Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HTP1

Protein Details
Accession A0A420HTP1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MASDKKKAKRLAHDLLKRRAAGHydrophilic
88-114KIPVVENKKTKQNKKDLKKGSKKDSLSHydrophilic
353-372NSVKSEKKTKEPFSRIPKDIHydrophilic
396-424LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGHIDVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-12KKAKRLA
95-110KKTKQNKKDLKKGSKK
182-186KRKKA
402-414KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASDKKKAKRLAHDLLKRRAAGETPKPQLSSQLLELIETFFDEIGYTKSYKALKADREKYSDGTKDKLPNSSSLATFFHEWQISKSTKIPVVENKKTKQNKKDLKKGSKKDSLSSEGASSSKSSSSRTYGESEDDSSDVSTNEGSSSQIPLNITIVNTMKRKISTSSSSSDSDSSSDSSAPKRKKAKIIARVNDVSKSASGSSSSSDNTTDTISSDSSTSSSDSEIIVEDTDSSSSGSSSSNTGPQDTVGLPKKKALLEKSDSSSDSDSSNSTSSGDSSNSSKSNDSSDSSDSSDSSSSVPKKAGKKVLTSTTKKSLKKDIKDKVTLKNSNTIRVKSKETPVKAETPTTSAVNSVKSEKKTKEPFSRIPKDIKVDRRLSSNAYVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGHIDVDGKNGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.83
4 0.73
5 0.64
6 0.57
7 0.51
8 0.51
9 0.51
10 0.51
11 0.51
12 0.55
13 0.55
14 0.53
15 0.54
16 0.49
17 0.43
18 0.36
19 0.35
20 0.31
21 0.29
22 0.3
23 0.24
24 0.19
25 0.15
26 0.13
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.17
36 0.2
37 0.22
38 0.29
39 0.34
40 0.42
41 0.51
42 0.59
43 0.61
44 0.64
45 0.65
46 0.61
47 0.6
48 0.58
49 0.5
50 0.46
51 0.45
52 0.47
53 0.47
54 0.5
55 0.45
56 0.41
57 0.43
58 0.43
59 0.37
60 0.32
61 0.31
62 0.27
63 0.27
64 0.25
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.22
69 0.27
70 0.26
71 0.26
72 0.29
73 0.29
74 0.3
75 0.32
76 0.34
77 0.38
78 0.47
79 0.54
80 0.58
81 0.58
82 0.65
83 0.72
84 0.77
85 0.76
86 0.77
87 0.78
88 0.8
89 0.86
90 0.87
91 0.89
92 0.9
93 0.9
94 0.88
95 0.87
96 0.79
97 0.74
98 0.7
99 0.65
100 0.56
101 0.48
102 0.4
103 0.32
104 0.3
105 0.25
106 0.19
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.17
112 0.21
113 0.22
114 0.24
115 0.26
116 0.24
117 0.26
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.14
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.21
150 0.24
151 0.25
152 0.28
153 0.3
154 0.31
155 0.32
156 0.31
157 0.29
158 0.24
159 0.2
160 0.17
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.16
166 0.23
167 0.26
168 0.32
169 0.39
170 0.44
171 0.51
172 0.59
173 0.64
174 0.67
175 0.74
176 0.72
177 0.7
178 0.68
179 0.61
180 0.52
181 0.43
182 0.34
183 0.23
184 0.19
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.14
234 0.12
235 0.17
236 0.21
237 0.24
238 0.23
239 0.25
240 0.29
241 0.29
242 0.34
243 0.31
244 0.31
245 0.34
246 0.37
247 0.39
248 0.38
249 0.36
250 0.33
251 0.31
252 0.24
253 0.19
254 0.16
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.13
283 0.12
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.21
288 0.26
289 0.32
290 0.39
291 0.47
292 0.44
293 0.48
294 0.52
295 0.58
296 0.62
297 0.6
298 0.59
299 0.6
300 0.65
301 0.63
302 0.62
303 0.63
304 0.63
305 0.68
306 0.72
307 0.72
308 0.72
309 0.78
310 0.78
311 0.77
312 0.78
313 0.74
314 0.66
315 0.65
316 0.58
317 0.58
318 0.58
319 0.53
320 0.5
321 0.48
322 0.53
323 0.5
324 0.58
325 0.57
326 0.55
327 0.58
328 0.55
329 0.58
330 0.52
331 0.51
332 0.43
333 0.37
334 0.36
335 0.3
336 0.26
337 0.22
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.24
342 0.28
343 0.32
344 0.4
345 0.41
346 0.49
347 0.56
348 0.64
349 0.68
350 0.71
351 0.75
352 0.78
353 0.84
354 0.79
355 0.77
356 0.73
357 0.7
358 0.7
359 0.7
360 0.69
361 0.66
362 0.63
363 0.62
364 0.59
365 0.55
366 0.51
367 0.48
368 0.44
369 0.41
370 0.39
371 0.34
372 0.33
373 0.34
374 0.3
375 0.25
376 0.21
377 0.2
378 0.21
379 0.22
380 0.21
381 0.18
382 0.19
383 0.24
384 0.29
385 0.26
386 0.27
387 0.3
388 0.31
389 0.36
390 0.4
391 0.42
392 0.48
393 0.59
394 0.68
395 0.74
396 0.82
397 0.83
398 0.9
399 0.91
400 0.9
401 0.9
402 0.88
403 0.88
404 0.88
405 0.83
406 0.73
407 0.63
408 0.6
409 0.5
410 0.46
411 0.38
412 0.28
413 0.25