Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JCA6

Protein Details
Accession A0A421JCA6    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-323YNDTKSNKKISKTKQRKKKGAMTDTTSHydrophilic
405-432ADSVSKGKAANRRKQKPSVDKLGRAFDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-315KKISKTKQRKKK
410-420KGKAANRRKQK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRRFDKKGAVTYSVVHRAHDDSLYYDNDASRHVLVPSSEAKNQQKKSYSVAELEEKLGKESTAKIRANEGLAAQYGVFFDDSKYDYMQHLKPMGEAPDAVFVGPEEVAKKPSGNIEDLFRDQLPSGESRRVDNVLENIPKELQGFNPDLDPRLREVMEALEDEAYIEPEASDKDEKDVFAELLASGEVEDEDDFYYGSAAEDDEWDMDNYEDIYAKYDAPEGQEMPYNEGEAPEEALAPGEVPVTNSSWQKDFHQFKMDTKNHANEWDSDDDFDDDDDHYDEEDRDVLPDLPSYNDTKSNKKISKTKQRKKKGAMTDTTSFSMTSSALFRTEGLTLLDDRFEQLSKKYEQDEEPEYENFKMENERSDFDSMLDDFLDNYDLEKGGRRLVKKDAELKRLQEAADSVSKGKAANRRKQKPSVDKLGRAFDSMKLSNQQP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.58
4 0.49
5 0.39
6 0.36
7 0.34
8 0.35
9 0.33
10 0.26
11 0.19
12 0.23
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.2
26 0.25
27 0.27
28 0.29
29 0.36
30 0.45
31 0.52
32 0.56
33 0.6
34 0.6
35 0.58
36 0.6
37 0.6
38 0.54
39 0.48
40 0.48
41 0.46
42 0.41
43 0.41
44 0.39
45 0.31
46 0.29
47 0.26
48 0.22
49 0.18
50 0.23
51 0.28
52 0.34
53 0.36
54 0.35
55 0.4
56 0.42
57 0.42
58 0.37
59 0.29
60 0.22
61 0.2
62 0.19
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.22
77 0.24
78 0.26
79 0.28
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.28
84 0.23
85 0.21
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.07
96 0.08
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.22
106 0.26
107 0.27
108 0.28
109 0.23
110 0.21
111 0.18
112 0.18
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.24
120 0.24
121 0.23
122 0.22
123 0.23
124 0.24
125 0.26
126 0.25
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.08
222 0.09
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.15
240 0.18
241 0.27
242 0.29
243 0.29
244 0.36
245 0.36
246 0.39
247 0.49
248 0.48
249 0.45
250 0.45
251 0.46
252 0.39
253 0.41
254 0.37
255 0.28
256 0.3
257 0.28
258 0.24
259 0.2
260 0.2
261 0.18
262 0.16
263 0.14
264 0.11
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.2
286 0.23
287 0.29
288 0.35
289 0.44
290 0.47
291 0.51
292 0.59
293 0.62
294 0.71
295 0.76
296 0.8
297 0.8
298 0.87
299 0.9
300 0.89
301 0.88
302 0.87
303 0.85
304 0.82
305 0.78
306 0.72
307 0.65
308 0.57
309 0.48
310 0.37
311 0.28
312 0.22
313 0.15
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.24
337 0.26
338 0.3
339 0.31
340 0.35
341 0.38
342 0.35
343 0.36
344 0.34
345 0.33
346 0.29
347 0.27
348 0.22
349 0.18
350 0.21
351 0.19
352 0.24
353 0.26
354 0.28
355 0.3
356 0.32
357 0.31
358 0.26
359 0.28
360 0.21
361 0.18
362 0.16
363 0.12
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.15
373 0.16
374 0.21
375 0.27
376 0.29
377 0.31
378 0.4
379 0.47
380 0.49
381 0.58
382 0.6
383 0.63
384 0.66
385 0.65
386 0.63
387 0.58
388 0.51
389 0.43
390 0.36
391 0.32
392 0.32
393 0.3
394 0.25
395 0.23
396 0.24
397 0.23
398 0.28
399 0.32
400 0.37
401 0.45
402 0.55
403 0.64
404 0.72
405 0.81
406 0.86
407 0.87
408 0.87
409 0.88
410 0.86
411 0.84
412 0.81
413 0.8
414 0.71
415 0.63
416 0.55
417 0.48
418 0.47
419 0.41
420 0.39