Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JDM4

Protein Details
Accession A0A421JDM4    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSALTKKQQKAQRFRKGEKKDKNADAVRQHydrophilic
62-92KRPAAKSDEPQPKKRKTRRGKKGKGVNGGKGBasic
176-206EARVTKLKEKNEKARTERKELIQKKSKKEVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-20KAQRFRKGEKK
61-93KKRPAAKSDEPQPKKRKTRRGKKGKGVNGGKGP
181-206KLKEKNEKARTERKELIQKKSKKEVP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSALTKKQQKAQRFRKGEKKDKNADAVRQKESSEFSDDENDTTKPESAPSTASTNDEQSSKKRPAAKSDEPQPKKRKTRRGKKGKGVNGGKGPRFILFVGNLPYDVTQEQLSAHFKSCKPDRIRIRQDKGIAFMEFDNDTKEIQHKMGVALALHHSTMNNRKINVELTVGGGGNSEARVTKLKEKNEKARTERKELIQKKSKKEVPAGVHPSRAALMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.87
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.89
7 0.87
8 0.84
9 0.85
10 0.8
11 0.78
12 0.78
13 0.73
14 0.68
15 0.6
16 0.54
17 0.47
18 0.44
19 0.38
20 0.34
21 0.28
22 0.25
23 0.3
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.24
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.13
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.28
47 0.3
48 0.33
49 0.38
50 0.4
51 0.47
52 0.54
53 0.59
54 0.59
55 0.65
56 0.71
57 0.7
58 0.76
59 0.76
60 0.77
61 0.79
62 0.8
63 0.81
64 0.81
65 0.87
66 0.88
67 0.91
68 0.91
69 0.9
70 0.91
71 0.88
72 0.87
73 0.8
74 0.74
75 0.71
76 0.66
77 0.57
78 0.49
79 0.41
80 0.31
81 0.28
82 0.23
83 0.16
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.15
102 0.16
103 0.22
104 0.26
105 0.32
106 0.34
107 0.42
108 0.5
109 0.57
110 0.67
111 0.7
112 0.72
113 0.69
114 0.69
115 0.61
116 0.56
117 0.48
118 0.37
119 0.28
120 0.22
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.13
144 0.21
145 0.27
146 0.29
147 0.29
148 0.29
149 0.31
150 0.33
151 0.3
152 0.24
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.12
166 0.15
167 0.25
168 0.31
169 0.4
170 0.5
171 0.59
172 0.68
173 0.73
174 0.79
175 0.77
176 0.81
177 0.79
178 0.77
179 0.75
180 0.73
181 0.75
182 0.73
183 0.76
184 0.75
185 0.77
186 0.77
187 0.81
188 0.78
189 0.74
190 0.74
191 0.73
192 0.7
193 0.72
194 0.72
195 0.65
196 0.63
197 0.56
198 0.5