Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A421J611

Protein Details
Accession A0A421J611    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-48GTPADSGNPDRKRRRVTRACDVCRRKKVKCDGKQPCIHCTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PF01138  RNase_PH  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
cd00067  GAL4  
cd11371  RNase_PH_MTR3  
Amino Acid Sequences MSQASPHEGTPADSGNPDRKRRRVTRACDVCRRKKVKCDGKQPCIHCTVYSYRCSYDDPNIRNTKNPGLPTQSDSSAEFINLHRSKGGEFGGGLSVMSGNVPPGRYIVNGDGPAAHKSAEGDAQKALQVLFPRLNLQRGVDVYKLNKIVQYLKSKDPSHVNINEISDLYLDGPTPSMSPVAVYDPPSVSSNDGNPVGREIRIVLPPKDVALQLIYTTWNKACVLFRFYHRPSLLEEVEFLYSMDPTNYTDRQQKFLPFLYSILACGSLFSRSNSLSKDNDSLEDDGFNYFLEARKLIDITNVGDISSIQTIVMMIMYLQCSARLSTCYLYIGIAMRSALKEGLHRNLSIFQSSKRRLDPIEIDTRKRLFFTIYKMDIYINSLLGLPRSVNEDEFDQEFPEELDDENVTREGLNYEEQNGRLSSSGCANHHTKLMMVMSHVVKELYPIKVKNTSNKPDGLGVHERVTKLEVELKAWLDNLPPELQPTDPNDLNSGKDIPEKFVLANCYLHLAFLNCSIMLYRPFIHYISSEQSAASDPKSLIRGRNCIKVARMVVKLANKMIDKDLLVGTYWFSMYTIFFSIACLIYYYHFANYNNQAKSGANYAGVLFDDDLDVDKIKRDIEIGKRVLDCLKNNSNASMRIYKILNNLFEQLNRHTAASKVPEDQLLKGAPGGLYLGNSASEPTPQTVLRDNASSLRQESSPLSDFQQAAAELHPPGMSFGSSQERKQVANEVANRADMKSINSILQDGLGENAAKVSFDPVGRFVPPPDSSTSDTDITPQEPGNGTGYKPGVFDQLDAQIFGRILPPYMLEQNARSTQQQTSGLGDFSSTALPEDFSFFGDGAPLDYLDPFNPPTDDSKSSYDRRRLLGPSEARFPSVGVSSSLEREMESADDEAAQNSMFLKTGLVETATGSAYVEADDCIVQVSVYGPRPIRGSFIEKASFSVECKFLPYVTKAAGDHQNTNPNAKPGMNSIEQRISTYVETALLPCLLLEKYPKSTIDIYVTVISNKSASLLELTNWIVNCSSLALVDSAIEIKDIVTGGVATLEEENDTKKSQCLASFMNLRNNEIVGFWIDGGQELNEKVLNKTLDTCQERAHVVRRNFNGFLTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.32
3 0.4
4 0.48
5 0.54
6 0.6
7 0.69
8 0.76
9 0.83
10 0.83
11 0.84
12 0.85
13 0.87
14 0.88
15 0.88
16 0.9
17 0.89
18 0.89
19 0.89
20 0.84
21 0.84
22 0.86
23 0.86
24 0.85
25 0.86
26 0.86
27 0.88
28 0.9
29 0.83
30 0.79
31 0.73
32 0.65
33 0.54
34 0.49
35 0.48
36 0.45
37 0.47
38 0.44
39 0.4
40 0.41
41 0.44
42 0.43
43 0.44
44 0.47
45 0.45
46 0.51
47 0.58
48 0.57
49 0.6
50 0.61
51 0.6
52 0.57
53 0.57
54 0.53
55 0.52
56 0.53
57 0.52
58 0.51
59 0.45
60 0.4
61 0.37
62 0.33
63 0.26
64 0.24
65 0.2
66 0.17
67 0.25
68 0.25
69 0.25
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.26
74 0.27
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.17
94 0.19
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.25
99 0.25
100 0.26
101 0.23
102 0.19
103 0.14
104 0.14
105 0.16
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.14
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.25
120 0.27
121 0.3
122 0.29
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.31
127 0.28
128 0.29
129 0.28
130 0.33
131 0.34
132 0.3
133 0.29
134 0.28
135 0.33
136 0.36
137 0.43
138 0.42
139 0.47
140 0.54
141 0.54
142 0.56
143 0.57
144 0.55
145 0.54
146 0.52
147 0.47
148 0.43
149 0.44
150 0.4
151 0.32
152 0.27
153 0.18
154 0.15
155 0.14
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.21
179 0.23
180 0.22
181 0.21
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.18
188 0.24
189 0.28
190 0.26
191 0.27
192 0.28
193 0.28
194 0.28
195 0.24
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.13
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.18
208 0.21
209 0.22
210 0.26
211 0.27
212 0.32
213 0.39
214 0.41
215 0.47
216 0.43
217 0.41
218 0.39
219 0.43
220 0.4
221 0.3
222 0.29
223 0.22
224 0.22
225 0.21
226 0.17
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.27
237 0.29
238 0.33
239 0.35
240 0.37
241 0.36
242 0.38
243 0.38
244 0.3
245 0.29
246 0.27
247 0.24
248 0.21
249 0.17
250 0.14
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.15
