FuNGI

A0A421J9Y2

Protein Details

Accession

A0A421J9Y2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-74	VKDFTKPVRLHRKDPQNIQF	Hydrophilic
109-133	APDGGGRKNKKNMFKRKTRQISLMD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
115-125	RKNKKNMFKRK
339-341	GKK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPVKKEGPVKSESSSPNDGWQEIPLRCCTIEDVKDARYHIMKFQSKQDVNIVKDFTKPVRLHRKDPQNIQFQLTRKEIDEKRREGATQIVPENGEGEEEMDLSQVAPDGGGRKNKKNMFKRKTRQISLMDESKRKLRFEEFYPWVIEDYDGKNIYVGNYEAGSSDTQQVLFVFDRDGFKMIPAEKVYRFTPRNKYTTLTLEEAEAKMEKKSAVPRWLMKRMEDNPAEASPDQRLGNVSSAQAMSNSSRRMRTVMGGSTSNDRDSDHDDLDFDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEQKVKKEQLKAAHFDGQSDADVDDDLDDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSDDDDEDGLNPYLSRSDIENDDDDENEETAVKTEEDGSQSLSGRRAFYATNLGNSFVSIKAPMGFLSGFPKGDWNPQGFKRQAEMATPSPSKKVKLEENKSVSPTPSSSVDLHSAGPNNDLVTVEEVLNIVRKEPLTTKQLLLVLKNRVYAHPDNKLRIINIVKQNLRLSNGMLVLKEEH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.49
3	0.48
4	0.47
5	0.43
6	0.45
7	0.44
8	0.42
9	0.35
10	0.35
11	0.36
12	0.32
13	0.35
14	0.3
15	0.3
16	0.3
17	0.3
18	0.3
19	0.31
20	0.31
21	0.35
22	0.36
23	0.36
24	0.4
25	0.4
26	0.4
27	0.36
28	0.35
29	0.34
30	0.41
31	0.45
32	0.45
33	0.52
34	0.58
35	0.55
36	0.56
37	0.59
38	0.56
39	0.53
40	0.55
41	0.5
42	0.4
43	0.42
44	0.43
45	0.37
46	0.38
47	0.37
48	0.42
49	0.5
50	0.54
51	0.58
52	0.64
53	0.73
54	0.72
55	0.8
56	0.79
57	0.77
58	0.73
59	0.7
60	0.66
61	0.59
62	0.57
63	0.5
64	0.44
65	0.36
66	0.43
67	0.45
68	0.5
69	0.55
70	0.52
71	0.54
72	0.54
73	0.53
74	0.45
75	0.47
76	0.42
77	0.39
78	0.37
79	0.34
80	0.32
81	0.31
82	0.3
83	0.22
84	0.16
85	0.09
86	0.09
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.04
97	0.05
98	0.08
99	0.13
100	0.22
101	0.27
102	0.34
103	0.43
104	0.5
105	0.59
106	0.67
107	0.74
108	0.75
109	0.81
110	0.84
111	0.87
112	0.9
113	0.85
114	0.82
115	0.77
116	0.75
117	0.7
118	0.68
119	0.63
120	0.56
121	0.54
122	0.53
123	0.5
124	0.43
125	0.39
126	0.37
127	0.35
128	0.37
129	0.44
130	0.41
131	0.4
132	0.41
133	0.38
134	0.33
135	0.29
136	0.24
137	0.18
138	0.15
139	0.18
140	0.17
141	0.17
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.14
146	0.13
147	0.09
148	0.08
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.09
154	0.11
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.1
159	0.12
160	0.11
161	0.11
162	0.09
163	0.11
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.11
168	0.12
169	0.15
170	0.15
171	0.17
172	0.17
173	0.2
174	0.2
175	0.23
176	0.24
177	0.29
178	0.32
179	0.35
180	0.44
181	0.46
182	0.49
183	0.48
184	0.49
185	0.44
186	0.46
187	0.43
188	0.34
189	0.28
190	0.25
191	0.25
192	0.22
193	0.2
194	0.15
195	0.12
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.19
201	0.24
202	0.29
203	0.32
204	0.38
205	0.45
206	0.52
207	0.51
208	0.45
209	0.47
210	0.44
211	0.48
212	0.42
213	0.36
214	0.31
215	0.3
216	0.3
217	0.22
218	0.2
219	0.13
220	0.16
221	0.14
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.13
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.12
235	0.14
236	0.15
237	0.16
238	0.17
239	0.18
240	0.18
241	0.19
242	0.19
243	0.18
244	0.18
245	0.18
246	0.18
247	0.2
248	0.2
249	0.18
250	0.15
251	0.13
252	0.12
253	0.15
254	0.17
255	0.14
256	0.13
257	0.13
258	0.13
259	0.14
260	0.13
261	0.09
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.03
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.13
285	0.16
286	0.22
287	0.31
288	0.38
289	0.44
290	0.48
291	0.52
292	0.55
293	0.56
294	0.54
295	0.48
296	0.48
297	0.42
298	0.37
299	0.33
300	0.25
301	0.21
302	0.18
303	0.14
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.12
318	0.14
319	0.17
320	0.18
321	0.25
322	0.34
323	0.41
324	0.51
325	0.57
326	0.65
327	0.7
328	0.76
329	0.77
330	0.77
331	0.75
332	0.73
333	0.72
334	0.65
335	0.59
336	0.55
337	0.48
338	0.4
339	0.34
340	0.25
341	0.17
342	0.14
343	0.13
344	0.1
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.1
359	0.13
360	0.15
361	0.16
362	0.18
363	0.18
364	0.17
365	0.17
366	0.16
367	0.14
368	0.11
369	0.1
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.1
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.15
381	0.16
382	0.18
383	0.2
384	0.2
385	0.19
386	0.19
387	0.18
388	0.17
389	0.17
390	0.24
391	0.22
392	0.25
393	0.24
394	0.25
395	0.24
396	0.24
397	0.23
398	0.14
399	0.14
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.14
409	0.15
410	0.15
411	0.15
412	0.19
413	0.18
414	0.25
415	0.28
416	0.28
417	0.33
418	0.37
419	0.46
420	0.44
421	0.44
422	0.4
423	0.41
424	0.38
425	0.35
426	0.37
427	0.32
428	0.37
429	0.38
430	0.37
431	0.38
432	0.39
433	0.39
434	0.37
435	0.4
436	0.43
437	0.51
438	0.58
439	0.62
440	0.66
441	0.68
442	0.68
443	0.64
444	0.55
445	0.47
446	0.4
447	0.33
448	0.29
449	0.28
450	0.24
451	0.25
452	0.27
453	0.25
454	0.25
455	0.25
456	0.26
457	0.23
458	0.23
459	0.21
460	0.18
461	0.17
462	0.16
463	0.14
464	0.13
465	0.14
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.12
470	0.16
471	0.14
472	0.12
473	0.14
474	0.14
475	0.17
476	0.22
477	0.28
478	0.29
479	0.33
480	0.33
481	0.35
482	0.39
483	0.38
484	0.39
485	0.4
486	0.42
487	0.41
488	0.45
489	0.42
490	0.39
491	0.44
492	0.48
493	0.48
494	0.51
495	0.55
496	0.55
497	0.59
498	0.6
499	0.53
500	0.52
501	0.5
502	0.49
503	0.51
504	0.56
505	0.53
506	0.55
507	0.6
508	0.56
509	0.54
510	0.46
511	0.39
512	0.35
513	0.36
514	0.32
515	0.27

A0A421J9Y2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer