Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HVJ6

Protein Details
Accession A0A420HVJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-275NLKTSKLVGPRPKRGIKKRTYGDSSHydrophilic
298-319GDGISRKRPKKSSQGHGFQNAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-269GPRPKRGIKKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, cyto 4, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MPFDHPQTPESPRNPTSVEITKQLTSPNSYSVLTPAHSINGSVSSNVVDMSLCEASNKRKRENNDVGDQKCKRTHIEVGRLNLEDLHLDVGKKYKLCHTPTPTSTPDLTQDLFALYNLESISKSVARTNPDGSKGVRLRKTYKNHIKDHQLSGNFDSVKREIDDQNTLFNMMITPQEDWKDEYSGLEKIEHGIPDPIKQLMDNAFKMSRGIIPKTSWNSSVLGDLAPSSISLEQHRPNQPKPKLQQSNIGNLKTSKLVGPRPKRGIKKRTYGDSSFEGYGEGYVDDEDQEVEFAIGDGDGISRKRPKKSSQGHGFQNAPTRHNSYGPGMVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.45
4 0.43
5 0.43
6 0.4
7 0.42
8 0.39
9 0.38
10 0.39
11 0.35
12 0.33
13 0.31
14 0.29
15 0.28
16 0.27
17 0.27
18 0.25
19 0.24
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.15
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.06
36 0.06
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.14
42 0.24
43 0.32
44 0.37
45 0.4
46 0.46
47 0.52
48 0.61
49 0.68
50 0.66
51 0.68
52 0.71
53 0.67
54 0.7
55 0.67
56 0.63
57 0.56
58 0.51
59 0.45
60 0.41
61 0.47
62 0.46
63 0.54
64 0.53
65 0.54
66 0.55
67 0.52
68 0.47
69 0.38
70 0.3
71 0.2
72 0.15
73 0.12
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.23
82 0.3
83 0.35
84 0.44
85 0.47
86 0.53
87 0.56
88 0.61
89 0.55
90 0.51
91 0.46
92 0.38
93 0.33
94 0.28
95 0.25
96 0.19
97 0.17
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.12
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.25
116 0.26
117 0.28
118 0.29
119 0.26
120 0.32
121 0.33
122 0.38
123 0.39
124 0.4
125 0.43
126 0.5
127 0.56
128 0.59
129 0.65
130 0.66
131 0.66
132 0.68
133 0.71
134 0.67
135 0.65
136 0.6
137 0.51
138 0.44
139 0.4
140 0.39
141 0.3
142 0.25
143 0.23
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.14
149 0.16
150 0.2
151 0.18
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.1
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.14
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.19
200 0.26
201 0.3
202 0.31
203 0.28
204 0.26
205 0.25
206 0.23
207 0.23
208 0.17
209 0.12
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.15
220 0.19
221 0.27
222 0.35
223 0.39
224 0.45
225 0.55
226 0.59
227 0.63
228 0.66
229 0.7
230 0.71
231 0.67
232 0.7
233 0.63
234 0.67
235 0.64
236 0.59
237 0.5
238 0.41
239 0.4
240 0.33
241 0.3
242 0.22
243 0.21
244 0.29
245 0.37
246 0.45
247 0.53
248 0.61
249 0.68
250 0.76
251 0.8
252 0.83
253 0.81
254 0.82
255 0.81
256 0.81
257 0.8
258 0.72
259 0.67
260 0.61
261 0.56
262 0.46
263 0.38
264 0.29
265 0.22
266 0.19
267 0.15
268 0.1
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.08
287 0.08
288 0.14
289 0.23
290 0.29
291 0.38
292 0.45
293 0.53
294 0.61
295 0.71
296 0.77
297 0.79
298 0.82
299 0.81
300 0.81
301 0.76
302 0.69
303 0.68
304 0.6
305 0.52
306 0.49
307 0.46
308 0.41
309 0.41
310 0.41
311 0.36
312 0.38