Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421JB69

Protein Details
Accession A0A421JB69    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-152TLASPRPGSQKQRNRKKRQGQNQTSASAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-142KQRNRKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSVSYANIAATGSNPESQTSTPVSEVASLEVNDSEVQTSPNPSETTTVPSEQPTQEKPKKTLAPAPVPTKSVWGSTVSPHSVAVDESKWPTPDKVKSEQENASKPQQKFIKPVTNKWVPINAKVTLASPRPGSQKQRNRKKRQGQNQTSASAHTVVPPMAQSPPVTETSSPSTQSPPSQTSPKVSEDEKSNGHPKNFRRFNGNGSPQFKPRFGSPQQPPQFFPQGQNGFYHPQPYQNFQGYPRGQYRGGRNGAPIMNGFVPPPFPNGMMGYPQTQIPPPISPKQDPSEALTQQIDYYFSLENLIKDIFLRKHMHEQDGWVPLSLILNFKRVKIILNGIQNSSESANLDQDAVVLASLDHCKNLDIDYLKGKTKETATVADINLRVKDNYKQWLLPEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.2
4 0.21
5 0.24
6 0.22
7 0.22
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.17
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.15
26 0.15
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.21
31 0.2
32 0.25
33 0.26
34 0.27
35 0.24
36 0.26
37 0.31
38 0.31
39 0.35
40 0.36
41 0.43
42 0.49
43 0.54
44 0.55
45 0.59
46 0.62
47 0.62
48 0.64
49 0.62
50 0.64
51 0.65
52 0.68
53 0.61
54 0.56
55 0.51
56 0.48
57 0.4
58 0.32
59 0.26
60 0.22
61 0.21
62 0.23
63 0.28
64 0.25
65 0.25
66 0.23
67 0.22
68 0.19
69 0.18
70 0.17
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.24
78 0.28
79 0.34
80 0.37
81 0.43
82 0.49
83 0.52
84 0.57
85 0.6
86 0.6
87 0.59
88 0.57
89 0.58
90 0.58
91 0.53
92 0.55
93 0.55
94 0.52
95 0.52
96 0.56
97 0.57
98 0.53
99 0.59
100 0.6
101 0.6
102 0.59
103 0.55
104 0.55
105 0.46
106 0.48
107 0.45
108 0.37
109 0.32
110 0.3
111 0.29
112 0.25
113 0.25
114 0.22
115 0.2
116 0.22
117 0.27
118 0.32
119 0.4
120 0.45
121 0.53
122 0.62
123 0.72
124 0.8
125 0.84
126 0.89
127 0.91
128 0.91
129 0.91
130 0.92
131 0.9
132 0.88
133 0.82
134 0.75
135 0.64
136 0.55
137 0.45
138 0.35
139 0.26
140 0.18
141 0.15
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.15
155 0.2
156 0.21
157 0.21
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.22
162 0.23
163 0.22
164 0.23
165 0.26
166 0.27
167 0.28
168 0.3
169 0.31
170 0.29
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.28
175 0.26
176 0.25
177 0.3
178 0.3
179 0.32
180 0.35
181 0.37
182 0.44
183 0.49
184 0.46
185 0.46
186 0.44
187 0.49
188 0.52
189 0.54
190 0.5
191 0.48
192 0.49
193 0.47
194 0.48
195 0.42
196 0.34
197 0.28
198 0.3
199 0.28
200 0.36
201 0.36
202 0.44
203 0.5
204 0.5
205 0.5
206 0.47
207 0.51
208 0.42
209 0.39
210 0.38
211 0.34
212 0.33
213 0.32
214 0.3
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.18
219 0.22
220 0.23
221 0.26
222 0.28
223 0.28
224 0.29
225 0.28
226 0.37
227 0.31
228 0.34
229 0.34
230 0.33
231 0.31
232 0.34
233 0.38
234 0.38
235 0.39
236 0.35
237 0.33
238 0.34
239 0.33
240 0.29
241 0.24
242 0.17
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.17
265 0.2
266 0.26
267 0.31
268 0.32
269 0.36
270 0.39
271 0.41
272 0.38
273 0.37
274 0.38
275 0.34
276 0.34
277 0.3
278 0.26
279 0.22
280 0.22
281 0.18
282 0.11
283 0.13
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.11
293 0.17
294 0.16
295 0.22
296 0.26
297 0.27
298 0.37
299 0.41
300 0.44
301 0.39
302 0.42
303 0.42
304 0.43
305 0.41
306 0.31
307 0.27
308 0.23
309 0.24
310 0.2
311 0.19
312 0.14
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.25
317 0.24
318 0.26
319 0.25
320 0.31
321 0.31
322 0.39
323 0.41
324 0.38
325 0.38
326 0.36
327 0.33
328 0.27
329 0.21
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.09
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.19
351 0.18
352 0.21
353 0.28
354 0.31
355 0.35
356 0.36
357 0.36
358 0.34
359 0.35
360 0.38
361 0.34
362 0.35
363 0.34
364 0.39
365 0.38
366 0.39
367 0.38
368 0.34
369 0.33
370 0.31
371 0.29
372 0.26
373 0.33
374 0.34
375 0.4
376 0.42
377 0.42