Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JFI4

Protein Details
Accession A0A421JFI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-118DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-404QEKRREENDKRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIITPVYEDPPEEIGAPQYSDPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKPAPETEDEMFLDVFKYTDRVLMMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKIAHEEKQRQIKERELRGESIDEAIKGKRSWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWVAYKLTSDPGWANVQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYDPNTKHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFANQTRQLRVSDQISMTQEQKDSLAAQDARKPFLWLHINVLREYLETELFVPHLPFTFDVERAIDDWIFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDNGIDILLGCWKRVLPKLKGYITCDGNLNAESVEKLMNALTYKEAEIFRKRHEQEKRREENDKRRKVFQEEDRALRNQYLSQVSKGQDKAPLVADTQMPLMTTSGEVVDGYAKLSNRDIVHHRDVITKANMSNAEAAAELKKLLDGGTDTSTDPQDSETNEQAGASDTSEQTSRKRPLESEPPTPDENGDAVRMWEPGYHDRYYQTKFHLTTQEEIDETRRGLVRSYLEGISWVLLYYYQGCPSWQWYYPYHYAPFAADFVNVSDIIGEEGIKFDLGTPFRPYEQLMAVLPAASGHNLPAVFRDLMSNPDSPIIDFYPEEFEIDMNGKKMSWQGIALLPFIEEKRLLSVLETKYPELTDDERDRNTIKSEVLVMSSQNVNYDRFSEVYKTTDEKTITFGCGATNLAGIVFKNNHFQLEGLTQFPLSFGDMPDIDNAEYFLSSYHMPPKKRGKSMLLRGYISHQPVLTQDDKNTIIYGSRNNGGGNRFRSPNDNRDYVNSGPMGSEIYKVYSMRRGGYRAFIEMQSQAQNYQNPNGYQNGHQGYQGNQANQGYQGHNQGYGNQGYNRNQGYQGNQYNQNQGYQNQNYNQNYNQGNQGYSRYNQGGYNQGYQSQGYQNQGYQGARRGNRGGFGSQRSSYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.67
5 0.62
6 0.6
7 0.6
8 0.59
9 0.53
10 0.48
11 0.41
12 0.38
13 0.34
14 0.27
15 0.21
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.26
27 0.27
28 0.23
29 0.23
30 0.19
31 0.21
32 0.17
33 0.16
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.17
45 0.22
46 0.26
47 0.33
48 0.4
49 0.45
50 0.51
51 0.51
52 0.51
53 0.49
54 0.49
55 0.42
56 0.39
57 0.33
58 0.28
59 0.25
60 0.2
61 0.17
62 0.13
63 0.12
64 0.08
65 0.1
66 0.08
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.2
72 0.29
73 0.36
74 0.38
75 0.38
76 0.38
77 0.38
78 0.38
79 0.34
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.2
87 0.18
88 0.15
89 0.1
90 0.13
91 0.19
92 0.26
93 0.37
94 0.45
95 0.55
96 0.66
97 0.74
98 0.8
99 0.82
100 0.79
101 0.76
102 0.77
103 0.76
104 0.72
105 0.73
106 0.65
107 0.59
108 0.64
109 0.58
110 0.52
111 0.5
112 0.5
113 0.48
114 0.57
115 0.59
116 0.57
117 0.6
118 0.64
119 0.65
120 0.68
121 0.69
122 0.63
123 0.6
124 0.55
125 0.53
126 0.44
127 0.38
128 0.31
129 0.23
130 0.21
131 0.2
132 0.21
133 0.19
134 0.2
135 0.22
136 0.24
137 0.28
138 0.34
139 0.36
140 0.38
141 0.44
142 0.44
143 0.39
144 0.36
145 0.33
146 0.27
147 0.23
148 0.18
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.17
165 0.2
166 0.19
167 0.21
168 0.2
169 0.22
170 0.24
171 0.22
172 0.19
173 0.16
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.18
194 0.22
195 0.29
196 0.31
197 0.34
198 0.36
199 0.39
200 0.41
201 0.39
202 0.44
203 0.41
204 0.44
205 0.45
206 0.42
207 0.44
208 0.41
209 0.39
210 0.3
211 0.28
212 0.23
213 0.25
214 0.23
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.15