259 0.18
260 0.2
261 0.23
262 0.23
263 0.25
264 0.28
265 0.26
266 0.27
267 0.27
268 0.26
269 0.22
270 0.2
271 0.18
272 0.14
273 0.13
274 0.11
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.16
288 0.15
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.04
301 0.03
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.12
328 0.15
329 0.21
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.27
334 0.27
335 0.26
336 0.24
337 0.23
338 0.31
339 0.35
340 0.38
341 0.35
342 0.37
343 0.35
344 0.39
345 0.4
346 0.36
347 0.43
348 0.42
349 0.43
350 0.44
351 0.46
352 0.41
353 0.36
354 0.3
355 0.23
356 0.23
357 0.27
358 0.3
359 0.3
360 0.3
361 0.3
362 0.3
363 0.26
364 0.26
365 0.2
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.07
373 0.06
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.09
400 0.08
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.11
410 0.13
411 0.16
412 0.15
413 0.19
414 0.21
415 0.21
416 0.22
417 0.21
418 0.17
419 0.15
420 0.15
421 0.12
422 0.1
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.12
430 0.14
431 0.13
432 0.17
433 0.17
434 0.2
435 0.27
436 0.29
437 0.36
438 0.42
439 0.45
440 0.44
441 0.45
442 0.43
443 0.39
444 0.38
445 0.34
446 0.3
447 0.26
448 0.26
449 0.26
450 0.25
451 0.22
452 0.23
453 0.17
454 0.13
455 0.17
456 0.14
457 0.13
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.12
472 0.15
473 0.18
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.19
478 0.2
479 0.19
480 0.16
481 0.12
482 0.15
483 0.15
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.14
488 0.15
489 0.17
490 0.14
491 0.14
492 0.12
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.12
512 0.11
513 0.12
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.13
521 0.11
522 0.1
523 0.08
524 0.1
525 0.13
526 0.14
527 0.18
528 0.2
529 0.27
530 0.28
531 0.35
532 0.35
533 0.34
534 0.33
535 0.33
536 0.32
537 0.29
538 0.28
539 0.22
540 0.23
541 0.24
542 0.25
543 0.21
544 0.22
545 0.17
546 0.17
547 0.17
548 0.15
549 0.12
550 0.13
551 0.12
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.11
577 0.11
578 0.15
579 0.22
580 0.28
581 0.27
582 0.26
583 0.27
584 0.24
585 0.25
586 0.24
587 0.17
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.05
595 0.05
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.13
608 0.19
609 0.27
610 0.27
611 0.3
612 0.3
613 0.31
614 0.33
615 0.31
616 0.27
617 0.26
618 0.29
619 0.3
620 0.3
621 0.31
622 0.3
623 0.28
624 0.3
625 0.27
626 0.22
627 0.21
628 0.21
629 0.21
630 0.24
631 0.26
632 0.24
633 0.21
634 0.23
635 0.21
636 0.22
637 0.22
638 0.19
639 0.19
640 0.18
641 0.17
642 0.15
643 0.15
644 0.17
645 0.19
646 0.19
647 0.18
648 0.18
649 0.21
650 0.21
651 0.21
652 0.21
653 0.17
654 0.15
655 0.13
656 0.13
657 0.09
658 0.08
659 0.08
660 0.06
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.06
667 0.05
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.1
672 0.09
673 0.11
674 0.15
675 0.17
676 0.17
677 0.17
678 0.17
679 0.18
680 0.19
681 0.19
682 0.16
683 0.16
684 0.15
685 0.16
686 0.16
687 0.17
688 0.17
689 0.17
690 0.18
691 0.2
692 0.2
693 0.19
694 0.2
695 0.15
696 0.14
697 0.14
698 0.13
699 0.09
700 0.1
701 0.09
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.06
707 0.08
708 0.16
709 0.18
710 0.19
711 0.25
712 0.26
713 0.26
714 0.27
715 0.31
716 0.27
717 0.32
718 0.35
719 0.32
720 0.31
721 0.32
722 0.31
723 0.25
724 0.23
725 0.17
726 0.15
727 0.14
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.15
732 0.13
733 0.13
734 0.11
735 0.08
