
602 0.33
603 0.36
604 0.37
605 0.4
606 0.44
607 0.45
608 0.46
609 0.47
610 0.48
611 0.46
612 0.49
613 0.47
614 0.42
615 0.33