Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HMQ6

Protein Details
Accession A0A420HMQ6    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-346RVRIKDGGKTPSKKKKTRIAELVKDKIRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-337IKDGGKTPSKKKKTRIA
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001737  KsgA/Erm  
IPR020596  rRNA_Ade_Mease_Trfase_CS  
IPR020598  rRNA_Ade_methylase_Trfase_N  
IPR011530  rRNA_adenine_dimethylase  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0052909  F:18S rRNA (adenine(1779)-N(6)/adenine(1780)-N(6))-dimethyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00398  RrnaAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01131  RRNA_A_DIMETH  
PS51689  SAM_RNA_A_N6_MT  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MGKIKQNKRNNASASSTPYSKTGKAVNNTFKFNTNVGQHILKNPGVAEAIVSKAYLRPSDTVLEVGPGTGNLTMRILEKANKVIAVELDPRMAAEVTKRVQGKPEQNRLEILLGDVIKMDTLPRFDVCISNTPYQISSPLVFKLLSLPNPPRVSVLMFQREFALRLIARPGDPLYCRLSVNVQFWSKVTHIMKVGKNNFKPPPQVESSVVRIEPKMGSERPGMSWDEWDGLLRICFVRKNRTMRANWLGTKEVLALVERNYRVWCAMNHIAIDETILEEDKDVIDETNMHDEDEWNGFMEIDDPVDDVPEFFKEEQNRVRIKDGGKTPSKKKKTRIAELVKDKIRRVLETTDLTDKRPGKCDENDFLRLLCEFNKEGIHFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.53
4 0.45
5 0.45
6 0.43
7 0.38
8 0.36
9 0.36
10 0.39
11 0.45
12 0.53
13 0.59
14 0.6
15 0.64
16 0.62
17 0.58
18 0.53
19 0.47
20 0.44
21 0.36
22 0.35
23 0.33
24 0.35
25 0.33
26 0.35
27 0.38
28 0.32
29 0.3
30 0.27
31 0.24
32 0.21
33 0.19
34 0.15
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.12
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.15
52 0.14
53 0.11
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.17
65 0.19
66 0.22
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.15
83 0.16
84 0.21
85 0.23
86 0.23
87 0.28
88 0.35
89 0.43
90 0.47
91 0.56
92 0.56
93 0.55
94 0.55
95 0.52
96 0.45
97 0.35
98 0.25
99 0.18
100 0.14
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.07
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.14
114 0.15
115 0.21
116 0.25
117 0.26
118 0.26
119 0.25
120 0.25
121 0.23
122 0.22
123 0.17
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.16
131 0.17
132 0.18
133 0.21
134 0.23
135 0.29
136 0.3
137 0.31
138 0.26
139 0.24
140 0.25
141 0.23
142 0.27
143 0.28
144 0.27
145 0.27
146 0.27
147 0.27
148 0.25
149 0.22
150 0.19
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.21
168 0.23
169 0.21
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.18
174 0.21
175 0.2
176 0.18
177 0.2
178 0.26
179 0.29
180 0.34
181 0.41
182 0.42
183 0.43
184 0.47
185 0.48
186 0.45
187 0.47
188 0.41
189 0.39
190 0.35
191 0.36
192 0.33
193 0.31
194 0.31
195 0.29
196 0.27
197 0.22
198 0.19
199 0.18
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.13
204 0.16
205 0.17
206 0.19
207 0.18
208 0.2
209 0.2
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.11
223 0.14
224 0.22
225 0.29
226 0.36
227 0.43
228 0.51
229 0.52
230 0.56
231 0.61
232 0.58
233 0.54
234 0.5
235 0.45
236 0.36
237 0.34
238 0.27
239 0.2
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.16
252 0.18
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.18
259 0.18
260 0.1
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.18
281 0.17
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.11
298 0.11
299 0.17
300 0.19
301 0.27
302 0.33
303 0.4
304 0.43
305 0.43
306 0.46
307 0.47
308 0.45
309 0.47
310 0.48
311 0.49
312 0.54
313 0.59
314 0.65
315 0.71
316 0.79
317 0.79
318 0.81
319 0.82
320 0.83
321 0.85
322 0.86
323 0.85
324 0.85
325 0.87
326 0.87
327 0.84
328 0.79
329 0.69
330 0.65
331 0.58
332 0.5
333 0.45
334 0.41
335 0.41
336 0.41
337 0.44
338 0.47
339 0.45
340 0.44
341 0.48
342 0.48
343 0.46
344 0.48
345 0.49
346 0.46
347 0.53
348 0.58
349 0.59
350 0.61
351 0.61
352 0.55
353 0.5
354 0.45
355 0.37
356 0.31
357 0.25
358 0.23
359 0.2
360 0.21
361 0.25