Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421J3Y2

Protein Details
Accession A0A421J3Y2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-104LASPDPTPYKSPRKSHRRRKSHVAEAEMGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-95PRKSHRRRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028606  Clp1  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR010655  Clp1_C  
IPR038238  Clp1_C_sf  
IPR032324  Clp1_N  
IPR038239  Clp1_N_sf  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005849  C:mRNA cleavage factor complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06807  Clp1  
PF16573  CLP1_N  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MNPFLEPQTPPRSSKNRPHVHISDNSSSTQETLFPQTPNKKEKSHLQTPSTSSHSKRVRNFLQTPSSVQKLNGNFLASPDPTPYKSPRKSHRRRKSHVAEAEMGLFETPARDSSFGLFLPTPSTVGSGRKSGTARPHLKPPPVSIEAIAALNDNLHFEDDSDDSTPAQYSDVFSSPPKRSSFIFSSNLKAQPKTTYEPESPSKGHRKTVPMTPRKQMIDDELINEWHGKSRNDTYMANDDEVNELRAQSKELTNPFISAPVSSSRSAHESKSDVDYSTHAEYINSRTGEKKVVELSERQRQIRPKKLDFSSVVPMSSSGPICRSRCRLLRIRLDSHQTMSIPGFGGDENPVEDLSEANTTTFHLDGKSEWRFEVPFKTIMSLKVTEGVGEIFGTELPLNVPVQLTGVKYALYAPLSDGCTVEYSTRINRDQAPGSTDSTDISEYISEDTPMNQYVNLHMALESYRQETADYNYLNPSSPRMGPRVLILGNRSAGKTALARILSSYAYKMDHHPVLVNLNPRDGVFSLPGSLTATPISDTFDLESANGYGGTTTSGSAVHNPKQPVVKNFGFLSPSDNLELYKYQVSKLGVVVMSRLEEDADVRNSGVIIDTPALTIKDINVIENIVSDFEVNVVVVVDNERLLIDLRKKFKHKISNSQLAMVKIPKSGGVVELDDSFIRQCQEETIKEYFNGDRKTPLSPFKTEVDVKDFRYFKGVLSSDFNPSLSFLPSGDSYTTDDMDEDRKKDENSMDKFYTAIEDPDASKLENLIIAITQLPQNNKQPRDLLNTCVLGYIHVSRVDEARGKMKVLSPMVAAIPRNILLVTTIGYTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.74
4 0.75
5 0.8
6 0.76
7 0.74
8 0.73
9 0.7
10 0.67
11 0.59
12 0.55
13 0.47
14 0.42
15 0.36
16 0.28
17 0.22
18 0.18
19 0.23
20 0.25
21 0.26
22 0.35
23 0.43
24 0.5
25 0.57
26 0.59
27 0.57
28 0.59
29 0.67
30 0.68
31 0.69
32 0.69
33 0.67
34 0.68
35 0.68
36 0.68
37 0.64
38 0.6
39 0.53
40 0.54
41 0.57
42 0.58
43 0.62
44 0.66
45 0.67
46 0.71
47 0.74
48 0.73
49 0.72
50 0.66
51 0.65
52 0.61
53 0.56
54 0.48
55 0.43
56 0.42
57 0.36
58 0.39
59 0.35
60 0.32
61 0.28
62 0.29
63 0.33
64 0.27
65 0.25
66 0.25
67 0.26
68 0.26
69 0.31
70 0.37
71 0.42
72 0.5
73 0.58
74 0.64
75 0.72
76 0.81
77 0.87
78 0.9
79 0.91
80 0.9
81 0.92
82 0.91
83 0.9
84 0.86
85 0.81
86 0.74
87 0.65
88 0.58
89 0.47
90 0.37
91 0.26
92 0.19
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.14
101 0.17
102 0.16
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.13
110 0.15
111 0.14
112 0.18
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.26
117 0.27
118 0.3
119 0.38
120 0.44
121 0.49
122 0.49
123 0.58
124 0.6
125 0.66
126 0.64
127 0.59
128 0.57
129 0.53
130 0.5
131 0.41
132 0.35
133 0.3
134 0.26
135 0.22
136 0.14
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.17
161 0.24
162 0.27
163 0.32
164 0.32
165 0.3
166 0.31
167 0.37
168 0.4
169 0.4
170 0.43
171 0.39
172 0.43
173 0.47
174 0.51
175 0.46
176 0.42
177 0.37
178 0.36
179 0.39
180 0.38
181 0.37
182 0.37
183 0.37
184 0.42
185 0.44
186 0.44
187 0.41
188 0.44
189 0.49
190 0.46
191 0.49
192 0.49
193 0.51
194 0.5
195 0.58
196 0.61
197 0.6
198 0.63
199 0.63
200 0.64
201 0.59
202 0.56
203 0.49
204 0.43
205 0.41
206 0.36
207 0.33
208 0.27
209 0.25
210 0.24
211 0.23
212 0.18
213 0.15
214 0.18
215 0.16
216 0.2
217 0.25
218 0.29
219 0.31
220 0.32
221 0.32
222 0.36
223 0.37
224 0.33
225 0.28
226 0.24
227 0.23
228 0.23
229 0.2
230 0.12
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.19
238 0.21
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.23
244 0.2
245 0.15
246 0.15
247 0.14
248 0.17
249 0.16
250 0.17
251 0.16
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.2
257 0.21
258 0.25
259 0.25
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.17
270 0.22
271 0.19
272 0.18
273 0.19
274 0.21
275 0.25
276 0.24
277 0.23
278 0.2
279 0.22
280 0.23
281 0.27
282 0.32
283 0.35
284 0.39
285 0.39
286 0.41
287 0.47
288 0.54
289 0.58
290 0.61