220 0.13
221 0.08
222 0.06
223 0.03
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.23
237 0.21
238 0.25
239 0.28
240 0.25
241 0.27
242 0.28
243 0.27
244 0.28
245 0.28
246 0.24
247 0.26
248 0.26
249 0.25
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.27
255 0.25
256 0.23
257 0.19
258 0.19
259 0.15
260 0.13
261 0.12
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.24
266 0.26
267 0.27
268 0.27
269 0.28
270 0.22
271 0.27
272 0.31
273 0.25
274 0.31
275 0.32
276 0.33
277 0.31
278 0.32
279 0.24
280 0.19
281 0.19
282 0.13
283 0.1
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.14
301 0.15
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.08
322 0.12
323 0.15
324 0.16
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.09
331 0.05
332 0.05
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.14
339 0.2
340 0.27
341 0.27
342 0.35
343 0.42
344 0.48
345 0.51
346 0.51
347 0.51
348 0.46
349 0.42
350 0.36
351 0.29
352 0.24
353 0.21
354 0.17
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.12
371 0.15
372 0.22
373 0.24
374 0.27
375 0.36
376 0.37
377 0.43
378 0.52
379 0.57
380 0.61
381 0.7
382 0.74
383 0.7
384 0.77
385 0.77
386 0.78
387 0.8
388 0.8
389 0.72
390 0.7
391 0.69
392 0.66
393 0.65
394 0.62
395 0.62
396 0.56
397 0.57
398 0.53
399 0.51
400 0.45
401 0.38
402 0.3
403 0.2
404 0.19
405 0.21
406 0.19
407 0.19
408 0.23
409 0.23
410 0.28
411 0.28
412 0.26
413 0.24
414 0.23
415 0.23
416 0.21
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.12
422 0.12
423 0.1
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.11
442 0.11
443 0.14
444 0.18
445 0.22
446 0.25
447 0.26
448 0.27
449 0.27
450 0.28
451 0.29
452 0.26
453 0.21
454 0.18
455 0.19
456 0.18
457 0.15
458 0.15
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.18
499 0.23
500 0.24
501 0.26
502 0.27
503 0.31
504 0.41
505 0.44
506 0.45
507 0.43
508 0.44
509 0.44
510 0.42
511 0.36
512 0.27
513 0.22
514 0.15
515 0.12
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.1
523 0.14
524 0.18
525 0.18
526 0.18
527 0.2
528 0.25
529 0.27
530 0.27
531 0.25
532 0.27
533 0.27
534 0.3
535 0.35
536 0.32
537 0.32
538 0.31
539 0.29
540 0.23
541 0.23
542 0.21
543 0.15
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.12
548 0.12
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.17
553 0.16
554 0.14
555 0.14
556 0.14
557 0.11
558 0.09
559 0.07
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.07
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.1
569 0.13
570 0.16
571 0.16
572 0.19
573 0.19
574 0.26
575 0.29
576 0.32
577 0.29
578 0.27
579 0.25
580 0.22
581 0.21
582 0.16
583 0.12
584 0.09
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.03
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.09
602 0.1
603 0.12
604 0.15
605 0.16
606 0.17
607 0.18
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.15
612 0.12
613 0.12
614 0.11
615 0.1
616 0.1
617 0.08
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.11
627 0.1
628 0.1
629 0.12
630 0.11
