Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JDU0

Protein Details
Accession A0A421JDU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-61EYASSTKKIPDPPRKKRQQPAAPPPLPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-50PRKKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040770  Rtt106_PH  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18469  PH_18  
PF08512  Rtt106  
CDD cd13304  PH2-like_Rtt106  
Amino Acid Sequences MQWLNTLPPPLQHEVAALVSAVPQAAPTLDKLFEYASSTKKIPDPPRKKRQQPAAPPPLPPPLTPSDIIFHLANISCQSPFRKRLGFVFHLALGPQGPAPALSLVNHQLQPEFTLKNLRQDIVFCSLLPILGNSTVASKKDTVLLLVWLAHGDPIVCQLNFDAVKKQLVAEGKVPASAESELDSDSDNEADGIRPINEALVDFLVRQFHLCGIRLLNYLPFSTGSKNKLTLNKDSAVAISTSGTSANDVVMVQAYRGSKDGALVLLGGTQDQPGTIIFGFRKPILLFHTDSVKRISYSNITRLTFNVSVTVHNDARPDGEETLEFSMVDQAYFQVLDDFVKRQGINDDSFNEALREKQKADPNVKAEDAEDGEDEAPDSDDEDEDGTYQAGVESDSDRKENSDSEGDSGEEGESEGQSEDESEGDSEGEGQSEDTSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.21
4 0.15
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.09
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.2
22 0.21
23 0.22
24 0.26
25 0.27
26 0.29
27 0.34
28 0.42
29 0.47
30 0.55
31 0.62
32 0.69
33 0.79
34 0.86
35 0.91
36 0.91
37 0.92
38 0.91
39 0.91
40 0.91
41 0.91
42 0.84
43 0.77
44 0.71
45 0.69
46 0.6
47 0.48
48 0.43
49 0.37
50 0.37
51 0.35
52 0.33
53 0.27
54 0.26
55 0.29
56 0.23
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.16
65 0.21
66 0.26
67 0.31
68 0.36
69 0.39
70 0.4
71 0.46
72 0.52
73 0.5
74 0.46
75 0.43
76 0.39
77 0.34
78 0.32
79 0.26
80 0.18
81 0.14
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.14
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.23
102 0.24
103 0.31
104 0.33
105 0.31
106 0.28
107 0.29
108 0.32
109 0.28
110 0.27
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.12
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.07
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.14
147 0.15
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.12
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.2
214 0.23
215 0.29
216 0.31
217 0.33
218 0.34
219 0.32
220 0.31
221 0.29
222 0.26
223 0.2
224 0.16
225 0.11
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.04
261 0.06
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.2
273 0.19
274 0.19
275 0.28
276 0.26
277 0.27
278 0.28
279 0.26
280 0.23
281 0.22
282 0.23
283 0.22
284 0.25
285 0.31
286 0.34
287 0.34
288 0.34
289 0.34
290 0.38
291 0.32
292 0.27
293 0.24
294 0.18
295 0.19
296 0.2
297 0.25
298 0.19
299 0.19
300 0.2
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.14
309 0.16
310 0.15
311 0.13
312 0.1
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.21
331 0.23
332 0.24
333 0.25
334 0.26
335 0.25
336 0.26
337 0.25
338 0.21
339 0.18
340 0.2
341 0.22
342 0.23
343 0.22
344 0.29
345 0.36
346 0.43
347 0.5
348 0.52
349 0.52
350 0.54
351 0.52
352 0.45
353 0.38
354 0.33
355 0.28
356 0.22
357 0.18
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.09
381 0.13
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.19
386 0.21
387 0.22
388 0.24
389 0.26
390 0.25
391 0.26
392 0.27
393 0.25
394 0.23
395 0.22
396 0.17
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08