291 0.58
292 0.62
293 0.62
294 0.63
295 0.57
296 0.52
297 0.49
298 0.41
299 0.35
300 0.27
301 0.26
302 0.21
303 0.2
304 0.17
305 0.1
306 0.13
307 0.18
308 0.2
309 0.24
310 0.28
311 0.32
312 0.37
313 0.43
314 0.49
315 0.51
316 0.6
317 0.62
318 0.62
319 0.59
320 0.6
321 0.54
322 0.47
323 0.41
324 0.31
325 0.25
326 0.21
327 0.17
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.21
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.21
368 0.18
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.11
375 0.08
376 0.07
377 0.06
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.1
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.17
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.22
420 0.2
421 0.21
422 0.19
423 0.17
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.09
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.12
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.16
460 0.16
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.12
465 0.15
466 0.16
467 0.17
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.2
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.17
478 0.16
479 0.13
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.1
494 0.11
495 0.13
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.17
501 0.18
502 0.2
503 0.24
504 0.2
505 0.19
506 0.19
507 0.18
508 0.19
509 0.17
510 0.15
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.09
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.12
544 0.17
545 0.21
546 0.26
547 0.26
548 0.29
549 0.34
550 0.38
551 0.36
552 0.39
553 0.36
554 0.33
555 0.33
556 0.33
557 0.28
558 0.24
559 0.25
560 0.19
561 0.19
562 0.17
563 0.16
564 0.14
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.16
569 0.15
570 0.15
571 0.19
572 0.19
573 0.19
574 0.18
575 0.2
576 0.16
577 0.15
578 0.16
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.1
583 0.07
584 0.06
585 0.08
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.07
604 0.12
605 0.12
606 0.13
607 0.12
608 0.13
609 0.12
610 0.13
611 0.13
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.05
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.06
624 0.06
625 0.05
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.07
630 0.12
631 0.18
632 0.25
633 0.32
634 0.39
635 0.44
636 0.51
637 0.58
638 0.64
639 0.65
640 0.7
641 0.73
642 0.76
643 0.72
644 0.71
645 0.65
646 0.56
647 0.51
648 0.43
649 0.35
650 0.26
651 0.25
652 0.19
653 0.17
654 0.16
655 0.15
656 0.14
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.13
662 0.13
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.1
667 0.09
668 0.14
669 0.19
670 0.21
671 0.26
672 0.28
673 0.29
674 0.29
675 0.31
676 0.31
677 0.33
678 0.34
679 0.3
680 0.32
681 0.32
682 0.37
683 0.39
684 0.43
685 0.4
686 0.4
687 0.42
688 0.4
689 0.45
690 0.43
691 0.42
692 0.41
693 0.4
694 0.4
695 0.45
696 0.43
697 0.37
698 0.39
699 0.36
700 0.29
701 0.35
702 0.32
703 0.26
704 0.31
705 0.32
706 0.32
707 0.33
708 0.32
709 0.23
710 0.23
711 0.22
712 0.18
713 0.17
714 0.12
715 0.14
716 0.14
717 0.16
718 0.15
719 0.16
720 0.17
721 0.19
722 0.19
723 0.16
724 0.16
725 0.15
726 0.22
727 0.25
728 0.24
729 0.25
730 0.27
731 0.28
732 0.33
733 0.39
734 0.41
735 0.42
736 0.48
737 0.47
738 0.44
739 0.43
740 0.38
741 0.35
742 0.26
743 0.21
744 0.15
745 0.15
746 0.16
747 0.19
748 0.2
749 0.17
750 0.16
751 0.15
752 0.14
753 0.14
754 0.12
755 0.1
756 0.09
757 0.09
758 0.09
759 0.1
760 0.13
761 0.15
762 0.2
763 0.25
764 0.35
765 0.43
766 0.45
767 0.49
768 0.51
769 0.53
770 0.58
771 0.55
772 0.5
773 0.48
774 0.47
775 0.42
776 0.39
777 0.33
778 0.24
779 0.25
780 0.23
781 0.19
782 0.2
783 0.21
784 0.2
785 0.22
786 0.26
787 0.28
788 0.28
789 0.31
790 0.31
791 0.31
792 0.33
793 0.36
794 0.38
795 0.36
796 0.35
797 0.29
798 0.3
799 0.31
800 0.32
801 0.28
802 0.22
803 0.22
804 0.2
805 0.2
806 0.18
807 0.15
808 0.12
809 0.12
810 0.12