Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421J6X5

Protein Details
Accession A0A421J6X5    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-483ELTGNTSGSKRKRKPKVSGIEDLNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-474KRKRKPK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR023486  TFIIB_CS  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS00782  TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MRATKPCRNCGHTSFSIDRYTSSGDVSCSRCGTVQEENPIVSEVQFGESSSGAAVVQGTMVGADQTRATFGGRQNAMESREQTLQNGRKKIKRIATAMRIPDYISDAAAEWFRLALTLNFVQGRRSQNVLAACLYVACRKEKTPHMLIDFSSRLQISVYSLGATFLKMVRALHITNLPLADPSLFIQHFAERLDFGDLLTKVIKDAVKLAQRMANDWIHEGRRPAGVAGACVLLAARMNNFRRSHAEIVAVAHVAEETLQRRLNEFKKTSSGALSVADFRSSEQTDPANPPSFNKNREQELRIAQELQQAQTTDTLLGGGGTGSAKEAHKQKLLKTILKDCDLSEQEISNQLQRIVQAQQKNLQSSMYTTPSDRQGDTSIDRVDLDKPRNLSKNLPRTEDILQTVSSHPTDFSDLDDEELSMFKLTEEEHRLKERVWTGLNHDFLLAQERKRLKEEADELTGNTSGSKRKRKPKVSGIEDLNEMGMDEALANIGVDDSTGEPLTAADSAKRMLSKKSFSKKINYATLGDLFGETARAGST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.55
4 0.48
5 0.43
6 0.37
7 0.36
8 0.29
9 0.26
10 0.23
11 0.21
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.26
16 0.26
17 0.26
18 0.27
19 0.28
20 0.31
21 0.34
22 0.37
23 0.38
24 0.38
25 0.37
26 0.36
27 0.32
28 0.23
29 0.19
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.14
57 0.17
58 0.26
59 0.27
60 0.27
61 0.3
62 0.33
63 0.35
64 0.35
65 0.33
66 0.28
67 0.33
68 0.32
69 0.32
70 0.37
71 0.42
72 0.45
73 0.52
74 0.56
75 0.57
76 0.63
77 0.69
78 0.68
79 0.68
80 0.68
81 0.69
82 0.71
83 0.72
84 0.7
85 0.64
86 0.56
87 0.48
88 0.41
89 0.35
90 0.26
91 0.18
92 0.14
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.11
104 0.11
105 0.14
106 0.17
107 0.17
108 0.19
109 0.24
110 0.28
111 0.26
112 0.28
113 0.26
114 0.28
115 0.3
116 0.3
117 0.25
118 0.2
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.26
128 0.32
129 0.39
130 0.41
131 0.45
132 0.47
133 0.46
134 0.45
135 0.45
136 0.39
137 0.31
138 0.28
139 0.22
140 0.18
141 0.16
142 0.16
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.14
190 0.14
191 0.09
192 0.12
193 0.17
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.22
199 0.24
200 0.25
201 0.21
202 0.17
203 0.18
204 0.2
205 0.18
206 0.2
207 0.19
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.11
225 0.13
226 0.2
227 0.21
228 0.23
229 0.27
230 0.32
231 0.34
232 0.29
233 0.28
234 0.22
235 0.23
236 0.22
237 0.17
238 0.11
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.19
250 0.23
251 0.29
252 0.29
253 0.29
254 0.31
255 0.32
256 0.32
257 0.27
258 0.23
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.16
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.2
278 0.27
279 0.31
280 0.32
281 0.36
282 0.36
283 0.38
284 0.43
285 0.44
286 0.4
287 0.41
288 0.41
289 0.35
290 0.32
291 0.27
292 0.28
293 0.26
294 0.22
295 0.19
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.1
314 0.16
315 0.19
316 0.24
317 0.27
318 0.29
319 0.37
320 0.42
321 0.43
322 0.42
323 0.47
324 0.46
325 0.46
326 0.44
327 0.35
328 0.37
329 0.33
330 0.3
331 0.23
332 0.19
333 0.18
334 0.22
335 0.22
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.17
342 0.17
343 0.21
344 0.23
345 0.24
346 0.3
347 0.33
348 0.34
349 0.32
350 0.28
351 0.23
352 0.23
353 0.24
354 0.21
355 0.19
356 0.18
357 0.2
358 0.26
359 0.28
360 0.25
361 0.23
362 0.22
363 0.24
364 0.25
365 0.27
366 0.21
367 0.19
368 0.2
369 0.19
370 0.21
371 0.24
372 0.26
373 0.26
374 0.28
375 0.34
376 0.39
377 0.4
378 0.44
379 0.48
380 0.54
381 0.55
382 0.57
383 0.52
384 0.5
385 0.51
386 0.46
387 0.39
388 0.31
389 0.27
390 0.24
391 0.24
392 0.23
393 0.2
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.16
398 0.14
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.14
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.14
414 0.2
415 0.24
416 0.28
417 0.33
418 0.34
419 0.34
420 0.4
421 0.37
422 0.35
423 0.34
424 0.32
425 0.35
426 0.41
427 0.42
428 0.35
429 0.32
430 0.26
431 0.24
432 0.3
433 0.26
434 0.2
435 0.26
436 0.31
437 0.33
438 0.37
439 0.39
440 0.33
441 0.39
442 0.43
443 0.41
444 0.42
445 0.4
446 0.37
447 0.36
448 0.34
449 0.25
450 0.21
451 0.18
452 0.2
453 0.28
454 0.39
455 0.46
456 0.56
457 0.67
458 0.75
459 0.83
460 0.86
461 0.88
462 0.85
463 0.86
464 0.81
465 0.73
466 0.65
467 0.55
468 0.44
469 0.33
470 0.25
471 0.16
472 0.1
473 0.06
474 0.05
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.03
482 0.03
483 0.05
484 0.05
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.11
495 0.12
496 0.15
497 0.2
498 0.2
499 0.27
500 0.34
501 0.42
502 0.51
503 0.6
504 0.67
505 0.68
506 0.76
507 0.77
508 0.78
509 0.78
510 0.72
511 0.64
512 0.59
513 0.56
514 0.47
515 0.39
516 0.3
517 0.21
518 0.17
519 0.15
520 0.11