Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HPY6

Protein Details
Accession A0A420HPY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-129EVDEKMDRRRKARREARLKAELEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-123RRRKARREAR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGAAAPTAYGVPEKKDDDDDDERFQDPENEVGLFAGGAYDKDDDEADRIYQEVDEKMDRRRKARREARLKAELEEYERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRNKQALRQRFYAIPDSVIASARDSGELGTTVADDEPVGGDMSDGTMTNFADIGAARDKVLQVKLDQASLGTDSVVAGNATSIDPKGYLTSLAKSQINEGEAQVGDIKRVRVLLESVIRTNPKHAPGWIAAARLEELAGKTVAARNVIARGCEFCPKNEDVWLENIRLNNNYNAKIIAANAIKNNDHSVRLWIEAMNLESEPRAKKKVIRHALDHIPQSVMLWKEAVNLEENSDDARLLLAKATEIIPLSVELWLALAHLETSENAQKVLNKARKAIPTSHEIWIAAARLQEQMGNANKVNVMKRAVQALAKESAMLKREEWITEAEKCEKEGAILTCANIIRETLGWGLDEDDDRKEIWMEDAKASIHRGQYGTARAIYAYALQVFVNSRKLWLAAADLEKNYGQKEALWKLLEKSVEACPQSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEAENQQSEQARELLKTARQEAPTDRVWMKSVAFERQLGNSEGALDLVNQALQLFPGAPKLWMIKGQIYEGEGNLPRAREAYSTGTKACPKSVPIWLLYSRLEERAGNLVKARGVLDRARLAVVGSPELWTESIRVERRANNIGQAKNLMAQALQQVTNSGLLYSEAIWHLENRTHRKPRALEAIKKVDNDPILFVTIARIFWGERRLEKAQNWFEKAIILDSDLGDTWAWYYKFLLQHGTEEKRADVLSKFILNEPRHGEFWQCVAKDPKNAGLSLEEILQLVIGKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.22
44 0.21
45 0.2
46 0.18
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.13
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.27
58 0.29
59 0.34
60 0.4
61 0.4
62 0.4
63 0.4
64 0.38
65 0.35
66 0.33
67 0.3
68 0.24
69 0.23
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.1
76 0.09
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.19
97 0.21
98 0.3
99 0.38
100 0.42
101 0.48
102 0.57
103 0.62
104 0.69
105 0.76
106 0.78
107 0.81
108 0.85
109 0.87
110 0.86
111 0.78
112 0.7
113 0.65
114 0.56
115 0.51
116 0.48
117 0.42
118 0.42
119 0.46
120 0.45
121 0.43
122 0.43
123 0.46
124 0.47
125 0.47
126 0.41
127 0.41
128 0.49
129 0.49
130 0.55
131 0.47
132 0.4
133 0.38
134 0.35
135 0.29
136 0.2
137 0.2
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.2
155 0.27
156 0.34
157 0.42
158 0.48
159 0.57
160 0.63
161 0.7
162 0.73
163 0.78
164 0.77
165 0.73
166 0.69
167 0.63
168 0.6
169 0.56
170 0.46
171 0.36
172 0.3
173 0.28
174 0.25
175 0.23
176 0.19
177 0.13
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.16
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.17
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.19
250 0.2
251 0.19
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.11
269 0.13
270 0.16
271 0.19
272 0.21
273 0.22
274 0.24
275 0.26
276 0.25
277 0.28
278 0.27
279 0.25
280 0.25
281 0.24
282 0.25
283 0.24
284 0.3
285 0.28
286 0.24
287 0.21
288 0.2
289 0.2
290 0.16
291 0.14
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.22
310 0.22
311 0.19
312 0.23
313 0.25
314 0.25
315 0.25
316 0.26
317 0.2
318 0.26
319 0.27
320 0.23
321 0.23
322 0.24
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.21
327 0.23
328 0.23
329 0.22
330 0.2
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.21
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.1
358 0.12
359 0.14
360 0.16
361 0.17
362 0.23
363 0.31
364 0.42
365 0.49
366 0.5
367 0.51
368 0.55
369 0.6
370 0.59
371 0.52
372 0.42
373 0.32
374 0.28
375 0.25
376 0.22
377 0.15
378 0.11
379 0.1
380 0.09
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.05
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.14
426 0.23
427 0.26
428 0.25
429 0.28
430 0.33
431 0.36
432 0.38
433 0.39
434 0.33
435 0.32
436 0.35
437 0.33
438 0.28
439 0.24
440 0.21
441 0.18
442 0.16
443 0.12
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.11
451 0.12
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.17
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.18
463 0.18
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.16
