Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JDS6

Protein Details
Accession A0A421JDS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-142DSGHAKKHEHTRRKHKSTTNTQLYKBasic
167-191NDELKQVSRPPKWRSKPCVNWAKYGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTAFQPADKNGLLLDLWTSQSSANARPCTQSPLWGSNPSQQSRYFSAPMARDPTFDYAVSLLPNDLLQNDVVLPKLTEENLKLSSYHHSGRSSFSEPDDDVFSLQKSVPEAHSAQSSDSGHAKKHEHTRRKHKSTTNTQLYKTELCASYMKMGVCPYGGKCQFAHGNDELKQVSRPPKWRSKPCVNWAKYGACRYGNRCCFKHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.12
4 0.12
5 0.12
6 0.11
7 0.15
8 0.17
9 0.22
10 0.27
11 0.3
12 0.31
13 0.34
14 0.35
15 0.39
16 0.37
17 0.38
18 0.35
19 0.38
20 0.4
21 0.42
22 0.42
23 0.42
24 0.49
25 0.45
26 0.43
27 0.38
28 0.39
29 0.39
30 0.42
31 0.36
32 0.3
33 0.34
34 0.33
35 0.34
36 0.35
37 0.31
38 0.27
39 0.28
40 0.29
41 0.25
42 0.23
43 0.2
44 0.15
45 0.16
46 0.15
47 0.12
48 0.09
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.17
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.27
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.14
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.2
109 0.22
110 0.23
111 0.33
112 0.41
113 0.46
114 0.55
115 0.65
116 0.73
117 0.78
118 0.81
119 0.79
120 0.79
121 0.81
122 0.82
123 0.81
124 0.75
125 0.69
126 0.63
127 0.59
128 0.5
129 0.41
130 0.35
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.21
138 0.17
139 0.17
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.21
145 0.22
146 0.23
147 0.22
148 0.27
149 0.32
150 0.32
151 0.35
152 0.29
153 0.33
154 0.33
155 0.37
156 0.32
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.34
161 0.37
162 0.44
163 0.48
164 0.58
165 0.68
166 0.77
167 0.8
168 0.82
169 0.85
170 0.87
171 0.89
172 0.81
173 0.78
174 0.73
175 0.72
176 0.67
177 0.62
178 0.58
179 0.54
180 0.57
181 0.55
182 0.6
183 0.61
184 0.63