Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HCK4

Protein Details
Accession A0A420HCK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-343SEEEVKKSLARRRRRKREKKPATTGNELFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-335KKSLARRRRRKREKKP
Subcellular Location(s) cyto 8.5, nucl 7, cyto_mito 6, E.R. 3, mito 2.5, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYLKYEQSNTFGVINSGTSNVVWCEDRAGASQVTKSGYAIVPANEEVFCWDIKKGELLSRWKDIDCKFQVTAISQSKADRDIFAVGYEDGSIRVWDSKTSTTIVKFNGHRSEITVLRFDCSGVRLASGSKDTDIILWDLIDEVGLFKFRGHKDQITGLEFFKPITNYEDYTGEDGQTLVVSEDDIGATERFLITTSKDALIKLWDIETRHCIETHVAQSNGECWSLGISLDGAGCITGGNDGELNIWSIDCKGLLQYTLRLETPPENHIIRSRGTLHCQGRSKIRYISFHPSQNYFAVHGNEKSVEIWRIRSEEEVKKSLARRRRRKREKKPATTGNELFDSSLDQDIPDETSEDLLSVNITELFMSYLVVRAGGRVRSIDWIKNRSSKTIQILVATTNNQLEVYNILTKDKSGKKTNEMPDYSRSLSVELPGHRADIRALSLSSDDRMLASTSNGDLKIWNIRTRNCIRTFDCGYALCCSFLPGDKILVVGTKTGDLELFDVVSAAMIERVQAHEGAIWALQVHPNGQSLISGSADKTAKFWKFNVIQEPILGSRRTTPRFSLSQDRILKVSDDILSLRFSPDARLIAIALLDSTVKVFFVDSLKIFLNLYGHKLPVLNMDISFDSKLIVTCSADKNIRLWGLDFGDCRKAFFAHQDSILQVAFVRNNHDGNGHNFFSSSKDKMIKYWDGDKFEHIQKLTNHHGEIWALAVSNSGKFLVSASHDKSIRLWEETDEQIFLEEEKEKELEELYESALATSLDKDLETDEAELGTVSKQTSGTLTAGERIAEALDISTADLEIVREWESAKISNPNIAPPSRNLIFMALGGISAEEHVLRVLQKVRAAELDDALLVLPFASVLALFKFLEIFAVRSMDIQLTCRILLFMLKTHHHQIIASKIIKASLQTIRTNLRRVLTQQKSEIGFNLAALKVISLKANEREVRDFIDDRPDEEKSGQRKRGFISVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.25
4 0.18
5 0.15
6 0.14
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.2
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.24
24 0.23
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.22
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.15
43 0.19
44 0.19
45 0.24
46 0.31
47 0.38
48 0.42
49 0.48
50 0.5
51 0.47
52 0.51
53 0.48
54 0.51
55 0.47
56 0.47
57 0.41
58 0.4
59 0.41
60 0.37
61 0.43
62 0.39
63 0.37
64 0.33
65 0.34
66 0.34
67 0.36
68 0.34
69 0.26
70 0.22
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.12
84 0.12
85 0.14
86 0.18
87 0.2
88 0.22
89 0.24
90 0.27
91 0.26
92 0.3
93 0.31
94 0.35
95 0.36
96 0.42
97 0.46
98 0.44
99 0.42
100 0.41
101 0.43
102 0.39
103 0.38
104 0.36
105 0.29
106 0.29
107 0.28
108 0.25
109 0.21
110 0.19
111 0.19
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.16
138 0.18
139 0.25
140 0.29
141 0.33
142 0.35
143 0.42
144 0.47
145 0.42
146 0.42
147 0.36
148 0.34
149 0.3
150 0.27
151 0.23
152 0.19
153 0.17
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.22
160 0.24
161 0.23
162 0.19
163 0.16
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.12
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.2
191 0.19
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.2
197 0.23
198 0.24
199 0.24
200 0.24
201 0.23
202 0.22
203 0.26
204 0.3
205 0.31
206 0.27
207 0.26
208 0.26
209 0.27
210 0.26
211 0.2
212 0.14
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.12
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.21
253 0.23
254 0.22
255 0.23
256 0.22
257 0.23
258 0.27
259 0.27
260 0.24
261 0.24
262 0.27
263 0.26
264 0.3
265 0.38
266 0.38
267 0.43
268 0.46
269 0.46
270 0.5
271 0.5
272 0.49
273 0.46
274 0.47
275 0.44
276 0.45
277 0.51
278 0.47
279 0.49
280 0.48
281 0.44
282 0.42
283 0.39
284 0.35
285 0.28
286 0.26
287 0.23
288 0.23
289 0.21
290 0.2
291 0.19
292 0.18
293 0.17
294 0.16
295 0.17
296 0.15
297 0.17
298 0.18
299 0.19
300 0.19
301 0.22
302 0.27
303 0.3
304 0.34
305 0.35
306 0.33
307 0.36
308 0.41
309 0.45
310 0.47
311 0.5
312 0.57
313 0.65
314 0.76
315 0.83
316 0.89
317 0.93
318 0.96
319 0.96
320 0.96
321 0.95
322 0.93
323 0.88
324 0.85
325 0.76
326 0.67
327 0.57
328 0.46
329 0.36
330 0.26
331 0.2
332 0.13
333 0.12
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.16
369 0.18
370 0.22
371 0.25
372 0.29
373 0.32
374 0.38
375 0.39
376 0.38
377 0.38
378 0.38
379 0.37
380 0.39
381 0.37
382 0.31
383 0.3
384 0.27
385 0.26
386 0.22
387 0.18
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.1
399 0.11
400 0.18
401 0.23
402 0.27
403 0.32
404 0.35
405 0.4
406 0.5
407 0.56
408 0.57
409 0.53
410 0.5
411 0.46
412 0.47
413 0.43
414 0.35
415 0.28
416 0.21
417 0.19
418 0.18
419 0.18
420 0.15
421 0.17
422 0.16
423 0.17
424 0.15