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.05
740 0.06
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.08
746 0.09
747 0.1
748 0.11
749 0.13
750 0.15
751 0.16
752 0.15
753 0.19
754 0.19
755 0.21
756 0.22
757 0.24
758 0.26
759 0.28
760 0.3
761 0.26
762 0.25
763 0.25
764 0.23
765 0.19
766 0.18
767 0.15
768 0.14
769 0.13
770 0.15
771 0.16
772 0.15
773 0.14
774 0.17
775 0.18
776 0.16
777 0.16
778 0.16
779 0.17
780 0.16
781 0.16
782 0.14
783 0.19
784 0.18
785 0.18
786 0.18
787 0.15
788 0.14
789 0.14
790 0.14
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.1
795 0.11
796 0.13
797 0.15
798 0.14
799 0.15
800 0.2
801 0.22
802 0.23
803 0.22
804 0.23
805 0.22
806 0.26
807 0.27
808 0.24
809 0.24
810 0.24
811 0.22
812 0.19
813 0.18
814 0.13
815 0.12
816 0.11
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.08
821 0.08
822 0.1
823 0.09
824 0.1
825 0.11
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.08
831 0.08
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.08
836 0.08
837 0.1
838 0.1
839 0.1
840 0.11
841 0.12
842 0.16
843 0.2
844 0.23
845 0.25
846 0.3
847 0.35
848 0.42
849 0.49
850 0.52
851 0.51
852 0.51
853 0.53
854 0.51
855 0.48
856 0.5
857 0.49
858 0.45
859 0.47
860 0.45
861 0.4
862 0.37
863 0.33
864 0.26
865 0.2
866 0.18
867 0.12
868 0.14
869 0.14
870 0.16
871 0.17
872 0.15
873 0.13
874 0.13
875 0.12
876 0.1
877 0.1
878 0.09
879 0.09
880 0.09
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.08
885 0.07
886 0.07
887 0.07
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.07
892 0.08
893 0.08
894 0.08
895 0.08
896 0.08
897 0.1
898 0.1
899 0.09
900 0.08
901 0.08
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.05
906 0.06
907 0.06
908 0.06
909 0.06
910 0.06
911 0.05
912 0.05
913 0.07
914 0.11
915 0.14
916 0.18
917 0.18
918 0.2
919 0.23
920 0.23
921 0.25
922 0.24
923 0.29
924 0.27
925 0.33
926 0.34
927 0.32
928 0.33
929 0.32
930 0.29
931 0.24
932 0.25
933 0.21
934 0.17
935 0.2
936 0.2
937 0.18
938 0.22
939 0.23
940 0.22
941 0.22
942 0.26
943 0.23
944 0.28
945 0.35
946 0.34
947 0.37
948 0.38
949 0.45
950 0.43
951 0.47
952 0.44
953 0.39
954 0.38
955 0.33
956 0.3
957 0.26
958 0.3
959 0.31
960 0.3
961 0.32
962 0.37
963 0.36
964 0.36
965 0.33
966 0.3
967 0.25
968 0.24
969 0.2
970 0.15
971 0.15
972 0.14
973 0.14
974 0.11
975 0.1
976 0.09
977 0.1
978 0.09
979 0.1
980 0.14
981 0.17
982 0.22
983 0.26
984 0.27
985 0.29
986 0.32
987 0.34
988 0.34
989 0.31
990 0.29
991 0.29
992 0.29
993 0.26
994 0.24
995 0.21
996 0.15
997 0.14
998 0.13
999 0.1
1000 0.1
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.15
1005 0.17
1006 0.18
1007 0.18
1008 0.18
1009 0.15
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.12
1013 0.1
1014 0.08
1015 0.09
1016 0.08
1017 0.08
1018 0.08
1019 0.08
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.07
1023 0.07
1024 0.06
1025 0.08
1026 0.07
1027 0.07
1028 0.06
1029 0.06
1030 0.06
1031 0.07
1032 0.07
1033 0.06
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.08
1037 0.09
1038 0.11
1039 0.13
1040 0.15
1041 0.16
1042 0.17
1043 0.21
1044 0.23
1045 0.25
1046 0.28
1047 0.29
1048 0.35
1049 0.43
1050 0.45
1051 0.51
1052 0.48
1053 0.49
1054 0.45
1055 0.42
1056 0.34
1057 0.25
1058 0.22
1059 0.15
1060 0.15
1061 0.12
1062 0.12
1063 0.12
1064 0.12
1065 0.12
1066 0.11
1067 0.12
1068 0.11
1069 0.12
1070 0.14
1071 0.15
1072 0.16
1073 0.21
1074 0.22
1075 0.21
1076 0.25
1077 0.29
1078 0.36
1079 0.4
1080 0.4
1081 0.38
1082 0.4
1083 0.42
1084 0.43
1085 0.46
1086 0.46
1087 0.47
1088 0.55
1089 0.57
1090 0.6
1091 0.58