Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JCS5

Protein Details
Accession A0A421JCS5    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-172GKTESFSLKPPKKPKKPKAKNQKADQKTKSKBasic
174-234PEKAKDTNDRAKKPKKKSKKPKNAKDKDGQAPQDPSDAKPVEKKKKKKKKKSMAVQNDAPGBasic
263-295AKGENDTKAPKKNQKRKPKKKKANAPGNSTSSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-125KERKKKK
150-224KPPKKPKKPKAKNQKADQKTKSKDPEKAKDTNDRAKKPKKKSKKPKNAKDKDGQAPQDPSDAKPVEKKKKKKKKK
270-285KAPKKNQKRKPKKKKA
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto_nucl 6.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MNTSSGKHKQAVRLVVRLLPPGLTQEQFEAQITQYTTQWHLVNNYYYVTGAYPEKPYELPTYSRAYFVVPDAETATKIQAELRAKAFSDGESNGASVPIIGKALYENKEYAAVPRAILKERKKKKTIEQLAQFQQFVAFLDGKTESFSLKPPKKPKKPKAKNQKADQKTKSKDPEKAKDTNDRAKKPKKKSKKPKNAKDKDGQAPQDPSDAKPVEKKKKKKKKKSMAVQNDAPGTTKQEKTAPQPNEDVGSVDKTNQLNQNAAKGENDTKAPKKNQKRKPKKKKANAPGNSTSSPQTPSAPQPQTTNAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.54
3 0.51
4 0.46
5 0.39
6 0.3
7 0.25
8 0.25
9 0.26
10 0.21
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.19
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.23
25 0.24
26 0.22
27 0.24
28 0.26
29 0.28
30 0.26
31 0.25
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.15
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.17
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.22
44 0.24
45 0.24
46 0.25
47 0.26
48 0.31
49 0.3
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.21
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.15
67 0.18
68 0.2
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.07
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.14
101 0.18
102 0.2
103 0.22
104 0.29
105 0.36
106 0.42
107 0.51
108 0.6
109 0.62
110 0.65
111 0.7
112 0.74
113 0.75
114 0.74
115 0.71
116 0.7
117 0.71
118 0.67
119 0.58
120 0.46
121 0.36
122 0.27
123 0.21
124 0.15
125 0.09
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.08
134 0.12
135 0.2
136 0.26
137 0.33
138 0.43
139 0.53
140 0.63
141 0.74
142 0.8
143 0.82
144 0.87
145 0.9
146 0.91
147 0.92
148 0.9
149 0.89
150 0.89
151 0.86
152 0.85
153 0.82
154 0.8
155 0.72
156 0.71
157 0.71
158 0.65
159 0.66
160 0.64
161 0.67
162 0.62
163 0.65
164 0.61
165 0.62
166 0.62
167 0.63
168 0.63
169 0.61
170 0.65
171 0.68
172 0.74
173 0.75
174 0.8
175 0.82
176 0.85
177 0.9
178 0.92
179 0.93
180 0.95
181 0.95
182 0.95
183 0.94
184 0.9
185 0.87
186 0.84
187 0.81
188 0.77
189 0.69
190 0.62
191 0.56
192 0.48
193 0.45
194 0.37
195 0.3
196 0.3
197 0.28
198 0.25
199 0.3
200 0.39
201 0.45
202 0.54
203 0.63
204 0.67
205 0.78
206 0.88
207 0.91
208 0.93
209 0.93
210 0.95
211 0.95
212 0.96
213 0.95
214 0.92
215 0.85
216 0.78
217 0.68
218 0.58
219 0.48
220 0.37
221 0.33
222 0.3
223 0.26
224 0.24
225 0.28
226 0.31
227 0.36
228 0.45
229 0.43
230 0.41
231 0.42
232 0.41
233 0.39
234 0.35
235 0.3
236 0.22
237 0.23
238 0.19
239 0.17
240 0.22
241 0.2
242 0.24
243 0.29
244 0.29
245 0.3
246 0.3
247 0.35
248 0.32
249 0.32
250 0.28
251 0.26
252 0.29
253 0.26
254 0.29
255 0.3
256 0.34
257 0.42
258 0.51
259 0.57
260 0.65
261 0.73
262 0.79
263 0.84
264 0.89
265 0.92
266 0.94
267 0.96
268 0.96
269 0.96
270 0.97
271 0.97
272 0.96
273 0.94
274 0.91
275 0.88
276 0.83
277 0.74
278 0.65
279 0.57
280 0.49
281 0.43
282 0.36
283 0.31
284 0.28
285 0.33
286 0.41
287 0.43
288 0.43
289 0.44
290 0.47