Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JAM2

Protein Details
Accession A0A421JAM2    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-226EIQPEKVKMKKIKKKSSKSRKREQAMDPBasic
451-470AEPKQKRKYESYSSNNKYRPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-220KVKMKKIKKKSSKSRKR
500-515AKPGKGPADKRRAKSG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MEISLSLEETNKLRRQLGLQEIPQDDAPSPSQGSTKDSLSIAETNKLRASAGLKPIPETDSKEKVAASTERASETRGNRSEGSGRRLLEKLKSRRNMTHLENEPHDNHEIVNTDDWLNSLGKQAEDTEGNLVQNTVPKDKTIDKSEAARNSSTPKLDSKLSLNSQNHEEESSELPKASKEPGEEASKKRLAISLFDEDEIQPEKVKMKKIKKKSSKSRKREQAMDPFEVKPVALEHFDDDDNEFELQSMINQNRRMKHQQRKKLTSEELAKEISQLESWDSKDALDRTAAATAASGLVFDDTSDFLSSLSTVKTEANSEMTETNSEKPESETKKDPKANEQSESHTKPSELNEEGTRPRFNAGIAATLNYLKSQSVLETGTKQSSQEAREQREAAKRAEMTKLNIEIESRLVREQLEADGSYKSLPKEEKETIFERYLDERLREKGLLQAAEPKQKRKYESYSSNNKYRPQVQLVYKDKDGHELSQKEAFKHLSHQFHGAKPGKGPADKRRAKSGSGPSERIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.43
4 0.5
5 0.51
6 0.49
7 0.53
8 0.52
9 0.52
10 0.48
11 0.41
12 0.31
13 0.26
14 0.24
15 0.2
16 0.2
17 0.19
18 0.21
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.24
27 0.28
28 0.25
29 0.29
30 0.29
31 0.29
32 0.3
33 0.29
34 0.26
35 0.24
36 0.25
37 0.25
38 0.33
39 0.34
40 0.33
41 0.35
42 0.37
43 0.37
44 0.36
45 0.37
46 0.35
47 0.37
48 0.38
49 0.38
50 0.36
51 0.34
52 0.37
53 0.32
54 0.3
55 0.28
56 0.28
57 0.3
58 0.3
59 0.32
60 0.34
61 0.35
62 0.39
63 0.38
64 0.4
65 0.38
66 0.41
67 0.46
68 0.45
69 0.47
70 0.43
71 0.4
72 0.41
73 0.42
74 0.42
75 0.42
76 0.46
77 0.5
78 0.55
79 0.62
80 0.64
81 0.68
82 0.71
83 0.7
84 0.66
85 0.66
86 0.64
87 0.61
88 0.59
89 0.57
90 0.52
91 0.48
92 0.43
93 0.33
94 0.25
95 0.22
96 0.2
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.15
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.21
126 0.27
127 0.32
128 0.33
129 0.35
130 0.33
131 0.39
132 0.45
133 0.47
134 0.44
135 0.39
136 0.35
137 0.36
138 0.37
139 0.32
140 0.28
141 0.25
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.29
147 0.31
148 0.38
149 0.36
150 0.36
151 0.38
152 0.37
153 0.34
154 0.28
155 0.25
156 0.18
157 0.2
158 0.2
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.28
170 0.32
171 0.34
172 0.39
173 0.39
174 0.38
175 0.35
176 0.34
177 0.27
178 0.25
179 0.27
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.23
184 0.2
185 0.21
186 0.2
187 0.16
188 0.11
189 0.11
190 0.15
191 0.18
192 0.25
193 0.32
194 0.41
195 0.5
196 0.6
197 0.7
198 0.77
199 0.84
200 0.88
201 0.91
202 0.91
203 0.91
204 0.91
205 0.9
206 0.86
207 0.83
208 0.79
209 0.79
210 0.73
211 0.68
212 0.6
213 0.5
214 0.45
215 0.36
216 0.28
217 0.18
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.1
237 0.14
238 0.19
239 0.22
240 0.25
241 0.31
242 0.4
243 0.46
244 0.54
245 0.6
246 0.65
247 0.72
248 0.77
249 0.76
250 0.73
251 0.66
252 0.62
253 0.6
254 0.52
255 0.44
256 0.37
257 0.32
258 0.26
259 0.23
260 0.17
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.16
315 0.24
316 0.27
317 0.3
318 0.37
319 0.4
320 0.49
321 0.54
322 0.53
323 0.54
324 0.59
325 0.59
326 0.55
327 0.51
328 0.49
329 0.53
330 0.55
331 0.47
332 0.38
333 0.34
334 0.32
335 0.33
336 0.32
337 0.24
338 0.23
339 0.23
340 0.26
341 0.3
342 0.3
343 0.28
344 0.23
345 0.23
346 0.2
347 0.18
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.11
357 0.11
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.15
366 0.17
367 0.19
368 0.19
369 0.18
370 0.21
371 0.24
372 0.24
373 0.3
374 0.36
375 0.39
376 0.44
377 0.45
378 0.46
379 0.5
380 0.51
381 0.45
382 0.43
383 0.39
384 0.37
385 0.42
386 0.39
387 0.34
388 0.36
389 0.37
390 0.33
391 0.31
392 0.29
393 0.23
394 0.24
395 0.22
396 0.18
397 0.16
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.17
412 0.19
413 0.21
414 0.28
415 0.34
416 0.37
417 0.4
418 0.42
419 0.42
420 0.42
421 0.39
422 0.35
423 0.32
424 0.33
425 0.31
426 0.32
427 0.3
428 0.31
429 0.34
430 0.31
431 0.29
432 0.29
433 0.31
434 0.28
435 0.26
436 0.32
437 0.34
438 0.43
439 0.47
440 0.48
441 0.51
442 0.55
443 0.6
444 0.59
445 0.62
446 0.62
447 0.69
448 0.72
449 0.75
450 0.77
451 0.81
452 0.78
453 0.75
454 0.72
455 0.68
456 0.65
457 0.61
458 0.62
459 0.61
460 0.66
461 0.68
462 0.67
463 0.64
464 0.61
465 0.55
466 0.54
467 0.49
468 0.44
469 0.46
470 0.42
471 0.42
472 0.45
473 0.47
474 0.41
475 0.43
476 0.41
477 0.33
478 0.39
479 0.44
480 0.43
481 0.43
482 0.51
483 0.51
484 0.51
485 0.6
486 0.57
487 0.51
488 0.47
489 0.52
490 0.5
491 0.51
492 0.56
493 0.56
494 0.61
495 0.67
496 0.69
497 0.72
498 0.69
499 0.67
500 0.68
501 0.68
502 0.68
503 0.68