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.11
475 0.12
476 0.14
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.2
484 0.19
485 0.19
486 0.19
487 0.16
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.11
498 0.1
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.09
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.14
521 0.14
522 0.15
523 0.17
524 0.17
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.17
530 0.19
531 0.19
532 0.16
533 0.16
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.08
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.08
544 0.1
545 0.12
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.11
553 0.1
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.15
558 0.15
559 0.15
560 0.14
561 0.12
562 0.09
563 0.09
564 0.15
565 0.16
566 0.2
567 0.21
568 0.21
569 0.22
570 0.25
571 0.24
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.22
576 0.21
577 0.2
578 0.18
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.13
583 0.08
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.14
594 0.15
595 0.12
596 0.21
597 0.23
598 0.26
599 0.29
600 0.29
601 0.28
602 0.27
603 0.26
604 0.2
605 0.22
606 0.19
607 0.26
608 0.3
609 0.38
610 0.42
611 0.44
612 0.43
613 0.42
614 0.39
615 0.3
616 0.26
617 0.18
618 0.16
619 0.13
620 0.11
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.09
627 0.1
628 0.11
629 0.12
630 0.17
631 0.18
632 0.18
633 0.18
634 0.19
635 0.18
636 0.18
637 0.19
638 0.17
639 0.19
640 0.21
641 0.24
642 0.27
643 0.27
644 0.3
645 0.31
646 0.33
647 0.31
648 0.34
649 0.3
650 0.26
651 0.27
652 0.26
653 0.22
654 0.23
655 0.24
656 0.24
657 0.25
658 0.25
659 0.25
660 0.25
661 0.28
662 0.24
663 0.22
664 0.17
665 0.16
666 0.14
667 0.13
668 0.11
669 0.08
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.13
685 0.14
686 0.17
687 0.19
688 0.2
689 0.21
690 0.22
691 0.22
692 0.22
693 0.21
694 0.17
695 0.2
696 0.17
697 0.19
698 0.19
699 0.18
700 0.16
701 0.16
702 0.17
703 0.13
704 0.16
705 0.2
706 0.24
707 0.26
708 0.27
709 0.31
710 0.35
711 0.35
712 0.34
713 0.3
714 0.27
715 0.29
716 0.34
717 0.33
718 0.3
719 0.34
720 0.32
721 0.33
722 0.31
723 0.31
724 0.26
725 0.25
726 0.25
727 0.2
728 0.2
729 0.26
730 0.27
731 0.24
732 0.24
733 0.24
734 0.23
735 0.24
736 0.23
737 0.16
738 0.18
739 0.19
740 0.22
741 0.23
742 0.24
743 0.23
744 0.22
745 0.2
746 0.19
747 0.18
748 0.15
749 0.12
750 0.12
751 0.12
752 0.13
753 0.13
754 0.1
755 0.1
756 0.11
757 0.19
758 0.21
759 0.26
760 0.29
761 0.34
762 0.39
763 0.44
764 0.43
765 0.43
766 0.48
767 0.45
768 0.43
769 0.4
770 0.35
771 0.32
772 0.31
773 0.23
774 0.15
775 0.15
776 0.17
777 0.18
778 0.17
779 0.14
780 0.15
781 0.15
782 0.17
783 0.16
784 0.11
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.09
789 0.1
790 0.09
791 0.1
792 0.11
793 0.12
794 0.14
795 0.18
796 0.26
797 0.32
798 0.42
799 0.5
800 0.54
801 0.61
802 0.64
803 0.67
804 0.7
805 0.71
806 0.69
807 0.69
808 0.75
809 0.7
810 0.68
811 0.61
812 0.55
813 0.49
814 0.41
815 0.34
816 0.26
817 0.24
818 0.21
819 0.2
820 0.19
821 0.17
822 0.16
823 0.14
824 0.13
825 0.12
826 0.16
827 0.22
828 0.23
829 0.24
830 0.31
831 0.36
832 0.41
833 0.46
834 0.52
835 0.56
836 0.6
837 0.62
838 0.56
839 0.51
840 0.47
841 0.43
842 0.35
843 0.26
844 0.19
845 0.15
846 0.15
847 0.16
848 0.13
849 0.13
850 0.11
851 0.1
852 0.1
853 0.15
854 0.14
855 0.14
856 0.16
857 0.2
858 0.25
859 0.26
860 0.32
861 0.27
862 0.34
863 0.42
864 0.45
865 0.44
866 0.41
867 0.4
868 0.36
869 0.35
870 0.31
871 0.24
872 0.22
873 0.23
874 0.24
875 0.25
876 0.28
877 0.36
878 0.35
879 0.4
880 0.42
881 0.42
882 0.41
883 0.4
884 0.38
885 0.32
886 0.37
887 0.38
888 0.32
889 0.34
890 0.41
891 0.44
892 0.48
893 0.5
894 0.51
895 0.46
896 0.46
897 0.41
898 0.36
899 0.33
900 0.27
901 0.25
902 0.17
903 0.14
904 0.14
905 0.12
906 0.1