425 0.16
426 0.14
427 0.11
428 0.11
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.14
450 0.15
451 0.19
452 0.2
453 0.22
454 0.3
455 0.35
456 0.41
457 0.38
458 0.41
459 0.39
460 0.43
461 0.44
462 0.38
463 0.34
464 0.27
465 0.25
466 0.22
467 0.2
468 0.14
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.17
530 0.19
531 0.2
532 0.21
533 0.25
534 0.28
535 0.32
536 0.36
537 0.34
538 0.31
539 0.3
540 0.31
541 0.25
542 0.23
543 0.2
544 0.14
545 0.17
546 0.23
547 0.26
548 0.27
549 0.27
550 0.3
551 0.33
552 0.36
553 0.39
554 0.36
555 0.42
556 0.44
557 0.43
558 0.39
559 0.36
560 0.33
561 0.24
562 0.22
563 0.14
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.1
569 0.11
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.07
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.07
592 0.09
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.13
600 0.11
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.14
605 0.15
606 0.14
607 0.15
608 0.17
609 0.13
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.14
615 0.11
616 0.09
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.12
623 0.14
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.19
628 0.21
629 0.22
630 0.18
631 0.17
632 0.16
633 0.17
634 0.18
635 0.18
636 0.17
637 0.24
638 0.23
639 0.23
640 0.21
641 0.19
642 0.18
643 0.24
644 0.27
645 0.22
646 0.23
647 0.23
648 0.22
649 0.23
650 0.22
651 0.15
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.1
656 0.15
657 0.15
658 0.16
659 0.17
660 0.18
661 0.19
662 0.21
663 0.26
664 0.23
665 0.2
666 0.2
667 0.2
668 0.23
669 0.25
670 0.22
671 0.21
672 0.26
673 0.26
674 0.29
675 0.35
676 0.35
677 0.35
678 0.42
679 0.43
680 0.43
681 0.43
682 0.44
683 0.42
684 0.42
685 0.42
686 0.33
687 0.34
688 0.31
689 0.37
690 0.41
691 0.39
692 0.35
693 0.31
694 0.32
695 0.27
696 0.24
697 0.19
698 0.12
699 0.08
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.12
711 0.17
712 0.2
713 0.26
714 0.26
715 0.27
716 0.28
717 0.32
718 0.3
719 0.27
720 0.25
721 0.21
722 0.25
723 0.27
724 0.26
725 0.2
726 0.17
727 0.16
728 0.15
729 0.13
730 0.11
731 0.11
732 0.1
733 0.12
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.13
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.1
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.1
746 0.1
747 0.08
748 0.08
749 0.08
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.08
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.09
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.1
769 0.12
770 0.12
771 0.13
772 0.13
773 0.15
774 0.15
775 0.15
776 0.13
777 0.11
778 0.11
779 0.08
780 0.08
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.04
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.07
792 0.08
793 0.08
794 0.09
795 0.11
796 0.13
797 0.14
798 0.17
799 0.22
800 0.21
801 0.27
802 0.27
803 0.3
804 0.32
805 0.33
806 0.33
807 0.29
808 0.36
809 0.31
810 0.32
811 0.27
812 0.24
813 0.23
814 0.2
815 0.19
816 0.11
817 0.1
818 0.08
819 0.07
820 0.06
821 0.05
822 0.05
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.06
827 0.07
828 0.11
829 0.16
830 0.18
831 0.21
832 0.22
833 0.24
834 0.25
835 0.28
836 0.25
837 0.21
838 0.19
839 0.16
840 0.15
841 0.13
842 0.1
843 0.07
844 0.05
845 0.04
846 0.03
847 0.03
848 0.03
849 0.03
850 0.04
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.08
857 0.11
858 0.11
859 0.12
860 0.11
861 0.13
862 0.13
863 0.13
864 0.15
865 0.15
866 0.15
867 0.16
868 0.17
869 0.18
870 0.18
871 0.17
872 0.16
873 0.14
874 0.16
875 0.15
876 0.17
877 0.21
878 0.24
879 0.29
880 0.34
881 0.36
882 0.34
883 0.33
884 0.33
885 0.35
886 0.41
887 0.38
888 0.35
889 0.33
890 0.33
891 0.33
892 0.29
893 0.28
894 0.26
895 0.3
896 0.31
897 0.35
898 0.43
899 0.47
900 0.51
901 0.49
902 0.44
903 0.43
904 0.46
905 0.53
906 0.52
907 0.54
908 0.53
909 0.55
910 0.55
911 0.52
912 0.48
913 0.41
914 0.33
915 0.27
916 0.27
917 0.21
918 0.19
919 0.17
920 0.16
921 0.13
922 0.15
923 0.16
924 0.14
925 0.19
926 0.24
927 0.33
928 0.36
929 0.39
930 0.43
931 0.43
932 0.45
933 0.45
934 0.42
935 0.35
936 0.42
937 0.38
938 0.36
939 0.38
940 0.35
941 0.32
942 0.34
943 0.4
944 0.4
945 0.5
946 0.55
947 0.55
948 0.58
949 0.59