631 0.14
632 0.17
633 0.16
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.13
638 0.15
639 0.13
640 0.12
641 0.11
642 0.12
643 0.14
644 0.14
645 0.14
646 0.12
647 0.11
648 0.11
649 0.13
650 0.13
651 0.1
652 0.1
653 0.09
654 0.1
655 0.12
656 0.13
657 0.12
658 0.11
659 0.12
660 0.15
661 0.17
662 0.16
663 0.14
664 0.12
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.08
669 0.08
670 0.1
671 0.11
672 0.1
673 0.1
674 0.17
675 0.18
676 0.24
677 0.26
678 0.24
679 0.24
680 0.24
681 0.24
682 0.2
683 0.2
684 0.21
685 0.25
686 0.29
687 0.29
688 0.31
689 0.31
690 0.29
691 0.3
692 0.25
693 0.19
694 0.16
695 0.18
696 0.16
697 0.17
698 0.16
699 0.13
700 0.13
701 0.14
702 0.13
703 0.14
704 0.15
705 0.14
706 0.15
707 0.16
708 0.15
709 0.15
710 0.16
711 0.16
712 0.16
713 0.17
714 0.19
715 0.2
716 0.21
717 0.25
718 0.24
719 0.22
720 0.25
721 0.24
722 0.23
723 0.21
724 0.19
725 0.14
726 0.14
727 0.14
728 0.1
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.09
735 0.11
736 0.12
737 0.17
738 0.17
739 0.18
740 0.18
741 0.18
742 0.17
743 0.2
744 0.2
745 0.16
746 0.16
747 0.15
748 0.14
749 0.14
750 0.12
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.11
755 0.11
756 0.12
757 0.13
758 0.14
759 0.12
760 0.11
761 0.11
762 0.09
763 0.08
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.08
768 0.1
769 0.19
770 0.25
771 0.27
772 0.35
773 0.46
774 0.54
775 0.6
776 0.64
777 0.64
778 0.69
779 0.77
780 0.78
781 0.72
782 0.64
783 0.58
784 0.57
785 0.53
786 0.45
787 0.36
788 0.27
789 0.22
790 0.23
791 0.28
792 0.27
793 0.24
794 0.23
795 0.26
796 0.27
797 0.27
798 0.26
799 0.2
800 0.18
801 0.18
802 0.22
803 0.2
804 0.21
805 0.22
806 0.22
807 0.25
808 0.27
809 0.32
810 0.33
811 0.34
812 0.35
813 0.35
814 0.43
815 0.46
816 0.51
817 0.5
818 0.49
819 0.45
820 0.48
821 0.52
822 0.45
823 0.42
824 0.33
825 0.27
826 0.23
827 0.22
828 0.19
829 0.15
830 0.15
831 0.12
832 0.13
833 0.16
834 0.16
835 0.18
836 0.23
837 0.24
838 0.27
839 0.31
840 0.32
841 0.32
842 0.38
843 0.38
844 0.35
845 0.36
846 0.32
847 0.3
848 0.28
849 0.29
850 0.26
851 0.24
852 0.23
853 0.24
854 0.28
855 0.29
856 0.33
857 0.35
858 0.33
859 0.35
860 0.36
861 0.35
862 0.33
863 0.39
864 0.37
865 0.32
866 0.33
867 0.32
868 0.3
869 0.37
870 0.38
871 0.31
872 0.31
873 0.31
874 0.3
875 0.3
876 0.31
877 0.25
878 0.23
879 0.29
880 0.25
881 0.28
882 0.27
883 0.27
884 0.28
885 0.29
886 0.3
887 0.29
888 0.34
889 0.36
890 0.43
891 0.43
892 0.4
893 0.4
894 0.4
895 0.4
896 0.43
897 0.47
898 0.46
899 0.51
900 0.52
901 0.57
902 0.54
903 0.54
904 0.47
905 0.42
906 0.46
907 0.44
908 0.48
909 0.46
910 0.54
911 0.53
912 0.55
913 0.54
914 0.52
915 0.48
916 0.43
917 0.45
918 0.38
919 0.35
920 0.33
921 0.35
922 0.33
923 0.31
924 0.36
925 0.31
926 0.31
927 0.32
928 0.33
929 0.37
930 0.36
931 0.42
932 0.36
933 0.36
934 0.36
935 0.34
936 0.35
937 0.33
938 0.33
939 0.31
940 0.33
941 0.31
942 0.33
943 0.38
944 0.36
945 0.33
946 0.36
947 0.4
948 0.41
949 0.45
950 0.46
951 0.44
952 0.47
953 0.47
954 0.45
955 0.43
956 0.46
957 0.47
958 0.45