Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JDQ9

Protein Details
Accession A0A421JDQ9    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-39AQEIRHKRKAAQSSTSRKRHSKHVKTGVQDEQHydrophilic
292-313ANGKRFRQTKFKVRGSRYQYTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-17KRKA
23-27SRKRH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
IPR002675  Ribosomal_L38e  
IPR038464  Ribosomal_L38e_sf  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF01781  Ribosomal_L38e  
Amino Acid Sequences MDFSNLLAQEIRHKRKAAQSSTSRKRHSKHVKTGVQDEQLHEEKDEENKEREEKEEEVDDETHKNDKSEPNQEKNPDLDNHHEHTQHQYNQQQAKEQGTPSLFDKQEIADETLQDKIATQCRKYIKSMLYAWEDQVQSAPDSQPNAKLLIETKRDMVPLLYKLRTGTIHKDLLTSLATTLYYLQVNDMIHANDAYMKMSLGNVVWPIGIVGVGIRETTTIKHANVMIDDTTRRWITAIKRLITRKERHDQGANPGPLSTMAREIKDIKEFVELARRADIKSATVKVNKKLNANGKRFRQTKFKVRGSRYQYTLIVNDAAKAKKLQQSLPPTLEIKNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.58
3 0.67
4 0.65
5 0.65
6 0.67
7 0.72
8 0.81
9 0.84
10 0.83
11 0.81
12 0.77
13 0.78
14 0.79
15 0.78
16 0.79
17 0.8
18 0.8
19 0.78
20 0.82
21 0.78
22 0.74
23 0.66
24 0.57
25 0.53
26 0.5
27 0.44
28 0.37
29 0.31
30 0.25
31 0.29
32 0.33
33 0.3
34 0.31
35 0.34
36 0.38
37 0.38
38 0.39
39 0.37
40 0.32
41 0.32
42 0.32
43 0.29
44 0.28
45 0.28
46 0.27
47 0.24
48 0.24
49 0.25
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.29
54 0.34
55 0.43
56 0.5
57 0.53
58 0.59
59 0.62
60 0.6
61 0.55
62 0.53
63 0.46
64 0.41
65 0.41
66 0.4
67 0.41
68 0.42
69 0.4
70 0.36
71 0.4
72 0.44
73 0.42
74 0.43
75 0.42
76 0.45
77 0.5
78 0.5
79 0.48
80 0.43
81 0.42
82 0.39
83 0.36
84 0.33
85 0.27
86 0.28
87 0.25
88 0.3
89 0.25
90 0.23
91 0.23
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.18
105 0.21
106 0.21
107 0.26
108 0.31
109 0.34
110 0.36
111 0.4
112 0.35
113 0.37
114 0.39
115 0.38
116 0.37
117 0.35
118 0.33
119 0.31
120 0.28
121 0.22
122 0.21
123 0.17
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.09
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.15
136 0.2
137 0.22
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.2
143 0.18
144 0.14
145 0.16
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.13
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.05
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.15
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.17
222 0.2
223 0.29
224 0.35
225 0.34
226 0.41
227 0.46
228 0.54
229 0.58
230 0.6
231 0.59
232 0.61
233 0.63
234 0.62
235 0.64
236 0.58
237 0.59
238 0.62
239 0.55
240 0.46
241 0.4
242 0.35
243 0.3
244 0.28
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.21
250 0.24
251 0.26
252 0.29
253 0.28
254 0.22
255 0.23
256 0.23
257 0.22
258 0.29
259 0.26
260 0.24
261 0.29
262 0.29
263 0.26
264 0.29
265 0.29
266 0.22
267 0.28
268 0.3
269 0.3
270 0.37
271 0.42
272 0.45
273 0.53
274 0.53
275 0.53
276 0.57
277 0.62
278 0.64
279 0.68
280 0.7
281 0.71
282 0.76
283 0.76
284 0.72
285 0.72
286 0.71
287 0.72
288 0.74
289 0.75
290 0.75
291 0.77
292 0.83
293 0.81
294 0.8
295 0.74
296 0.69
297 0.62
298 0.56
299 0.51
300 0.43
301 0.38
302 0.3
303 0.29
304 0.29
305 0.27
306 0.25
307 0.26
308 0.3
309 0.33
310 0.37
311 0.4
312 0.43
313 0.51
314 0.57
315 0.59
316 0.57
317 0.52